| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,780,597 | +GTGCAGAC | intergenic (+60639/‑14245) | unknown → / → unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Leu‑CAA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1780597 | 0 (0.000) | 93 (1.100) +GTGCAGAC |
61/414 | 0.2 | 100% | intergenic (+60639/‑14245) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Leu‑CAA |
| ? | 1 | 1780598 = | 0 (0.000) | intergenic (+60640/‑14244) | unknown/unknown | tRNA‑Asn‑GTT/tRNA‑Leu‑CAA | |||||
AATCACACCCTGTACGGCACGGGTACGACCGGCAATCTGATTCATCGGGAAACGGGCTTAACGGTAAACAACCTATTGAGCGGTCCGATGGGCGGCGATCAGCAACTAGGCGGATTGATCGCCGAAAACAAAATTGATTTAATGATTTTCTTTTGGGATCCGATGAATGCCGTGCCCCATGATCCGGACGTCAAAGCCTTAATGCGTATCGCAACGGTGTGGAATATTCCGGTAGCCATGAATATCGCCATTTTTAGTCACTTCTCCGTTATTTAATGAAACTGCCGACATTCGCATTCCAGATTACCAAGGCTATTTAACCGAGCGACTGAAATAATGAACGGAAATAACGCAACACTTGCACTCGTTTTAAATATTCTGAATTTTGTCCTGGGTGGCTTCGCCGTCACCTTGGCATGGCTTTTGGCCACCGTGATGAGCGCCGTTTTGATCGTCACCTTGCCATACACCCGCAGCTGTTGGGAAATCACCAAAATG > 1/1780348‑1780845 | cctgtacggcacgggtacgaccggcaatctgattcatcgggaaacgggcttaacggtaaacaacctattgagcggtccgatgggcggcgatcagcaactaggcggattgatcgccgaaaacaaaattgatttaatgattttcttttgggatccgatgaatgccgtgccccatgatccggacgtcaaagccttaatgcgtatcgcaacggtgtggaatattccggtagccatgaatatcgccagtgcagact < 1:835059‑M2/1‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |