| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | 1 | 171,208 | (ACGCGC)3→2 | intergenic (+37897/+91018) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 171194 | 171199 | 6 | 116 [0] | [0] 115 | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 171200 = | 0 (0.000) | 100 (1.210) | 69/402 | 0.1 | 100% | intergenic (+37889/+91031) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 1 | = 171193 | 0 (0.000) | intergenic (+37882/+91038) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
ACCCGTGAGTAACAGAAGGACAATTCAAAATGACAACAAACGTAAATAGCTATGGCTGGAAAGCCTTGCTGGGTTCCGCCGTGGGTTATGCCATGGACGGTTTCTATCTTCTCATTCTCGGTTTCATGTTAAGCGCTATTTCCGCCGATTTAGGTTTAACCCCGGCACAGGGCGGTTCTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATACGGGCGCGTGCGCGTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/171463‑171200‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgcgtgcgcgtgcTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATGACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACCGGTATTATTACCGCATAT < 1/171193‑170944 ACCCGTGAGTAACAGAAGGACAATTCAAAATGACAACAAACGTAAATAGCTATGGCTGGAAAGCCTTGCTGGGTTCCGCCGTGGGTTATGCCATGGACGGTTTCTATCTTCTCATTCTCGGTTTCATGTTAAGCGCTATTTCCGCCGATTTAGGTTTAACCCCGGCACAGGGCGGTTCTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGG < 1:27594/251‑1 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AGCTATGGCTGGAAAGCCTTGCTGGGTTCCGCCGTGGGTTATGCCATGGACGGTTTCTATCTTCTCATTCTCGGTTTCATGTTAAGCGCTATTTCCGCCGATTTAGGTTTAACCCCGGCACAGGGCGGTTCTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACG < 1:256078/228‑1 GCTATGGCTGGAAAGCCTTGCTGGGTTCCGCCGTGGGTTATGCCATGGACGGTTTCTATCTTCTCATTCTCGGTTTCATGTTAAGCGCTATTTCCGCCGATTTAGGTTTAACCCCGGCACAGGGCGGTTCTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCAC > 1:304408/1‑250 CTGGAAAGCCTTGCTGGGTTCCGCCGTGGGTTATGCCATGGACGGTTTCTATCTTCTCATTCTCGGTTTCATGTTAAGCGCTATTTCCGCCGATTTAGGTTTAACCCCGGCACAGGGCGGTTCTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGG < 1:221159/196‑1 TTGCTGGGTTCCGCCGTGGGTTATGCCATGGACGGTTTCTATCTTCTCATTCTCGGTTTCATGTTAAGCGCTATTTCCGCCGATTTAGGTTTAACCCCGGCACAGGGCGGTTCTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTC > 1:720726/1‑222 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1:311740/178‑1 CCCCGGCACAGGGCGGTTCTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGAT > 1:899415/1‑173 CCCCGGCACAGGGCGGTTCTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGA < 1:722482/172‑1 GGGCGGTTCTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGC < 1:695907/149‑1 GGCGGTTCTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCTTCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGC < 1:786415/250‑1 GTTCTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGAT < 1:825550/103‑1 TCTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACA > 1:833458/1‑219 CTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCAT < 1:270540/248‑1 GTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCGCCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGG < 1:888959/148‑1 CACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAG < 1:891868/251‑1 CCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGAC < 1:708394/88‑1 GGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCA > 1:842435/1‑251 CGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGG < 1:242898/251‑1 CGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGG < 1:877756/251‑1 GCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGG < 1:209365/247‑1 GTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCA < 1:26305/250‑1 TGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAG < 1:724986/251‑1 ATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGG > 1:122373/1‑251 ATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGG > 1:127896/1‑251 ATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGA > 1:695139/1‑188 ATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCAC < 1:339513/131‑1 ATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTC < 1:867113/78‑1 CTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCA < 1:81636/170‑1 ATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGC < 1:733288/251‑1 TGCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGG < 1:582239/250‑1 GCGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCA < 1:218599/233‑1 CGTTAAGTGACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGC < 1:397626/250‑1 ACAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGA > 1:236812/1‑91 CAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGA > 1:276679/1‑251 CAAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCACCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGA > 1:592660/1‑251 AAATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGAC < 1:218101/251‑1 AATATGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTC > 1:862313/1‑180 atatGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACA > 1:893269/5‑250 atatGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACA > 1:190616/5‑250 atatGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGA > 1:422169/5‑87 tatGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACC < 1:8336/248‑1 tatGGGCGCGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACC < 1:896672/248‑1 CGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACCGGTATTA < 1:768685/250‑1 CGTGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACCGGTATTA < 1:316570/250‑1 TGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACCGGTATTATTA < 1:87901/251‑1 TGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACCGGTATTATT < 1:190715/250‑1 TGCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACCGGTATTATT < 1:792519/250‑1 GCGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACCGGTATTATTA > 1:799196/1‑250 CGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACCGGTATTATTAC < 1:572052/250‑1 CGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACCGGTATTATTAC < 1:878576/250‑1 CGCGTGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACCGGTATTATTAC < 1:105004/250‑1 TGCTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATCACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACCGGTATTATTACCGCAT > 1:306219/1‑251 ACCCGTGAGTAACAGAAGGACAATTCAAAATGACAACAAACGTAAATAGCTATGGCTGGAAAGCCTTGCTGGGTTCCGCCGTGGGTTATGCCATGGACGGTTTCTATCTTCTCATTCTCGGTTTCATGTTAAGCGCTATTTCCGCCGATTTAGGTTTAACCCCGGCACAGGGCGGTTCTTTGGTCACCTGGACCTTAGTCGGCGCGGTAGTCGGTGGCATCTTATTCGGTGCGTTAAGTGACAAATACGGGCGCGTGCGCGTGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/171463‑171200‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgcgtgcgcgtgcTCATGTGGACGATTATCCTATTCGCCGTGTTCACCGGTTTATGTGCCTTAGCGCAAGGGTATTGGGATTTGCTCATTTACCGCACCATCGCCGGAATCGGCTTGGGCGGCGAATTCGGTATTGGCATGACATTGGCGGCGGAAGCCTGGCCGGCGCGTCATCGCGCCAAAGCGGCATCTTATGTGGCGCTCGGCTGGCAAGTCGGCGTGCTGGGGGCGGCGTTGCTGACACCGGTATTATTACCGCATAT < 1/171193‑170944 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |