| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,221,083 | (G)8→7 | intergenic (+61503/+199854) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,221,076 | 0 | G | . | 100.0% | 218.8 / NA | 52 | intergenic (+61496/+199861) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (27/25); total (27/25) | |||||||||||
GTCGTTTCCTCATATTTTTGAAATGGGAGTTTCATTCTAGCGGATTCACTCCATCAAAACCGTGATTGAGATCATAATTTACGCCGATGGTACGGCTGGGCGTGGAAAGTGCGGTGTTTTTTTACGATGAATTTTAAACGATAGCGCACAAGCGTCCACACTTGTGCTGAAAATATATATTTGTAGAAATAAAAAAGTACAAGTGAAAAACGCTTGCGTCAGCAGGGGGGGGCTATGGGAAATTTCCTAATTACATAAAAATATATTAATAAAAAACTGTTCTATAATTTTGACTGTACTTTTTGTTCAATGTAATATGATGTATCTCAACGGTTGTACTAAAGACTTGGAGGTTATATATGATGGCTACACTGAAACGTTTAGTTGATTTAAGTATTGTCTCTCGTGTATTGCAAAATCCAACAGAGTATTCCGATATACATAATGGATTTGTTAAAGAT > 1/1220852‑1221312 | gTCGTTTCCTCATATTTTTGAAATGGGAGTTTCATTCTAGCGGATTCACTCCATCAAAACCGTGATTGAGATCATAATTTACGCCGATGGTACGGCTGGGCGTGGAAAGTGCGGTGGTTTTTTACGATGAATTTTAAACGATAGCGCACAAGCGTCCACACTTGTGCTGAAAATATATATTTGTAGAAATAAAAAAGTACAAGTGAAAAACGCTTGCGTCAGCA‑GGGGGGGCTATGGGAAATTTCCTAAtt > 1:638546/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |