| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,483,687 | 2 bp→TC | coding (636‑637/1281 nt) | unknown → | Type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF, TadA subfamily |
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| * | 1 | 1,483,688 | 0 | T | C | 100.0% | 220.5 / NA | 76 | L213L (TTA→CTC) | unknown | Type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF, TadA subfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (34/42); total (34/42) | |||||||||||
GTAGTCCACTAGTGGACTCCCGACTACCTGATGGCAGCCGTTTAAATGTTGTTATTGCACCGATTGCATTAGATGGCACATCCATTTCTATTCGTAAATTCAGTAAGAATAAAAAAACATTGCAAGAGCTTGTAAATTTTGGTTCTATGACTCGCGAAATGGCGAATTTCTTAATTATTGCTGCCAGATCCCGGGTAAATATAATTGTGTCAGGTGGTACAGGATCTGGTAAAACAACCTTACTTAATGCGCTATCTAACTATATTTCCCATACCGAACGTGTCATCACACTAGAAGATACTGCCGAGCTGCGTTTGGAACAGCCTCATGTTGTACGCCTGGAAACGCGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAAGTTACTATGCAAGACTTAGTAATAAATGCATTGCGTATGCGTCCTGAGCGTATTATTGTGGGCGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAAATGTTACAAG > 1/1483449‑1483925 || gTAGTCCACTAGTGGACTCCCGACTACCCGATGGTAGCCGTTTAAATGTTGTAATTGCACCGATTGCGTTAGATGGTACATCCATTTCCATTCGTAAGTTCAGTAAGAGTAAAAAAAGCTTGCAAGAGCTTGTAAATTTCGGTTCTATGACCCGCGATATGGCAAATTTTTTAATTATCGCTGCCAGATCTCGAGTAAATATAATTGTGTCAGGTGGTACAGGATCCGGTAAAACAACTCTCCTTAATgc < 1:635676/250‑1 (MQ=255) 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gtACAGGATCCGGTAAAACAACTCTCCTTAATGCGCTATCTAATTATATTTCCCATACCGAACGTGTCATCACATTAGAAGATACTGCTGAATTGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCag > 1:334492/1‑250 (MQ=255) tACAGGATCCGGTAAAACAACTCTCCTTAATGCGCTATCTAATTATATTTCCCATACCGAACGTGTCATCACATTAGAAGATACTGCTGAATTGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCaga < 1:494249/251‑3 (MQ=255) atccggTAAAACAACTCTCCTTAATGCGCTATCTAATTATATTTCCCATACCGAACGTGTCATCACATTAGAAGATACTGCTGAATTGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTAc < 1:245260/247‑1 (MQ=255) cggTAAAACAACTCTCCTTAATGCGCTATCTAATTATATTTCCCATACCGAACGTGTCATCACATTAGAAGATACTGCTGAATTGCGTTTGGAACAACCTCATGTTGTACGCCTTGAAACACGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAGGTTACTATGCAGGATTTAGTAATAAATGCACTACGTATGCGTCCTGAGCGTATTATCGTAGGTGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAGATGTTACAAg < 1:205371/250‑1 (MQ=255) || GTAGTCCACTAGTGGACTCCCGACTACCTGATGGCAGCCGTTTAAATGTTGTTATTGCACCGATTGCATTAGATGGCACATCCATTTCTATTCGTAAATTCAGTAAGAATAAAAAAACATTGCAAGAGCTTGTAAATTTTGGTTCTATGACTCGCGAAATGGCGAATTTCTTAATTATTGCTGCCAGATCCCGGGTAAATATAATTGTGTCAGGTGGTACAGGATCTGGTAAAACAACCTTACTTAATGCGCTATCTAACTATATTTCCCATACCGAACGTGTCATCACACTAGAAGATACTGCCGAGCTGCGTTTGGAACAGCCTCATGTTGTACGCCTGGAAACGCGTTTAGCCGGCGTTGAGCATACAGGCGAAGTTACTATGCAAGACTTAGTAATAAATGCATTGCGTATGCGTCCTGAGCGTATTATTGTGGGCGAATGCCGTGGTGGAGAAGCATTCCAAATGTTACAAG > 1/1483449‑1483925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |