| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 1 | 230481 = | 0 (0.000) | 153 (1.740) +T |
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| ? | 1 | 682082 = | NA (NA) | intergenic (+184529/‑17261) | unknown/unknown | tRNA‑SeC(p)‑TCA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
AATATGCTACCTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAATAAAAAAGCCAATGATAAAATCATCGGCTTCTATTTATCGTTAATTAAGCAATTACTGCTTTCTCAACTACACGAACTAAAGTCCATGATTTAGTTTTAGAAATTGGACGACATTCGCGAACTTCTACTAAATCACCTAATTTAGCTTCGTTGTTTTCATCGTGCACATGTAGTTTGGTTGTGCGACGGATAAACTTGCCATAAAGTGGGTGTTTAACCTT > 1/230235‑230730 | atgctacctatatccgttctaagccttccgtaaatggcttttcttctatatttcggggtgaagacgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtgaggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatatgcatagcgtacggttttattt < 1:426893‑M1/3‑1 (MQ=255) ctacctatatccgttctaagccttccgtaaatggcttttcttctatatttcggggtgaagacgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtgaggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatatgcatagcgtacggttttaTTTATAGc > 1:820108‑M1/244‑251 (MQ=255) acctatatccgttctaagccttccgtaaatggcttttcttctatatttcggggtgaagacgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtgaggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatatgcatagcgtacggttttattt > 1:480458‑M1/242‑244 (MQ=255) acctatatccgttctaagccttccgtaaatggcttttcttctatatttcggggtgaagacgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtgaggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatatgcatagcgtacggttttaTTTATAGCTa < 1:501684‑M1/10‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |