| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,387,521 | +GCGCCT | intergenic (+227941/+33416) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1387521 | 0 (0.000) | 85 (0.990) +GCGCCT |
53/418 | 0.4 | 100% | intergenic (+227941/+33416) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| ? | 1 | 1387522 = | 0 (0.000) | intergenic (+227942/+33415) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT | |||||
ACCCAAGGTGCGTGGCATTCGTGGCAGCTCGCCAACGATTTGGCGGAAAAAATCACCGCACTTTTGACGCCCTGGCAGGATGACTGGTTGGCAATTTCCATTCCGCACAGTTTATGGATAACCCTATGTTTAACCTTTCTTTTTTTAGTGGCGCTCTATGTTATTTATAAACCGCCCAAACCGATAACATCCACTTTAGCATTGTCAAGGCAGCACCGCTTTAAAGGATTTCATTTTAATCCGGAACTAAGTTTACCGTTACGAAAAAGCGCTTATTGCGTGGGCGGTGGGCTGATTGCCCTGTGTTGCCTGACGTTAATTTCTCAGTCTATTTCACGTCCGAACTGGCAATTGGAAACCTTGGACGTGGGGCAAGGGTTGGCAACTTTAATCGTGAAAGACGGCAAAGGCGTGCTTTACGATACCGGCCCGAGTTGGAAGGGCGGCAGTATGGCACAATTGGAAATTCTGCCTTATTTACAACGGCAAGGCATT > 1/1387275‑1387769 | ggtgcgtggtattcgtggcagctcgccaacgatttggcggaaaaaatcaccgcacttttgacgccctggcaggatgactggttggcaatttccattccgcacagtttatggataaccctatgtttaacctttctttttttagtggcgctctatgttatttataaaccgcccaaaccgataacatccactttagcattgtcaaggcagcaccgctttaaaggatttcattttaatccggaacgcgcctTAAg > 1:577438‑M2/248‑251 (MQ=255) tggtattcgtggcagctcgccaacgatttggcggaaaaaatcaccgcacttttgacgccctggcaggatgactggttggcaatttccattccgcacagtttatggataaccctatgtttaacctttctttttttagtggcgctctatgttatttataaaccgcccaaaccgataacatccactttagcattgtcaaggcagcaccgctttaaaggatttcattttaatccggaacgcgcctTAAGTTTAcc < 1:7579‑M2/10‑1 (MQ=255) cgatttggcggaaaaaatcaccgcacttttgacgccctggcaggatgactggttggcaatttccattccgcacagtttatggataaccctatgtttaacctttctttttttagtggcgctctatgttatttataaaccgcccaaaccgataacatccactttagcattgtcaaggcagcaccgctttaaaggatttcattttaatccggaacgcgcctTAAGTTTACCGTTACGAAAAAGCGCTTATTGCg < 1:45431‑M2/33‑1 (MQ=255) tcaccgcacttttgacgccctggcaggatgactggttggcaatttccattccgcacagtttatggataaccctatgtttaacctttctttttttagtggcgctctatgttatttataaaccgcccaaaccgataacatccactttagcattgtcaaggcagcaccgctttaaaggatttcattttaatccggaacgcgcctTAAGTTTACCGTTACGAAAAAGCGCTTATTGCGTGGGCGGTGGGCTGAtt < 1:393598‑M2/50‑1 (MQ=255) 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ACCCAAGGTGCGTGGCATTCGTGGCAGCTCGCCAACGATTTGGCGGAAAAAATCACCGCACTTTTGACGCCCTGGCAGGATGACTGGTTGGCAATTTCCATTCCGCACAGTTTATGGATAACCCTATGTTTAACCTTTCTTTTTTTAGTGGCGCTCTATGTTATTTATAAACCGCCCAAACCGATAACATCCACTTTAGCATTGTCAAGGCAGCACCGCTTTAAAGGATTTCATTTTAATCCGGAACTAAGTTTACCGTTACGAAAAAGCGCTTATTGCGTGGGCGGTGGGCTGATTGCCCTGTGTTGCCTGACGTTAATTTCTCAGTCTATTTCACGTCCGAACTGGCAATTGGAAACCTTGGACGTGGGGCAAGGGTTGGCAACTTTAATCGTGAAAGACGGCAAAGGCGTGCTTTACGATACCGGCCCGAGTTGGAAGGGCGGCAGTATGGCACAATTGGAAATTCTGCCTTATTTACAACGGCAAGGCATT > 1/1387275‑1387769 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |