| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 2 | 164,387 | 2 bp→CA | intergenic (‑69/+826) | unknown ← / ← unknown | Integrase/Uncharacterized protein YnbE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 164,387 | 0 | T | C | 100.0% | 277.7 / NA | 95 | intergenic (‑69/+827) | unknown/unknown | Integrase/Uncharacterized protein YnbE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (44/51); total (44/51) | |||||||||||
| * | 2 | 164,388 | 0 | G | A | 100.0% | 255.0 / NA | 95 | intergenic (‑70/+826) | unknown/unknown | Integrase/Uncharacterized protein YnbE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (44/51); total (44/51) | |||||||||||
TTCTTTGGTTGCGTGAAAGGCTTGTAATAGTTAAACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAACGGCGTGATTGTGCGTGCCATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGGTAGGAACGCTTAGGATATAAAAAAGCCCTTGAGGTTAATATTTTCAAGGGCTTTTGGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGATTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGT > 2/164152‑164624 || ttcaccacaagcctttaaaaaactgaaacgggaaACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAGCGGTGTGATTGTGCGTGCCATATCGCTTAGTTCTGAGAGTTGAAAATTATTCTGAATAACTCTGACGGCAATTCAGACTTTTAAAAAATCAGGTATAGCTaaaa > 1:843830‑M2/35‑250 (MQ=255) 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TTCTTTGGTTGCGTGAAAGGCTTGTAATAGTTAAACCGCCATAACTTAGCCCCATTGGGTTTAACCAACAGATAAAGCCCTTTGCCATCGGATA‑GGGTAAATTCCTTTTCCTGCGGCTTGGCTTTGTCTATTTTCGTGCTGTTTAACGGCGTGATTGTGCGTGCCATATTGCTTCTTTCTGAGAGTTGAAAACTGTTCTAAATAACTCCGACGGAGATTCAGACTTTTAAAAATTTGGATATAGCTAAAACATGAGCAAAACCTTTTGCTAACAGGTTTTGTATGGTTTTAGTTATACCGATTTTGTTATACGGCTATCAGTATAACTAAACGTATAACTAAAATTCAAGGATTTTATAGGATTGGGTAGGAACGCTTAGGATATAAAAAAGCCCTTGAGGTTAATATTTTCAAGGGCTTTTGGGATTTGATAAGTTTGCTTTGGATTGTTATTTGGTGGAGCTGGGGGGAGT > 2/164152‑164624 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |