| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 1,031,019 | (GATGAATT)1→2 | intergenic (‑24563/‑4200) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1031009 | 0 (0.000) | 97 (1.140) +TTGATGAA |
62/394 | 0.1 | 100% | intergenic (‑24553/‑4210) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 1031010 = | 0 (0.000) | intergenic (‑24554/‑4209) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
ATAAAATAGGGTAGGATATTTTTAAATTGAGATATTAGATGGAAATATCAAATTCCCATTTACATAAACTTCAAAGTTTTTAAGAGCTAGTGGATTTTAAGAGGTATAGATCGGGCTTGTTGGATCCACCCGTGCCAGTACCGTTTGGCAAAATTATGAAGAGCAGATTAAACAACTTAAAAATGGAGGTTGTTTTAAAATTTTTACAGGCAAGAATTCTGGTTCAAAAGCTAAAAACCGTGCAAGACTTGATGAATTATTAAATTTCGTGCGATAAGGGAGTACCGTTGTAGTAAAAAATTAGATCGCCTTGGTCGTAGTACTAGTCAAGTTCTAAATCTTTATGAAGAACTCGAAAGCCGTGGTATTGGACTAAAAAGTCTTGATGGGATAATCGATACTGAAAAGCGTACAGATCTATTTGATAAAGTGAAGTTTATGTTTATGGCTGCATTAGCAGAAATGGAACGTAATTTAATTCGAGAATGAACTGTGGAG > 1/1030762‑1031259 | gggtaggatatttttaaattgagatattagatggaaatatcaaattcccatttacataaacttcaaagtttttaagaactagtggattttaagaggtatagatcgggcttgttggatccacccgtgccagtaccgtttggcaaaattatgaagagcagattaaacaacttaaaaatggaggttgttttaaaatttttacaggcaagaattctggttcaaaagctaaaaaccgtgcaagacttgatgaattg > 1:261436‑M2/249‑251 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1:542678‑M2/44‑251 (MQ=255) gctaaaaaccgtgcaagacttgatgaaTTGATGAATTATTAAATTTCGTGCGATAAGGGAGTACCGTTGTAGTAAAAAATTAGATCGCCTTGGTCGTAGTACTAGTCAAGTTCTAAATCTTTATGAAGAACTCGAAAGCCGTGGTATTGGAc < 1:51350‑M2/125‑1 (MQ=255) gctaaaaaccgtgcaagacttgatgaaTTGATGAATTATTAAATTTCGTGCGATAAGGGAGTACCGTTGTAGTAAAAAATTAGATCGCCTTGGTCGTAGTACTAGTCAAGTTCTAAATCTTTATGAAGAACTCGAAAGCCGTGGTATTGGACTAAAAAGTCTTGATGGGATAATCGATACTGAAAAGCGTACAGATCTATTTGATAAAGTGAAgtttatg < 1:701595‑M2/193‑1 (MQ=255) gctaaaaaccgtgcaagacttgatgaaTTGATGAATTATTAAATTTCGTGCGATAAGGGAGTACCGTTGTAGTAAAAAATTAGATCGCCTTGGTCGTAGTACTAGTCAAGTTCTAAATCTTTATGAAGAACTCGAAAGCCGTGGTATTGGACTAAAAAGTCTTGATGGGATAATCGATACTGAAAAGCGTACAGATCTATTTGATAAAGTGAAGTTTATGTTTATGGCTGCATTAGCAGAAATGGAACGta > 1:612365‑M2/28‑251 (MQ=255) aaaccgtgcaagacttgatgaaTTGATGAATTATTAAATTTCGTGCGATAAGGGAGTACCGTTGTAGTAAAAAATTAGATCGCCTTGGTCGTAGTACTAGTCAAGTTCTAAATCTTTATGAAGAACTCGAAAGCCGTGGTATTGGACTAAAAAGTCTTGATGGGATAATCGATACTGAAAAGCGTACAGATCTATTTGATAAAGTGAAgtttatgtt > 1:887368‑M2/23‑217 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |