| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,461,807 | Δ68 bp | intergenic (‑17179/‑179890) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1461807 | 1461874 | 68 | 87 [0] | [0] 88 | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1461806 | 0 (0.000) | 74 (0.990) | 54/366 | 0.2 | 100% | intergenic (‑17178/‑179958) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC |
| ? | 1 | 1461875 = | 0 (0.000) | intergenic (‑17247/‑179889) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Gly‑GCC | |||||
GGTTTGCGGGAAAAGAAAAGCACCTTATTTTTATAAGGTGCTTAGTTTAGTTGGTGTCAGAGTTCAGATGTAACAAAGCGCCTATTTCAAAACAGATCCACCCGAAGATGGCTGCGGGTATTGGCTAACCAATTCCAGGTGCCGGTAGTGTTTCAACACACAGCCACCTGAAGGTGGCTGCGGGAAAAAGTGTGGGTGTGCATACAAGGACGCAGGCGTTTCAACACACAGCCACCTGAAGGTGGCTGCTCCCTATATGAAAAAACAAGAAAAATCAGTAGATTACTTCCTGTATTTCGCTAACTTATTTCAAAATAGAGAGTGGGATAAGTATAACGGGCATGTCGTCGTTATACAAATGAATTAACTGTTCCAAATTGTTAAAGAAAATCAGGATCGCTAGCCTGACGGGAATTTGATGAGAACTAGGAGTTAGCGAGCTAGACAACAAGCACATCTTTAAACACATCCACCGCCGGTTTCGCCCCGTGG > 1/1461626‑1462117 | aagcaccccgactaataacggggttcagtctatatattttgcggaggaagggcaaggagttttgtgttggtttgcgggaaaagaaaagcaccttatttttataaggtgcttagtttagttggtgtcagagttcagatgtaacaaagcgcctatttcaaaacagatccacccgaagatggctgcgggtattggctaaccaattccaggtgccggtagtgtttcaacacacagccacctgaaggtggctgcTc < 1:781676‑M2/2‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |