| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 199,738 | +TTTC | intergenic (+66427/+62493) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 199734 | 0 (0.000) | 149 (1.720) +TTTC |
93/414 | 0.0 | 100% | intergenic (+66423/+62497) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 199735 = | 0 (0.000) | intergenic (+66424/+62496) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
TATTGGTATAAAGAGATTGCAGGATTATTTGCGTTATCTTTTGCGGTTATTTCTGCGTTATGTTTAGCGGCAGGCTTACTGAAGAATCCTTATTTCTCTGCCGTGACACAAATGCCGTCAAGAAAAGTTGAATTGCCTTCAGGTAAATGGGTTCATTTCGCTATGTGCAATATTATTGCGACAATGATATTGTATCCATTGTTCACGCAATGGGGAGGCGCTAATGAACCTATTGCATCAATGATTTCATGCCATTGGAGATGGGAAATGGAATTGTCTTATGGTTAGTCGTCAGTGCAATTGTTAATTATCTCTTATTCTTTCTATGGTCCCATAAAAAATCTATTTCTTGGCAGGAATTTGGTATTTTAGCTGGCAAACCAAATATAACGACCTCTCAATTAATCGGGCGCTATTTGATTTTAGCTGCCATATTAGTTAGTTATTTGTATGGGATTGCCTATGTCGTTCATTCTTACTGGCAAGTTGAATTG > 1/199491‑199984 | ggtataaagagattgcaggattatttgcgttatcttttgcggttatttctgcgttatgtttagcggcaggcttactgaagaatccttatttctctgccgtgacacaaatgccgtcaagaaaagttgaattgccttcaggtaaatgggttcatttcgctatgtgcaatattattgcgacaatgatattgtatccattgttcacgcaatggggaggcgctaatgaacctattgcatcaatgatttcTTTCATg > 1:461622‑M2/245‑251 (MQ=255) 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1:641449‑M2/174‑251 (MQ=255) actgaagaatccttatttctctgccgtgacacaaatgccgtcaagaaaagttgaattgccttcaggtaaatgggttcatttcgctatgtgcaatattattgcgacaatgatattgtatccattgttcacgcaatggggaggcgctaatgaacctattgcatcaatgatttcTTTCATGCCATTGGAGATGGGAAATGGAATTGTCTTATGGTTAGTCGTCAGTGc > 1:597804‑M2/172‑225 (MQ=255) actgaagaatccttatttctctgccgtgacacaaatgccgtcaagaaaagttgaattgccttcaggtaaatgggttcatttcgctatgtgcaatattattgcgacaatgatattgtatccattgttcacgcaatggggaggcgctaatgaacctattgcatcaatgatttcTTTCATGCCATTGGAGATGGGAAATGGAATTGTCTTATGGTTAGTCGTCAGTGCAATTGTTAATTATCTCTTAttctttc < 1:703901‑M2/80‑1 (MQ=255) gaagaatccttatttctctgccgtgacacaaatgccgtcaagaaaagttgaattgccttcaggtaaatgggttcatttcgctatgtgcaatattattgcgacaatgatattgtatccattgttcacgcaatggggaggcgctaatgaacctattgcatcaatgatttcTTTCATGCCATTGGAGATGGGAAATGGAATTGTCTTATGGTTAGTCGTCAGTGCAATTGTTAAtt > 1:433284‑M2/169‑233 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |