| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 593468 | 33 (0.380) | 54 (0.630) +GGACAC |
33/406 | 1.2 | 48.9% | intergenic (+95915/‑105875) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 706004 = | 82 (0.930) | intergenic (+1715/‑9078) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Pro‑TGG | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
TTAACACTACTTCTGCTGGCTAAATGTTGGATCACTCGGACTTTTCCTGTCAGATCAGGCGATTGCCAGCTTTTATAGCTAATTTCGTTCCCGTTCAAAATTAATTCGCCATCTTTTTGCACGGTAACGGAGAATGCTTAGAAAGGTTAATCCTAGAGCTAATGCTATTTTTTTCATTTTAATGTCCTTAAATTATGCAAATTTTACCGGATTTTTTGACCGCACTTTGCTCTGCACCCCAAAACCTGGACACCTAATTTGAGGTGCAGATTATGTCTTACTCTTACCAATTTCGTTTAAAAACTATCAAACAGGTCACCGAGCAGGATTTTGGTATCCGTGAGGTGGCGAAACTTCATAAAATCTCCCATTCGCTCGTCATTTATTGGCTAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTAATGGCGTAAAATCCCCTTATATAAACCCTCAACGCCCTAAAATAGTGAAGCCAAAGATGAAAAAGAAAGCGATTGAAATC > 1/705757‑706253 | gatcaaggcaacaccatcgtggtcattgagcataatttagacgtgattaaaaccgccgactggattgtagatctcggccctgaaggcggcagcggcggcggacaaattatcgcgaccggcacaccggaacaggttgccaaaatggagggctcgcacaccgcccgcttcctcaaagagattttggcaaaaggctaaaaacgctgcattttccgaccgcactttgatctgcaccccaaaacctggacacgga > 1:765984‑M2/248‑250 (MQ=255) atcaaggcaacaccatcgtggtcattgagcataatttagacgtgattaaaaccgccgactggattgtagatctcggccctgaaggcggcagcggcggcggacaaattatcgcgaccggcacaccggaacaggttgccaaaatggagggctcgcacaccgcccgcttcctcaaagagattttggcaaaaggctaaaaacgctgcattttccgaccgcactttgatctgcaccccaaaacctggacacggaca > 1:109894‑M2/247‑251 (MQ=255) atcaaggcaacaccatcgtggtcattgagcataatttagacgtgattaaaaccgccgactggattgtagatctcggccctgaaggcggcagcggcggcggacaaattatcgcgaccggcacaccggaacaggttgccaaaatggagggctcgcacaccgcccgcttcctcaaagagattttggcaaaaggctaaaaacgctgcattttccgaccgcactttgatctgcaccccaaaacctggacacggaca > 1:371620‑M2/247‑251 (MQ=255) ctactTCTGCTGGCTAAATGTTGGATCACTCGGACTTTTCCTGTCAGATCAGGCGATTGCCAGCTTTTATAGCTAATTTCGTTCCCGTTCAAAATTAATTCGCCATCTTTTTGCACGGTAACGGAGAATGCTTAGAAAGGTTAATCCTAGAGCTAATGCTATTTTTTTCATTTTAATGTCCTTAAATTATGCAAATTTTACCGGATTTTTTGACCGCACTTTGCTCTGCACCCCAAAACCTGGACACCTaa > 1:817944/1‑251 (MQ=255) 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cTAAATGTTGGATCACTCGGACTTTTCCTGTCAGATCAGGCGATTGCCAGCTTTTATAGCTAATTTCGTTCCCGTTCAAAATTAATTCGCCATCTTTTTGCACGGTAACGGAGAATGCTTAGAAAGGTTAATCCTAGAGCTAATGCTATTTTTTTCATTTTAATGTCCTTAAATTATGCAAATTTTACCGGATTTTTTGACCGCACTTTGCTCTGCACCCTAAAACCTGGACACCTAATTTGAGGTGCAGa > 1:872122/1‑251 (MQ=255) ggtcattgagcataatttagacgtgattaaaaccgccgactggattgtagatctcggccctgaaggcggcagcggcggcggacaaattatcgcgaccggcacaccggaacaggttgccaaaatggagggctcgcacaccgcccgcttcctcaaagagattttggcaaaaggctaaaaacgctgcattttccgaccgcactttgatctgcaccccaaaacctggacacgga > 1:498242‑M2/228‑230 (MQ=255) gtcattgagcataatttagacgtgattaaaaccgccgactggattgtagatctcggccctgaaggcggcagcggcggcggacaaattatcgcgaccggcacaccggaacaggttgccaaaatggagggctcgcacaccgcccgcttcctcaaagagattttggcaaaaggctaaaaacgctgcattttccgaccgcactttgatctgcaccccaaaacctggacacGGACACCTAATTTGAGGTGCAGAtt > 1:555999‑M2/227‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |