| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,486,683 | 2 bp→GA | coding (612‑613/762 nt) | unknown → | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,486,683 | 0 | A | G | 100.0% | 181.2 / NA | 66 | L204L (TTA→TTG) | unknown | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (30/36); total (30/36) | |||||||||||
| * | 1 | 1,486,684 | 0 | G | A | 100.0% | 176.2 / NA | 66 | V205I (GTA→ATA) | unknown | Flp pilus assembly protein TadD, contains TPR repeat |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (30/36); total (30/36) | |||||||||||
AATCCTAATAAAGCCAACGAAGATATAAATAAAGCCCGCGAGTATTTTTTAAACGATGCTGTAGCGGTAAACAATCTTGCTATGCTAAGTATCGTCAACGGAGATTATCGTAATGCCGTTTCATTGTTATTACCTCAGTATTTAAATGGGGTTAGGGAACAGCGTTTAGTACACAATCTAATCTTTGCTTTAATCAAAAATAATGACATTGATTACGCAAAAGATATTATTGTGAAGGAAAACATTAATACATCTCCTGATGATTTAATTAATGCTCTCAAAAAAACTGAACGCGTATCTAATAATATCGCCAGATAAAAAAAGGTTCTAT‑AATGAAAAAATTCCTATCGAATAAGAAGGGAGCATCAACCGTTGAGTTTGCCTTGACGGTTGTATTTTATTTC > 1/1486516‑1486919 || aaTCCAAATAAAGCGAACGAAGATATTAACAAAGCACGAGAATATTTCTTAAATGATGCAGTGGCAGTAAATAATATGGCTATGCTAAGTATCATTAATGGAGATTATCGTAATGCTGTTTCATTATTATTGCCTCAGTATTTAAATGGAGTTAGGGAACAGCGTTTGATACACAATCTAGTCTTTGCTTTAGTCAAGAATAACGAAATTGATTACGCAAAAGATATTATTGTGAAGGAAAACATTaacac < 1:276481/251‑4 (MQ=255) aTCCAAATAAAGCGAACGAAGATATTAACAAAGCACGAGAATATTTCTTAAATGATGCAGTGGCAGTAAATAATATGGCTATGCTAAGTATCATTAATGGAGATTATCGTAATGCTGTTTCATTATTATTGCCTCAGTATTTAAATGGAGTTAGGGAACAGCGTTTGATACACAATCTAGTCTTTGCTTTAGTCAAGAATAACGAAATTGATTACGCAAAAGATATTATTGTGAAGGAAAACATTAAcaca > 1:702045/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |