| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 4 | 499 | 2 bp→TG | coding (102‑103/429 nt) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 4 | 499 | 0 | C | T | 100.0% | 257.7 / NA | 95 | G35S (GGT→AGT) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (56/39); total (56/39) | |||||||||||
| * | 4 | 500 | 0 | A | G | 100.0% | 274.5 / NA | 95 | D34D (GAT→GAC) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (56/39); total (56/39) | |||||||||||
CCGCTACGCAACCAAATACCAAACGTCATGTTTGGCTGAGAGAGCGTCATGTAGATAAAGCTCGCTACGTTGCCATAACAAAAAGCGATAATCAGCGAGATTAACACAATCGCCACCATATTATAGCGCGTATAGCGATAAATTTTTGTCCACAGTGCAATCAAAAAAGCGGGCACGGTTGCCACGATAAAAGTCGATAACAGACTAAAAAGGATCACGTCGGCAGTGCCGAGCAAACCATCAGTATTGTCATCCACACAAATGCTGACGATGGTGCCGATAAGTTGAGCAAGCAGAGGAAATATAACCAATGTTTTAATATAAGGATAATTAGGCGACATAGGGTTCCCGAGTAAAAAAATAGGCTACCGGAGGTAGCCCATTGTAGAGGAATTTTTCAGCTTATGCAGATTTTTTTGCACGTAATACGCGAGAGGTGAAAATCACGATGCCGAGAACAAAGACGATTAAACCCAGCAC > 4/261‑740 || ccgcTACGCAGCCAAATACCAAACGTCATGTTTGGCTGAGAGAACGTCATGTAGATAAAGCTAGCTACGTTGCCATAACAAAAAGCGATAATCAGCGAGATTAACACAATCGCCATCATGTTATAGCGCGTATAGCGATAAATTTTTGTCCACAGTGCAATCAAAAAAGCGGGCACGGTTGCCACGATAAAAGTCGATAACAGACTAAAAAGGATCACGTCGGCAGTGCCGAGCAAACTGTCAGTATTGt < 1:370942/250‑1 (MQ=255) 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CCGCTACGCAACCAAATACCAAACGTCATGTTTGGCTGAGAGAGCGTCATGTAGATAAAGCTCGCTACGTTGCCATAACAAAAAGCGATAATCAGCGAGATTAACACAATCGCCACCATATTATAGCGCGTATAGCGATAAATTTTTGTCCACAGTGCAATCAAAAAAGCGGGCACGGTTGCCACGATAAAAGTCGATAACAGACTAAAAAGGATCACGTCGGCAGTGCCGAGCAAACCATCAGTATTGTCATCCACACAAATGCTGACGATGGTGCCGATAAGTTGAGCAAGCAGAGGAAATATAACCAATGTTTTAATATAAGGATAATTAGGCGACATAGGGTTCCCGAGTAAAAAAATAGGCTACCGGAGGTAGCCCATTGTAGAGGAATTTTTCAGCTTATGCAGATTTTTTTGCACGTAATACGCGAGAGGTGAAAATCACGATGCCGAGAACAAAGACGATTAAACCCAGCAC > 4/261‑740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |