| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 351570 = | 67 (0.760) | 28 (0.440) +ATTTTAGGTTTAGTATAAGGTGATTTTACGCCATCAAGTCCTCTTTCACGAAAGGCTTT |
18/312 | 2.0 | 53.6% | intergenic (‑6647/+60306) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | 1031774 = | 0 (0.000) | intergenic (‑25318/‑3445) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA | |||||
AATAAAAAAGTGATCTGCACCCAAAACCTGAACACCTAATTATAAGGTGCTGGTTATGTCCTACTCTTATCAATTTCGTTTAAAAATTATCAAACCGATCACCGAACAGGATTTTAGTATTTATAAGGTGTCTAAACTTTATAAGATTCCTCATTCTCAAGTCATTTATTGGTTAAAAGCCTTTCGTGAAAGAGGGCTTGATGGCATAAAATCGCCTTATACTAAACCTAAAACCTCCAAAATTCTGAAACCC‑AAAATGAAAAAAACGCAGATTGAAGTGGCTGAAACAACCGACTTTTCACCACAAGCCTTTAAAAAACTGAAACGAGAACCCGCCCTTGAAAAAGCGGAGATTGATTATCTAAAAAAGTTAGTGGAATTGGGGCGATCAAAAACAAATTAAACTCGATTTAAAAGTATTGAGCCTGGTACAATACCGAGCTCAATACTTCAGTTAACTGACCTGTCCAACTTTTGGGGGCAGATCAAAGTG > 1/351321‑351813 | aaaaacttttttcaaactgaccgcactttaatctgcccccaaacccgggcatctaatttgaagtgcagattatgccctactcttatcaatttcatctaaaagttatcaaacaggtcaccgaacaggatttggtatccgtgaggtggctaaacttcatcagattcctcattctcaagtcatttattgattaaaagcctttcgtgaaagaggacttgatggcgtaaaatcaccttatactaaacctaaaatAc > 1:883485‑M1/250‑251 (MQ=255) cactttaatctggccccaaacccgggcatctaatttgaagtgcagattatgccctactcttatcaatttcatctaaaagttatcaaacaggtcaccgaacaggatttggtatccgtgaggtggctaaacttcatcagattcctcattctcaagtcatttattgattaaaagcctttcgtgaaagaggacttgatggcgtaaaatcaccttatactaaacctaaaatACCC‑AAAATGAAAAAAATGCAGAtt < 1:73891‑M1/25‑1 (MQ=255) cactttaatctgcccccaaacccgggcatctaatttgaagtgcagattatgccctactcttatcaatttcatctaaaagttatcaaacaggtcaccgaacaggatttggtatccgtgaggtggctaaacttcatcagattcctcattctcaagtcatttattgattaaaagcctttcgtgaaagaggacttgatggcgtaaaatcaccttatactaaacctaaaatACCC‑AAAATGAAAAAAATGCAGAtt > 1:470554‑M1/227‑251 (MQ=255) cactttaatctgcccccaaacccgggcatctaatttgaagtgcagattatgccctactcttatcaatttcatctaaaagttatcaaacaggtcaccgaacaggatttggtatccgtgaggtggctaaacttcatcagattcctcattctcaagtcatttattgattaaaagcctttcgtgaaagaggacttgatggcgtaaaatcaccttatactaaacctaaaatACCC‑AAAATGAAAAAAATGCAGAtt < 1:417452‑M1/25‑1 (MQ=255) ctttaatctgcccccaaacccgggcatctaatttgaagtgcagattatgccctactcttatcaatttcatctaaaagttatcaaacaggtcaccgaacaggatttggtatccgtgaggtggctaaacttcatcagattcctcattctcaagtcatttattgattaaaagcctttcgtgaaagaggacttgatggcgtaaaatcaccttatactaaacctaaaataccctaaaatgccccgcctaaaactga < 1:477936‑M1/27‑17 (MQ=255) ctttaatctgcccccaaacccgggcatctaatttgaagtgcagattatgccctactcttatcaatttcatctaaaagttatcaaacaggtcaccgaacaggatttggtatccgtgaggtggctaaacttcatcagattcctcattctcaagtcatttattgattaaaagcctttcgtgaaagaggacttgatggcgtaaaatcaccttatactaaacctaaaatACCC‑AAAATGAAAAAAATGCAGATTGa < 1:845646‑M1/27‑1 (MQ=255) cccaaacccgggcatctaatttgaagtgcagattatgccctactcttatcaatttcatctaaaagttatcaaacaggtcaccgaacaggatttggtatccgtgaggtggctaaacttcatcagattcctcattctcaagtcatttattgattaaaagcctttcgtgaaagaggacttgatggcgtaaaatcaccttatactaaacctaaaatACCC‑AAAATGAAAAAAATGCAGATTGAAGTGACTGAaac > 1:94800‑M1/213‑251 (MQ=255) aaacccgggcatctaatttgaagtgcagattatgccctactcttatcaatttcatctaaaagttatcaaacaggtcaccgaacaggatttggtatccgtgaggtggctaaacttcatcagattcctcattctcaagtcatttattgattaaaagcctttcgtgaaagaggacttgatggcgtaaaatcaccttatactaaacctaaaatACCC‑AAAATGAAAAAAATGCAGATTGAAGTGACTGAaacaac > 1:364810‑M1/210‑251 (MQ=255) tctaatttgaagtgcagattatgccctactcttatcaatttcatctaaaagttatcaaacaggtcaccgaacaggatttggtatccgtgaggtggctaaacttcatcagattcctcattctcaagtcatttattgattaaaagcctttcgtgaaagaggacttgatggcgtaaaatcaccttatactaaacctaaaatACCC‑AAAATGAAAAAAATGCAGATTGAAGTGACTGAAACAACCGACTTTTcac > 1:756571‑M1/199‑251 (MQ=255) tctaatttgaagtgcagattatgccctactcttatcaatttcatctaaaagttatcaaacaggtcaccgaacaggatttggtatccgtgaggtggctaaacttcatcagattcctcattctcaagtcatttattgattaaaagcctttcgtgaaagaggacttgatggcgtaaaatcaccttatactaaacctaaaaaACCC‑AAAATGAAAAAAATGCAGATTGAAGTGACTGAAACAACCGACTTTTcac > 1:631771‑M1/199‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |