| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1269640 = | 80 (0.910) | 51 (0.580) | 29/426 | 1.7 | 56.3% | intergenic (+110060/+151297) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| ? | 1 | = 1269998 | 0 (0.000) | intergenic (+110418/+150939) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT | |||||
ATTAACACCTGTATCCGTCTTAACAAAATTAGATAGTTGTTGCTGAATTTTTATATCAATATTATCGGCTTTAATCGTCGGCAATATGTCAAAAATTACACCGCTTGAGCGGTATTCAATGGACTGCACCGGACGACCATTTCTATCATAAGTAACCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGAATTCGGTAATTTATACCAATCCGGAACAATTAAATTCGATACTGTAATTTCACGGGTTGAAACCACCTTAACAGGGCTAAATTTTGATAAATCACACTTGCGGGCTATATCAATGCCAATTTTACGAAGACGACC > 1/1269756‑1270134 | attAACACCTGTATCCGTCTTAACAAAATTAGATAGTTGTTGCTGAATTTTTATATCAATATTATCGGCTTTAATCGTCGGCAATATGTCAAAAATTACACCGCTTGAGCGGTATTCAATGGACTGCACCGGACGACCATTTCTATCATAAGTAACCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaac < 1:379028‑M2/247‑5 (MQ=255) cacCTGTATCCGTCTTAACAAAATTAGATAGTTGTTGCTGAATTTTTATATCAATATTATCGGCTTTAATCGTCGGCAATATGTCAAAAATTACACCGCTTGAGCGGTATTCAATGGACTGCACCGGACGACCATTTCTATCATAAGTAACCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcg < 1:701868‑M2/250‑13 (MQ=255) 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attatCGGCTTTAATCGTCGGCAATATGTCAAAAATTACACCGCTTGAGCGGTATTCAATGGACTGCACCGGACGACCATTTCTATCATAAGTAACCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttt < 1:652310‑M2/251‑69 (MQ=255) gCTTTAATCGTCGGCAATATGTCAAAAATTACACCGCTTGAGCGGTATTCAATGGACTGCACCGGACGACCATTTCTATCATAAGTAACCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacactt < 1:853130‑M2/251‑76 (MQ=255) gCTTTAATCGTCGGCAATATGTCAAAAATTACACCGCTTGAGCGGTATTCAATGGACTGCACCGGACGACCATTTCTATCATAAGTAACCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacactt < 1:447482‑M2/251‑76 (MQ=255) tAATCGTCGGCAATATGTCAAAAATTACACCGCTTGAGCGGTATTCAATGGACTGCACCGGACGACCATTTCTATCATAAGTAACCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacacttacat > 1:680278‑M2/1‑172 (MQ=255) tcgGCAATATGTCAAAAATTACACCGCTTGAGCGGTATTCAATGGACTGCACCGGACGACCATTTCTATCATAAGTAACCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacacttacatctgtga > 1:723115‑M2/1‑166 (MQ=255) cgGCAATATGTCAAAAATTACACCGCTTGAGCGGTATTCAATGGACAGCACCGGACGACCATTTCTATCATAAGTAACCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacacttacatctgtgac > 1:519034‑M2/1‑165 (MQ=255) 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gTATTCAATGGACTGCACCGGACGACCATTTCTATCATAAGTAACCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacacttacat < 1:787441‑M2/211‑80 (MQ=255) aTTCAATGGACTGCACCGGACGACCATTTCTATCATAAGTAACCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacacttacatctgtgacaatgtcgcgttttataagtgtcggagattgattaa < 1:184977‑M2/251‑122 (MQ=255) aaTGGACTGCACCGGACGACCATTTCTATCATAAGTAACCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacacttacatctgtgacaatgtcgcgttttataagtgtcggagattgattaacacc > 1:759716‑M2/1‑126 (MQ=255) 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1:679541‑M2/223‑133 (MQ=255) aCCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacacttacatctgtgacaatgtcgcgttttataagtgtcggagattgattaacacc < 1:624054‑M2/214‑126 (MQ=255) aGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacacttacatctgtgacaatgtcgcgttttataagtgtcggagattgattaacacctgtatacggtc > 1:349201‑M2/1‑85 (MQ=255) aGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacacttacatctgtgacaatgtcgcgttttataagtgtcggagattgattaacac < 1:658527‑M2/199‑125 (MQ=255) aGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacacttacatc > 1:42576‑M2/1‑75 (MQ=255) cATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacacttacatctgtgacaatgtcgcgttttataagtgtcggagattgattaacacctgtatac > 1:312702‑M2/1‑70 (MQ=255) cATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGaaacctgtttcgccttcagttatcttgttttcggccagtccacccaaaactatcacatcgccattttttacacttacatct > 1:466744‑M2/1‑70 (MQ=255) | ATTAACACCTGTATCCGTCTTAACAAAATTAGATAGTTGTTGCTGAATTTTTATATCAATATTATCGGCTTTAATCGTCGGCAATATGTCAAAAATTACACCGCTTGAGCGGTATTCAATGGACTGCACCGGACGACCATTTCTATCATAAGTAACCGAGCCAAGAATAGGTACATCAGAGCCAACGCTAAAATTGCCCTTTGAGCCTGATTTAACGCGAATTGTCGGAGAGCTTACAACGTGAATTCGGTAATTTATACCAATCCGGAACAATTAAATTCGATACTGTAATTTCACGGGTTGAAACCACCTTAACAGGGCTAAATTTTGATAAATCACACTTGCGGGCTATATCAATGCCAATTTTACGAAGACGACC > 1/1269756‑1270134 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |