| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | 1 | = 295564 | 0 (0.000) | intergenic (‑28204/+49041) | unknown/unknown | SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA/tRNA‑Arg‑ACG | |||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
CTATTTATGTGCTAATAATAGAGATTAGCTTATCGGTAATTTTCTCTCTATATAGGTTTAGGAAGTAATTTTGTGATTCAGATCGCAAAAATGATATTTTTCAAGTCAAAAACTCTAGGTTATATGCTTATAAATGTCCTGTGGTAAAAAATAATCCCTATTTTCGTAACGATAATAGGCAACTTGATCAATTTTGATGATGTTCTTTCGTTTTGGCGTTTTAATTGTAATGTTGTGTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTCCGTGAGTACAAGGTGAAAATGCTGATTATTGACGAATTCCATTCGTTGCTTGT > 1/292289‑292777 | cgtttggagatattgaataatggaaaaacaatatgagtatgttcacgaaaaattccgtcatttagtgattgcaagcaatcaggaacggattgagtttttagatgaaccacgttgggtaggttatgccgttgcaaataagatcattgataatttggtttccttaatgaataagccgaaacgccctcgcatgttcaatttgttggtagtcggtgattctaacaatggtaaaacgacgctTATTCGACACtttt < 1:291299‑M1/14‑1 (MQ=255) tggagatattgaataatggaaaaacaatatgagtatgttcacgaaaaattccgtcatttagtgattgcaagcaatcaggaacggattgagtttttagatgaaccacgttgggtaggttatgctgttgcaaataagatcattgataatttggtttccttaatgaataagccgaaacgccctcgcatgttcaatttgttggtagtcggtgattctaacaatggtaaaacgacgctTATTCGACACTTTTATGa > 1:501802‑M1/234‑251 (MQ=255) agatattgaataatggaaaaacaatatgagtatgttcacgaaaaattccgtcatttagtgattgcaagcaatcaggaacggattgagtttttagatgaaccacgttgggtaggttatgccgttgcaaataagatcattgataatttggtttccttaatgaataagccgaaacgccctcgcatgttcaatttgttggtagtcggtgattctaacaatggtaaaacgacgctTATTCGACACTTTTATGAtt > 1:382687‑M1/231‑250 (MQ=255) atattgaataatggaaaaacaatatgagtatgttcacgaaaaattccgtcatttagtgattgcaagcaatcaggaacggattgagtttttagatgaaccacgttgggtaggttatgccgttgcaaataagatcattgataatttggtttccttaatgaataagccgaaacgccctcgcatgttcaatttgttggtagtcggtgattctaacaatggtaaaacgacgctTATTCGACACt > 1:784896‑M1/229‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |