| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 617,649 | (AAT)2→1 | intergenic (+120096/‑81692) | unknown → / → unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 617645 | 617647 | 3 | 83 [0] | [0] 83 | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 617648 = | 0 (0.000) | 82 (0.950) | 55/422 | 0.3 | 100% | intergenic (+120095/‑81695) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | = 617644 | 0 (0.000) | intergenic (+120091/‑81699) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA | |||||
CAGGTCAATGGCGGGCAAACCCAACCTAAAAAAACGCCATTTTTTCTGACCGCACTTTTCGCCATTATTTGCCATGTTTTCACCACGTTGCCGTTGCTCAATGATCTGGCAAACGGACAAGCCTTTACCCTGATGGAAGTGGCGTCATTGATGAGCGTGATTATCGCCTCATTAGCCACACTTGCCATGTTGCGGGTGAACAGCATGTGGTTTGTGTTGCCAATTGTGTATTGCTTTTCCATGGTTAATAATCTGGTTTGTGCCACTTTTATTCCAAGCCATATTATTCAGCTGTTGAATCAAAACGGTTCCATGTTATTTCATATCGGCTTGTCCATTTTTGCCTACGCGGTATACTGCATCGCCACGCTATACGCCATTCAACTGGGCTGGATTGACCGTCGCTTAAAAGCTAAAAAAATGCACTTTTCGCCGATGGTGCCGCCATTGATGACGGTGGAACGCCATTTTTTCCGTTTATTGGTAAGCGGTGAAAT > 1/617400‑617896 | tcgcaggtcaatggcgggcaaacccaacctaaaaaaacgccattttttctgaccgcacttttcgccattatttgccatgttttcaccacgttgccgttgctcaatgatctggcaaacggacaagcctttaccctgatggaagtggcgtcattgatgagcgtgattatcgcctcattagccacacttgccatgttgcgggtgaacagcatgtggtttgtgttgccaattgtgtattgcttttccatggtTaa < 1:599476‑M1/3‑1 (MQ=255) caggtcaatggcgggcaaacccaacctaaaaaaacgccattttttctgaccgcacttttcgccattatttgccatgttttcaccacgttgccgttgctcaatgatctggcaaacggacaagcctttaccctgatggaagtggcgtcattgatgagcgtgattatcgcctcattagccacacttgccatgttgcgggtgaacagcatgtggtttgtgttgccaattgtgtattgcttttccatggtTAATc > 1:189364‑M1/246‑250 (MQ=255) ggtcaatggcgggcaaacccaacctaaaaaaacgccattttttctgaccgcacttttcgccattatttgccatgttttcaccacgttgccgttgctcaatgatctggcaaacggacaagcctttaccctgatggaagtggcgtcattgatgagcgtgattatcgcctcattagccacacttgccatgttgcgggtgaacagcatgtggtttgtgttgccaattgtgtattgcttttccatggtTAATCTgg < 1:373957‑M1/8‑1 (MQ=255) ggtcaatggcgggcaaacccaacctaaaaaaacgccattttttctgaccgcacttttcgccattatttgccatgttttcaccacgttgccgttgctcaatgatctggcaaacggacaagcctttaccctgatggaagtggcgtcattgatgagcgtgattatcgcctcattagccacacttgccatgttgcgggtgaacagcatgtggtttgtgttgccaattgtgtattgcttttccatggtTAATCTgg < 1:673267‑M1/8‑1 (MQ=255) 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attttttctgaccgcacttttcgccattatttgccatgttttcaccacgttgccgttgctcaatgatctggcaaacggacaagcctttaccctgatggaagtggcgtcattgatgagcgtgattatcgcctcattagccacacttgccatgttgcgggtgaacagcatgtggtttgtgttgccaattgtgtattgcttttccatggtTAATCTGGTTTGTGCCACTTTTATTCCAAGCCATATTATTCAGc > 1:307341‑M1/208‑251 (MQ=255) tttgccatgttttcaccacgttgccgttgctcaatgatctggcaaacggacaagcctttaccctgatggaagtggcgtcattgatgagcgtgattatcgcctcattagccacacttgccatgttgcgggtgaacagcatgtggtttgtgttgccaattgtgtattgcttttccatggtTAATCTGGTTTGTGCCACTTTTATTCCAAGCCATATTATTCAGCTGTTGAATCAAAACGGTTCCATGTTAttt > 1:503575‑M1/179‑251 (MQ=255) catgttttcaccacgttgccgttgctcaatgatctggcaaacggacaagcctttaccctgatggaagtggcgtcattgatgagcgtgattatcgcctcattagccacacttgccatgttgcgggtgaacagcatgtggtttgtgttgccaattgtgtattgcttttccatggtTAATCTGGTTTGTGCCACTTTTATTCCAAGCCATATTATTCAGCTGTTGAATCAAAACGGTTCCATGTTATTTCatat > 1:359004‑M1/174‑251 (MQ=255) 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CAGGTCAATGGCGGGCAAACCCAACCTAAAAAAACGCCATTTTTTCTGACCGCACTTTTCGCCATTATTTGCCATGTTTTCACCACGTTGCCGTTGCTCAATGATCTGGCAAACGGACAAGCCTTTACCCTGATGGAAGTGGCGTCATTGATGAGCGTGATTATCGCCTCATTAGCCACACTTGCCATGTTGCGGGTGAACAGCATGTGGTTTGTGTTGCCAATTGTGTATTGCTTTTCCATGGTTAATAATCTGGTTTGTGCCACTTTTATTCCAAGCCATATTATTCAGCTGTTGAATCAAAACGGTTCCATGTTATTTCATATCGGCTTGTCCATTTTTGCCTACGCGGTATACTGCATCGCCACGCTATACGCCATTCAACTGGGCTGGATTGACCGTCGCTTAAAAGCTAAAAAAATGCACTTTTCGCCGATGGTGCCGCCATTGATGACGGTGGAACGCCATTTTTTCCGTTTATTGGTAAGCGGTGAAAT > 1/617400‑617896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |