| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1645858 = | 0 (0.000) | 15 (0.190) | 14/392 | 3.5 | 100% | intergenic (+4019/+18517) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | = 1645853 | 0 (0.000) | intergenic (+4014/+18522) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
ATTCACAAGAAGAGTTAGAGAAAGGCGTTAATACTATTTTTATAAAACCTCTAATTCGTTATGAAGAGATAAATTTCCAAAATTTAGGACGCCCATTAGAAATAATTACAGATGGAAACATGATCACAGAATATAAATATGGATTTTTTAATTAAGTAAATTATGAATGAATCAATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTTCTCTCATTTAGATCCGCTTTGCCTTTGGCAAAAATCTACGTTTATGATAATAATTCGACAGATAAAACTTTTGAAATTGCAAGTAAACTAGATTGTATTGTACGCAATGAACCTAAACAAGGAAAAGGTGCCGTCGTTCGCAGAATGTTTGCAGATATTGATGCAGACA > 1/1645685‑1646097 | aTTCACAAGAAGAGTTAGAGAAAGGCGTTAATACTATTTTTATAAAACCTCTAATTCGTTATGAAGAGATAAATTTCCAAAATTTAGGACGCCCATTAGAAATAATTACAGATGGAAACATGATCACAGAATATAAATATGGATTTTTTAATTAAGTAAATTATGAATG‑‑‑‑AATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTTCTCTCATTTAg < 1:499549/251‑1 (MQ=255) ttATAAAACCTCTAATTCGTTATGAAGAGATAAATTTCCAAAATTTAGGACGCCCATTAGAAATAATTACAGATGGAAACATGATCACAGAATATAAATATGGATTTTTTAATTAAGTAAATTATGAATG‑‑‑‑AATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTTCTCTCATTTAGATCCGCTTTGCCTTTGGCAAAAATCTACGTTTATGataa > 1:859374/1‑251 (MQ=255) aTTAGAAATAATTACAGATGGAAACATGATCACAGAATATAAATATGGATTTTTTAATTAAGTAAATTATGAATG‑‑‑‑AATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTTCTCTCATTTAGATCCGCTTTGCCTTTGGCAAAAATCTACGTTTATGATAATAATTCGACAGATAAAACTTTTGAAATTGCAAGTAAACTAGATTGTATTGTACGc < 1:182360/251‑1 (MQ=255) cAGATGGAAACATGATCACAGAATATAAATATGGATTTTTTAATTAAGTAAATTATGAATG‑‑‑‑AATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTcc < 1:395114/95‑1 (MQ=255) aaaCATGATCACAGAATATAAATATGGATTTTTTAATTAAGTAAATTATGAATG‑‑‑‑AATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGt < 1:365006/110‑1 (MQ=255) cATGATCACAGAATATAAATATGGATTTTTTAATTAAGTAAATTATGAATG‑‑‑‑AATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATAc > 1:690948/1‑118 (MQ=255) atatAAATATGGATTTTTTAATTAAGTAAATTATGAATG‑‑‑‑AATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTtctct < 1:248383/114‑1 (MQ=255) atatAAATATGGATTTTTTAATTAAGTAAATTATGAATG‑‑‑‑AATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTTCTCTCATTTAGATCCGCTTTGCCTTTGGCAAAAATCTACGTTTATGATAATAATTCGACAGATAAAACTTTTGaaa < 1:190195/186‑1 (MQ=255) atatAAATATGGATTTTTTAATTAAGTAAATTATGAATG‑‑‑‑AATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTTCTCTCATTTAGATCCGCTTTGCCTTTGGCAAAAATCTACGTTTATGATAATAATTCGACAGATAAAACTTTTGAAATTGCAAGTAAACTAGATTGTATTGTACGCAATGAACCTAAACAAGGAAAAGGTGCCGTCGTTCg > 1:154853/1‑250 (MQ=255) atatAAATATGGATTTTTTAATTAAGTAAATTATGAATG‑‑‑‑AATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTTCTCTCATTTAGATCCGCTTTGCCTTTGGCAAAAATCTACGTTTATGATAATAATTCGACAGATAAAACTTTTGAAATTGCAAGTAAACTAGATTGTATTGTACGCAATGAACCTAAACAAGGAAAAGGTGCCGTCGTTCg > 1:666454/1‑250 (MQ=255) aaTATGGATTTTTTAATTAAGTAAATTATGAATG‑‑‑‑AATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTTCTCTCATTTAGATCCGCTTTGCCTTTGGCAAAAATCTACGTTTATGATAATAATTCGACAGATAAAACTTTTGAAATTGCAAGTAAACTAGATTGTATTGTACGCAATGAACCTAAACAAGGAAAAGGTGCCGTCGTTCGCAGAAt > 1:473543/1‑251 (MQ=255) aattatgaatgaATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTTCTCTCATTTAGATCCGCTTTGCCTTTGGCAAAAATCTACGTTTATGATAATAATTCGACAGATAAAACTTTTGAAATTGCAAGTAAACTAGATTGTATTGTACGCAATGAACCTAAACAAGGAAAAGGTGCCGTCGTTCGCAGAATGTTTGCAGATATTGATGCAGACa < 1:294694/247‑1 (MQ=255) attatgaatgaATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTTCTCTCATTTAGATCCGCTTTGCCTTTGGCAAAAATc > 1:889811/4‑117 (MQ=255) attatgaatgaATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTTCTCTCATTTAGATCCGCTTTGCCTTTGGCAAAAATCTACGTTTATGATAATAATTCGACAGATAAAACTTTTGAAATTGCAAGTAAACTAGat < 1:416170/171‑1 (MQ=255) gaatgaatCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTTCTCTCATTTAGATCCGCTTTGCCTTTGGCAAAAATCTACGTTTATGATAATAATTCGACAGATAAAACTTTTGAAATTGCAAGTAAACTAGATTGTATTGTACGCAATGAACCTAAACAAGGAAAAGGTGCCGTCGTTCGCAGAATGTTTGCAGATATTGATg < 1:472238/239‑1 (MQ=255) | ATTCACAAGAAGAGTTAGAGAAAGGCGTTAATACTATTTTTATAAAACCTCTAATTCGTTATGAAGAGATAAATTTCCAAAATTTAGGACGCCCATTAGAAATAATTACAGATGGAAACATGATCACAGAATATAAATATGGATTTTTTAATTAAGTAAATTATGAATGAATCAATCAATCAATCAATCAATTGCAATATTAATTCCTTGTTATAATGAAGAACATAGTATATCCGATACTGTTCTCTCATTTAGATCCGCTTTGCCTTTGGCAAAAATCTACGTTTATGATAATAATTCGACAGATAAAACTTTTGAAATTGCAAGTAAACTAGATTGTATTGTACGCAATGAACCTAAACAAGGAAAAGGTGCCGTCGTTCGCAGAATGTTTGCAGATATTGATGCAGACA > 1/1645685‑1646097 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |