| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,029,579 | (T)6→7 | intergenic (‑23123/‑5640) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,029,573 | 1 | . | T | 100.0% | 220.4 / NA | 76 | intergenic (‑23117/‑5646) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base T (23/53); total (23/53) | |||||||||||
ATTGAAGAGATCTTTAATTGGTGATAAATAGAGCTTGCCTTCATCGCATTTAAATTCAATCACATCGGTGACCCATTTTTCATTAGGTTTCGTCGCACTAAAATCCCGCTGTAACAGATTGTCTGCAATCTTACCGACTTCGCCTTGATAAGAACGATATTTTCGCCGTTTGCATTTTCCCTTCAAACCTTAGTAGATTGAGGATTAGTCCAACTTTTTGGTGGGCAGATCAGAATCCTCTC‑TTTTTTAGTATCTACCAGTTGGTATGTGTGGCTCGTAAATGTCAAAACTCTTGTGTTTATTTTGATTATAGTCAAAATATATTGTTGTTGTGTTTTGATTATAGTTGTGTTACCTTGCTCGAGTTTGTAAATTTTGAATAGGAGTGTAAATTATGCTAACAACAGAAAGAAAAGCCCAAATGGTTGAAAGTTTGAAAAAAGATTATGTGGTTTTAACGGACATTGTCTGTGAGGT > 1/1029332‑1029808 | aTTGAAGAGATCTTTAATTGGTGATAAATAGAGCTTGCCTTCATCGCATTTAAATTCAATCACATCGGTGACCCATTTTTCATTAGGTTTCGTCGCACTAAAATCCCGCTGTAACAGATTGTCTGCAATCTTACCGACTTCGCCTTGATAAGAACGATATTTTCGCCGTTTGCATTTTCCCTTCAAACCTTAGTAGATTGAGGATTAGTCCAACTTTTTGGTGGGCAGATCAGAATCCTCTC‑tttttttag < 1:779096/251‑4 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |