| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 593469 = | NA (NA) | 12 (0.140) | 7/430 | 5.7 | 17.6% | intergenic (+95916/‑105874) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 1104284 = | 56 (0.630) | intergenic (‑44731/‑27819) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTTAGGGCGTTGAGGGTTTATATAAGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAATTTAGCCACCTCACGGATACCAAAATTCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTTAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGACACCGATCAGGATCAGGAAGGCGAGTGCTAAAATTTTAAATG > 1/1104080‑1104526 | ttttAGGGCGTTGAGGGTTTATATAAGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAAtg < 1:46503/251‑1 (MQ=255) ttAGGGCGTTGAGGGTTTATATAAGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAAtgtg < 1:150356/251‑1 (MQ=255) gggTTTATATAAGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCg > 1:342099/1‑250 (MQ=255) atataAGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACtttt > 1:657698/1‑251 (MQ=255) tataAGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTg > 1:535620/1‑251 (MQ=255) aaGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGttt < 1:566179/251‑1 (MQ=255) aaGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGttt < 1:249735/251‑1 (MQ=255) aGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGttt > 1:465716/1‑250 (MQ=255) 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ttCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTAc < 1:286532/251‑1 (MQ=255) tCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCTCTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACg < 1:471639/251‑1 (MQ=17) cTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGt < 1:518045/250‑1 (MQ=255) ttttCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCGCTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTAt < 1:429464/251‑1 (MQ=18) ttttCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTAt < 1:248147/251‑1 (MQ=255) ccAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTgag < 1:157598/251‑1 (MQ=255) 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atgaAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGc < 1:197995/251‑1 (MQ=255) atgaAGTTCAGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGc < 1:470504/251‑1 (MQ=255) gttcaGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGt > 1:51218/5‑251 (MQ=255) ccACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAatat < 1:519324/251‑1 (MQ=255) aCCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTG‑TTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACg > 1:245913/1‑251 (MQ=255) ccAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAATTTCTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGcaca > 1:895989/1‑251 (MQ=255) 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tttctaaaCGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGa > 1:257214/7‑251 (MQ=255) ctaaaCGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGacac < 1:402053/248‑1 (MQ=255) ctaaaCGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGacac < 1:178204/248‑1 (MQ=255) 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ttGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGACACCgatcaggat < 1:864776/251‑1 (MQ=255) gATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGACACCgatcaggat > 1:231593/1‑249 (MQ=255) aaGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGACACCGAtcaggatcagga < 1:535420/251‑1 (MQ=255) gagTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGaaa > 1:400343/1‑165 (MQ=255) gagTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAata < 1:537894/185‑1 (MQ=255) gagTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGACACCgatcaggat < 1:521471/244‑1 (MQ=255) gagTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGACACCgatcaggat < 1:854152/244‑1 (MQ=255) gagTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGACACCGAtcaggatcagga < 1:712309/249‑1 (MQ=255) gagTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGACACCGATCAGGATCAGGAAg > 1:289098/1‑251 (MQ=255) gagTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGACACCGATCAGGATCAGGAAg > 1:166408/1‑251 (MQ=255) 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cTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAgg > 1:103225/1‑214 (MQ=255) cAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCa > 1:234922/1‑110 (MQ=255) cAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGACACCGATCAGGATCAGGAAGGCGAGTGCTAAAATTTTAAATg > 1:5423/1‑251 (MQ=255) | TTTTAGGGCGTTGAGGGTTTATATAAGGGGATTTTACGCCATTAAGCCCTCTTTCACGAAAGGCTTTTCCAATAAATGACTTGAGAACGAGAAATCTGATGAAATTTAGCCACCTCACGGATACCAAAATTCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTTAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTTGAAATTTAATGTGTTTTTCGACCGCACTTTTGTTTCTCTAAATTTTAGCGCCCAAGCGTTTACGCATTTGGGTATTGAGAATTTCCACAAATACGGAAAAGCCCATAGCGGAGTAAATATACGCTTTCGGCACATGGATGCTGAAGCTCTCGATAATTAAGGTGACACCGATCAGGATCAGGAAGGCGAGTGCTAAAATTTTAAATG > 1/1104080‑1104526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |