| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | 1 | 214,396 | Δ388 bp | intergenic (+81085/+47448) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 214396 | 214783 | 388 | 114 [0] | [0] 114 | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
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| ? | 1 | 214784 = | 0 (0.000) | intergenic (+81473/+47447) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CGTGATTATCAGTTCCGTGTTAGGCGGCGCTACCGCAGGGGCAATTTCCATGAGCTGCGGCATTGCGCTACAAGCGCCGCACGGCGGTTTATTCGTGATCCCGTTTGTCTCCGAACCGTTGATGTACCTCAGCGCCATCGCTATCGGCTCTGTCGTGACCGGCGTAGTGTATGCGGTGATTAAACCAAAAGCAGAAGCATAATATCAATGTGAATAAAGTGCGGTGGATTTTGACCGCACTTTTTTATCTTGTAAGGACGACAATATGCCATTTAGCGACTCTGAAAAACGCGCTCTTTTGGCGCAAAAGGGCATCGGTGAGACGATTTTAAAACGCTTGGAAGAAATGGGCTTGGATGATGTCAGCACACTCGCCGCCACTAGCCCGGATTTTATTCTCCAACGCGGCGCCGAAATAACCGGTTCCACTTGCTGGCGTAACAGCCCCCAGGCGCGAAAAACCATTGAAACGGCAGTGAATTGGGCGAAAAGCGTG > 1/214149‑214644 | cgTGATTATCAGTTCCGTGTTAGGCGGCGCTACCGCAGGGGCAATTTCCATGAGCTGCGGCATTGCGCTACAAGCGCCGCACGGCGGTTTATTCGTGATCCCGTTTGTCTCCGAACCGTTGATGTACCTCAGCGCCATCGCTATCGGCTCTGTCGTGACCGGCGTAGTGTATGCGGTGATTAAACCAAAAGCAGAAGCATAATATCAATGTGAATAAAGTGCGGTGGATTTTGACCGCACTTTTTTAacc < 1:823990‑M1/250‑4 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |