| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1195937 | 0 (0.000) | 45 (0.760) +TCGGTTCGCAACATGAACATCAATCCATTAAAAATATTATTCAGTTGGTGGATCAGGGGACGCGTTACGG |
36/290 | 0.4 | 97.1% | intergenic (+36357/+225000) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| ? | 1 | 1205574 = | 4 (0.050) | intergenic (+45994/+215363) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT | |||||
TGTAAAATTCTATATGCCCCCGACAATCAGGAGGACGCGGAAGAATATTCAAAAGTGCTGGGCAATCGTACTGTAGATAAATTAAGCCATAGTCGCGGAAAAACGTCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCGTTGCTTTTACCACAGGAATTTAGACTAATCGGAGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAACAACAGTAAACCGATACTGTGTAATAAGGCGGTGTACTACAACGATCCTTATGCCGACCATGGCGGTAACGGGCGTAGGTAAAGATATGGCGCGGGATCAGCGCTATTTTTCCTTGGCAACCCGTATCGCGGCGGAAATGGGTGCGCATATCATCAAAACCTATTATGTGGATAAAGGCTTTGAACGTGTAACTGCCGGTTGCCCGGTACCGATTGTCATTGCCGGCGGTAAAAAACTCCCGGAACAAGAGGCGCTGGATATGTGCTACAAAGCCATTGTTCAAGGGGCTTCCGGT > 1/1205328‑1205820 | aatgtgcacccgcggtattttgcgtagcgtcgtgccgccctccacccgcaaacctgttgtgttgcgttcatccggtgccaattcgattttgactgaattatccaacgaagcggtggcggtgtgtgtggaagatgctttgcgcctgaatgtatccgccatggcggcacaggtgtatatcggttcgcaacatgaacatcaatccattaaaaatattattcagttggtggatcaggggacgcgttacggTATg > 1:582414‑M2/247‑250 (MQ=255)aatgtgcacccgcggtattttgcgtagcgtcgtgccgccctccacccgcaaacctgttgtgttgcgttcatccggtgccaattcgattttgactgaattatccaacgaagcggtggcggtgtgtgtggaagatgctttgcgcctgaatgtatccgccatggcggcacaggtgtatatcggttcgcaacatgaacatcaatccattaaaaatattattcagttggtggatcaggggacgcgttacggTATg > 1:90317‑M2/247‑250 (MQ=255) tgcacccgcggtattttgcgtagcgtcgtgccgccctccacccgcaaacctgttgtgttgcgttcatccggtgccaattcgattttgactgaattatccaacgaagcggtggcggtgtgtgtggaagatgctttgcgcctgaatgtatccgccatggcggcacaggtgtatatcggttcgcaacatgaacatcaatccattaaaaatattattcagttggtggatcaggggacgcgttacggTATGCCGa < 1:158530‑M2/8‑1 (MQ=255) aTTCTATATGCACCCGACAACCAGGAGGACGCAGAAGAATATTCTAAAGTGCTAGGTAATCGCACTGTAAATAAATTAAGCCATAGTCGAGGTAAAACATCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCATTACTTTTACCGCAGGAGTTTAGATTAATCGGCGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAATAACAGCAAACCGATTATATGTAATAAGGCAGTGTATTACAACGATCCTTAttttataga > 1:420535/1‑243 (MQ=255) cccgcggtattttgcgtagcgtcgtgccgccctccacccgcaaacctgttgtgttgcgttcatccggtgccaattcgattttgactgaattatccaacgaagcggtggcggtgtgtgtggaagatgctttgcgcctgaatgtatccgccatggcggcacaggtgtatatcggttcgcaacatgaacatcaatccattaaaaatattattcagttggtggatcaggggacgcgttacggt > 1:625298‑M2/239‑239 (MQ=255) attttgcgtagcgtcgtgccgccctccacccgcaaacctgttgtgttgcgttcatccggtgccaattcgattttgactgaattatccaacgaagcggtggcggtgtgtgtggaagatgctttgcgcctgaatgtatccgccatggcggcacaggtgtatatcggttcgcaacatgaacatcaatccattaaaaatattattcagttggtggatcaggggacgcgttacggTATGCCGACCATGGCGGTaa > 1:464680‑M2/231‑250 (MQ=255) ttgcgtagcgtcgtgccgccctccacccgcaaacctgttgtgttgcgttcatccggtgccaattcgattttgactgaattatccaacgaagcggtggcggtgtgtgtggaagatgctttgcgcctgaatgtatccgccatggcggcacaggtgtatatcggttcgcaacatgaacatcaatccattaaaaatattattcagttggtggatcaggggacgcgttacggTATGCCGACCATGGCGGTAACggg < 1:241552‑M2/24‑1 (MQ=255) ttgcgtagcgtcgtgccgccctccacccgcaaacctgttgtgttgcgttcatccggtgccaattcgattttgactgaattatccaacgaagcggtggcggtgtgtgtggaagatgctttgcgcctgaatgtatccgccatggcggcacaggtgtatatcggttcgcaacatgaacatcaatccattaaaaatattattcagttggtggatcaggggacgcgttacggTATGCCGACCATGGCGGTAACggg < 1:578158‑M2/24‑1 (MQ=255) tgccgccctccacccgcaaacctgttgtgttgcgttcatccggtgccaattcgattttgactgaattatccaacgaagcggtggcggtgtgtgtggaagatgctttgcgcctgaatgtatccgccatggcggcacaggtgtatatcggttcgcaacatgaacatcaatccattaaaaatattattcagttggtggatcaggggacgcgttacggTATGCCGACCATGGCGGTAACGGGCGTAGGTAAAGat < 1:648282‑M2/37‑1 (MQ=255) ccgcaaacctgttgtgttgcgttcatccggtgccaattcgattttgactgaattatccaacgaagcggtggcggtgtgtgtggaagatgctttgcgcctgaatgtatccgccatggcggcacaggtgtatatcggttcgcaacatgaacatcaatccattaaaaatattattcagttggtggatcaggggacgcgttacggTATGc > 1:76843‑M2/202‑206 (MQ=255) 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1:484531‑M2/125‑217 (MQ=255) ggaagatgctttgcgcctgaatgtatccgccatggcggcacaggtgtatatcggttcgcaacatgaacatcaatccattaaaaatattattcagttggtggatcaggggacgcgttacggTATGcc > 1:161671‑M2/121‑126 (MQ=255) atgctttgctcctgaatgtatccgccatggcggcacaggtgtatatcggttcgcaacatgaacatcaatccattaaaaatattattcagttggtggatcaggggacgcgttacggTATGCCGACCATGGCGGTAACGGGCGTAGGTAAAGATATGGCGCGGGATCAGCGCTATTTTTCCTTGGCAACCCGTATCGCGGCGGAAATGGGTGCGCATATCATCAAAACCTATTATGTGGATAAAGGCTTTGaa < 1:735000‑M2/136‑1 (MQ=255) atgctttgcgcctgaatgtatccgccatggcggcacaggtgtatatcggttcgcaacatgaacatcaatccattaaaaatattattcagttggtggatcaggggacgcgttacggTATGCCGACCATGGCGGTAACGGGCGTAGGTAAAGATATGGCGCGGGATCAGCGCTATTTTTCCTTGGCAACCCGTATCGCGGCGGAAATGGGTGCGCATATCATCAAAACCTATTATGTGGATAAAGGCTTTGaa < 1:265159‑M2/136‑1 (MQ=255) ctttgcgcctgaatgtatccgccatggcggcacaggtgtatatcggttcgcaacatgaacatcaatccattaaaaatattattcagttggtggatcaggggacgcgttacggTATGCCGACCATGGCGGTAACGGGCGTAGGTAAAGATATGGCGCGGGATCAGCGCTATTTTTCCTTGGCAACCCGTATCGCGGCGGAAATGGGTGCGCATatcatc < 1:646638‑M2/106‑1 (MQ=255) 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acggTATGCCGACCATGGCGGTAACGGGCGTAGGTAAAGATATGGCGCGGGATCAGCGCTATTTTTCCTTGGCAACCCGTATCGCGGCGGAAATGGGTGCGCATATCATCAAAACCTATTATGTGGATAAAGGCTTTGAACGTGTAACTGCCGGTTGCCCGGTACCGATTGTCATTGCCGGCGGTAAAAAACTCCCGGAACAAGAGGCGCTGGATATGTGCTACAAAGCCATTGATCAAGGGGCTTCcggg > 1:710553‑M2/5‑250 (MQ=255) acggTATGCCGACCATGGCGGTAACGGGCGTAGGTAAAGATATGGCGCGGGATCAGCGCTATTTTTCCTTGGCAACCCGTATCGCGGCGGAAATGGGTGCGCATATCATCAAAACCTATTATGTGGATAAAGGCTTTGAACGTGTAACTGCCGGTTGCCCGGTACCGATTGTCATTGCCGGCGGTAAAAAACTCCCGGAACAAGAGGCGCTGGATATGTGCTACAAAGCCATTGATCAAGGGGCTTCcggg > 1:39037‑M2/5‑250 (MQ=255) cggTATGCCGACCATGGCGGTAACGGGCGTAGGTAAAGATATGGAGCGGGATCAGCGCTATTTTTCCTTGGCAACCCGTATCGCGGCGGAAATGGGTGCGCATATCATCAAAACCTATTATGTGGATAAAGGCTTTGaa > 1:320929‑M2/4‑139 (MQ=255) ggTATGCCGACCATGGCGGTAACGGGCGTAGGTAAAGATATGGCGCGGGATCAGCGCTATTTTTCCTTGGCAACCCGTATCGCGGCGGAAATGGGTGCGCATATCATCAAAACCTATTATGTGGATAAAGGCTTTGAACGTGTAAc > 1:490355‑M2/3‑146 (MQ=255) | TGTAAAATTCTATATGCCCCCGACAATCAGGAGGACGCGGAAGAATATTCAAAAGTGCTGGGCAATCGTACTGTAGATAAATTAAGCCATAGTCGCGGAAAAACGTCCAGTCACAGTATTACCGACCATGGGCGACCGTTGCTTTTACCACAGGAATTTAGACTAATCGGAGAATTTAAAGAAGTGGTGATGTTAAACAACAGTAAACCGATACTGTGTAATAAGGCGGTGTACTACAACGATCCTTATGCCGACCATGGCGGTAACGGGCGTAGGTAAAGATATGGCGCGGGATCAGCGCTATTTTTCCTTGGCAACCCGTATCGCGGCGGAAATGGGTGCGCATATCATCAAAACCTATTATGTGGATAAAGGCTTTGAACGTGTAACTGCCGGTTGCCCGGTACCGATTGTCATTGCCGGCGGTAAAAAACTCCCGGAACAAGAGGCGCTGGATATGTGCTACAAAGCCATTGTTCAAGGGGCTTCCGGT > 1/1205328‑1205820 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |