| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 389,048 | +A | intergenic (‑44125/+22828) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 389,044 | 1 | . | A | 100.0% | 325.3 / NA | 121 | intergenic (‑44121/+22832) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GCT/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base A (72/49); total (72/49) | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
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ttCATATATCGCTTTTGAGCTCCTATACGCACTTCTGACATTGCGCTGTTTATAAGAAAAATTCTCATTCGGCTTGTCCGAGCGTTCCGTCAAAAACGTTTGATGATTTCGATACCACGAATAGCGCAGGACATAAAAGTGATTTTTTTGTTGATAAATTCAAAAAAGTGGGTTAACGCCTCGTACTATAAGGTCTTAACCCACTTTTATCCGCTACTTTTCTGc > 1:869673/1‑225 (MQ=255) ttCATATATCGCTTTTGAGCTCCTATACGCACTTCTGACATTGCGCTGTTTATAAGAAAAATTCTCATTCGGCTTGTCCGAGCGTTCCGTCAAAAACGTTTGATGATTTCGATACCACGAATAGCGCAGGACATAAAAGTGATTTTTTTGTTGATAAATTCAAAAAAGTGGGTTAACGCCTCGTACTATAAGGTCTTAACCCACTTTTATCCGCTACTTTTCTGCTATAc > 1:182464/1‑230 (MQ=255) ttCATATATCGCTTTTGAGCTCCTATACGCACTTCTGACATTGCGCTGTTTATAAGAAAAATTCTCATTCGGCTTGTCCGAGCGTTCCGTCAAAAACGTTTGATGATTTCGATACCACGAATAGCGCAGGACATAAAAGTGATTTTTTTGTTGATAAATTCAAAAAAGTGGGTTAACGCCTCGTACTATAAGGTCTTAACCCACTTTTATCCGCTACTTTTCTGCTATACCCTTTTCAAGGGTTTTaaaaa > 1:888865/1‑251 (MQ=255) 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GGCATAGTAGACAAAAGAGTTGGTTTTACCAACTTTTTCTATTTATAAGATCCCTAATAAGTAATACATTGCGCATACTTGTCAAACTATGATGCACGGCTAATTTTTGTTTTAATATTTTAATCCCTTAAGTCGATTAGTTGTTTTTCAATGCCTAAACCGGCATATTGTTCAAACGTGAATAACTAATTCATATATCGCTTTTGAGCTCCTATACGCACTTCTGACATTGCGCTGTTTATAAG‑AAAATTCTCATTCGGCTTGTCCGAGCGTTCCGTCAAAAACGTTTGATGATTTCGATACCACGAATAGCGCAGGACATAAAAGTGATTTTTTTGTTGATAAATTCAAAAAAGTGGGTTAACGCCTCGTACTATAAGGTCTTAACCCACTTTTATCCGCTACTTTTCTGCTATACCCTTTTCAAGGGTTTTAAAAAACACCATAAAATACTACCGCACTTTAGGAGTATCGATCGGATTCTG > 1/388800‑389284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |