| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,155,772 | Δ3 bp | intergenic (+18723/‑3730) | unknown → / → unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1155772 | 1155774 | 3 | 46 [0] | [0] 46 | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1155771 | 0 (0.000) | 46 (0.530) | 41/426 | 0.8 | 100% | intergenic (+18722/‑3733) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| ? | 1 | 1155775 = | 0 (0.000) | intergenic (+18726/‑3729) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC | |||||
TTGAAGCGGGATTGGATGAACAATGGAAACATTTAATGCGGACATTTCAGTGGTAAAAAACAGTTAAAAAAACGACCGCACTTTTTGTATAAATAATAAAGGAAATGCAATGTTAGATAACGATTTATTACATTTAACCCATGAACAGCAGCAACTTGCCGTGGAAAAAATTCAGGAATTAATGGCGCAAGGCGTGGGCAGCGGCGAGGCTATCGCTTTAGTGGCAAAAAAGTTACGGGAACAAAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTATGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTAAATGGTTT > 1/1155531‑1156021 | ccattgaagcgggattggatgaacaatggaaacatttaatgcggacatttcagtggtaaaaaacagttaaaaaaacgaccgcactttttgtataaataataaaggaaatgcaatgttagataacgatttattacatttaacccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCggg > 1:257933‑M2/245‑251 (MQ=255) 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1:427521‑M2/102‑1 (MQ=255) gggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGAc < 1:609506‑M2/195‑1 (MQ=255) ggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAgg > 1:330388‑M2/40‑251 (MQ=255) gctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACaaa < 1:350320‑M2/117‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |