| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 860,360 | (ATT)2→3 | intergenic (‑10703/‑61858) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 860352 | 1 (0.010) | 56 (0.640) +TTA |
41/408 | 0.8 | 98.2% | intergenic (‑10695/‑61866) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| ? | 1 | 860353 = | 1 (0.010) | intergenic (‑10696/‑61865) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG | |||||
TAGAAAAGAACCAGCTCTGACATTTTCTGCCATTAAATAGCCTTGTAATCCCTGAATACCATTTTTAGTCGTAGCCTCTCTTAGGTCATTGTCGACTAGTGCACTGTCTTCAGGGACAGAAATCTCATTTAAAATATAATCATCTGCCTGTAATAAATGACCTTTGCTTACGTCATTCTTTAACTCGGCAGTTAAAATTAGCTTTTCCGGTTTTTTCTCAGCTTCCGGAACCTGCTGATTATTTATTATTGTTTGTTGATTTTCAGTATTGTCAAATGTTGGCATAAACATAATGCCACCAATGCCAACCGCTAGCGTAAGCACTGAAATGATCAAGAGCGTTCTGTAATTCATTTTTTACCCTTAATTAAATTTTAACAAAGTAAAGTCTCCGCTCAATCAAAATTAATTTGATAGAGCCATGTTTATCATAAAGCCAAGGCTTATTGCTACGCCATAAGGCAATCCGTTTTCT > 1/860111‑860585 | aaaagaaccagctctgacattttctgccattaaatagccttgtaatccctgaataccatttttagtcgtagcctctcttaggtcattgtcgaccagtgcactgtcttcagggacagaaatctcatttaaaatgtaatcatctgcctgtaataaatgacctttgctcacgtcattctttaattcggcagttaaaattagcttttccggctttttctcagtttccggaaccgactgattatttaTTATTAttg < 1:133137‑M2/9‑1 (MQ=255)aaaagaaccagctctgacattttctgccattaaatagccttgtaatccctgaataccatttttagtcgtagcctctcttaggtcattgtcgaccagtgcactgtcttcagggacagaaatctcatttaaaatgtaatcatctgcctgtaataaatgacctttgctcacgtcattctttaattcggcagttaaaattagcttttccggctttttctcagtttccggaaccgactgattatttaTTATTAttg < 1:732558‑M2/9‑1 (MQ=255) gaaccagctctgacattttctgccattaaatagccttgtaatccctgaataccatttttagtcgtagcctctcttaggtcattgtcgaccagtgcactgtcttcagggacagaaatctcatttaaaatgtaatcatctgcctgtaataaatgacctttgctcacgtcattctttaattcggcagttaaaattagcttttccggctttttctcagtttccggaaccgactgattatttaTTATTAttgtttg > 1:828673‑M2/239‑251 (MQ=255) gctctgacattttctgccattaaatagccttgtaatccctgaataccatttttagtcgtagcctctcttaggtcattgtcgaccagtgcactgtcttcagggacagaaatctcatttaaaatgtaatcatctgcctgtaataaatgacctttgctcacgtcattctttaattcggcagttaaaattagcttttccggctttttctcagtttccggaaccgactgattatttaTTATTATTGTTTGTTGAtt > 1:376894‑M2/233‑251 (MQ=255) 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1:471454‑M2/63‑1 (MQ=255) gtcttcagggacagaaatctcatttaaaatgtaatcatctgcctgtaataaatgacctttgctcacgtcattctttaattcggcagttaaaattagctcttccggctttttctcagtttccggaaccgactgattatttaTTATTATTGTTTGTTGATTTTCAGTATTGTCAAATGCTGGCATAAACATAATGCCACCAATGCCAACCGCTAGCGTAAGCACTGAAATGATCAAGAGCGTTCTGTAATTCa > 1:212368‑M2/141‑251 (MQ=255) tcttcagggacagaaatctcatttaaaatgtaatcatctgcctgtaataaatgacctttgctcacgtcattctttaattcggcagttaaaattagcttttccggctttttctcagtttccggaaccgactgattatttaTTATTATTGTTTGTTGATTTTCAGTATTGTCAAATGCTGGCATAAACATAATGCCACCAATGCCAACCGCTAGCGTAAGCACTGAAATGATCAAGAGCGTTCTGTAATTCAt < 1:497831‑M2/112‑1 (MQ=255) cttcagggacagaaatctcatttaaaatgtaatcatctgcctgcaataaatgacctttgctcacgtcattctttaattcggcagttaaaattagcttttccggctttttctcagtttccggaaccgactgattatttaTTATTATTGTTTGTTGATTTTCAGTATTGTCAAATGCTGGCATAAACATAATGCCACCAATGCCAACCGCTAGCGTAAGCACTGAAATGATCAAGAGCGTTCTGTAATTCAtt > 1:232269‑M2/139‑251 (MQ=255) 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1:248567‑M2/233‑1 (MQ=255) gactgattatttaTTATTATTGTTTGTTGATTTTCAGTATTGTCAAATGCTGGCATAAACATAATGCCACCAATGCCAACCGCTAGCGTAAGCACTGAAATGATCAAGAGCGTTCTGTAATTCATTTTTTACCCTTAATTAAATTTTAACAAAGTAAAGTTTCCGCTCAATCAAAATTAATTTGATAGAGCCATGTTTATCATAAAGCCAAGGCTTATTGCTACGCCATaa > 1:524854‑M2/14‑231 (MQ=255) actgattatttaTTATTATTGTTTGTTGATTTTCAGTATTGTCAAATGCTGGCATAAAc > 1:467667‑M2/13‑59 (MQ=255) gattatttaTTATTATTGTTTGTTGATTTTCAGTATTGTCAAATGCTGGCATAAACATAATGCCACCAATGCCAACCGCTAGCGTAAGCACTGAAATGATCAagag > 1:595066‑M2/10‑106 (MQ=255) | TAGAAAAGAACCAGCTCTGACATTTTCTGCCATTAAATAGCCTTGTAATCCCTGAATACCATTTTTAGTCGTAGCCTCTCTTAGGTCATTGTCGACTAGTGCACTGTCTTCAGGGACAGAAATCTCATTTAAAATATAATCATCTGCCTGTAATAAATGACCTTTGCTTACGTCATTCTTTAACTCGGCAGTTAAAATTAGCTTTTCCGGTTTTTTCTCAGCTTCCGGAACCTGCTGATTATTTATTATTGTTTGTTGATTTTCAGTATTGTCAAATGTTGGCATAAACATAATGCCACCAATGCCAACCGCTAGCGTAAGCACTGAAATGATCAAGAGCGTTCTGTAATTCATTTTTTACCCTTAATTAAATTTTAACAAAGTAAAGTCTCCGCTCAATCAAAATTAATTTGATAGAGCCATGTTTATCATAAAGCCAAGGCTTATTGCTACGCCATAAGGCAATCCGTTTTCT > 1/860111‑860585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |