| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1664046–1669567 | 1669567 | 1–5522 | 24 [23] | [22] 24 | unknown–unknown | unknown,unknown,unknown,unknown |
CCATTTTGGTAAAATTCTGGATAATTCATCTTGGAAAAATGAAGATTTAGCCAATAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGT > 1/1663797‑1664162 | ccATTTTGGTAAAATTCTGGATAATTCATCTTGGAAAAATGAAGATTTAGCCAATAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTc < 1:545072/249‑1 (MQ=255) ggTAAAATTCTGGATAATTCATCTTGGAAAAATGAAGATTTAGCCAATAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCgg > 1:234137/1‑251 (MQ=255) aTTCTGGATAATTCATCTTGGAAAAATGAAGATTTAGCCAATAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGt > 1:17355/1‑251 (MQ=255) aTTCTGGATAATTCATCTTGGAAAAATGAAGATTTAGCCAATAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGt > 1:43647/1‑251 (MQ=255) tCATCTTGGAAAAATGAAGATTTAGCCAATAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTCATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTac < 1:604141/251‑1 (MQ=255) tCTTGGAAAAATGAAGATTTAGCCAATAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTaccac < 1:273142/251‑1 (MQ=255) ttGGAAAAATGAAGATTTAGCCAATAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCg < 1:413828/251‑1 (MQ=255) aGCCAATAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTTCTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAatat > 1:344267/1‑251 (MQ=255) aGCCAATAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAatat > 1:774158/1‑251 (MQ=255) ccAATAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTc < 1:496465/251‑1 (MQ=255) aaTAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCtt > 1:598549/1‑251 (MQ=255) aTAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAgg < 1:392481/217‑1 (MQ=255) aTAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAgg > 1:390346/1‑217 (MQ=255) aaaGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTtga < 1:21676/251‑1 (MQ=255) tttCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTcc < 1:534700/251‑1 (MQ=255) tcCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTc < 1:498171/230‑1 (MQ=255) tcCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTc < 1:506339/251‑1 (MQ=255) ccccTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATcc < 1:504774/218‑1 (MQ=255) tCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGct > 1:843916/1‑249 (MQ=255) aTTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAgg < 1:665143/156‑1 (MQ=255) ttCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGGGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGt > 1:639496/1‑251 (MQ=255) cccATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAggt > 1:585927/1‑149 (MQ=255) cATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAgg < 1:96050/146‑1 (MQ=40) cATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGAACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTc > 1:641339/1‑223 (MQ=25) | CCATTTTGGTAAAATTCTGGATAATTCATCTTGGAAAAATGAAGATTTAGCCAATAAAGTGCGGTAAAAAATTTCAGTGTTTTTTTAAAATCAAAATCCCCTTCCTGACCCCAAATTCCAATCCCATTTATTCCACTAAAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGT > 1/1663797‑1664162 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |