| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,478,758 | 2 bp→GT | coding (49‑50/429 nt) | unknown → | Type IV prepilin peptidase TadV/CpaA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,478,758 | 0 | A | G | 100.0% | 242.1 / NA | 84 | T17V (ACT→GTT) | unknown | Type IV prepilin peptidase TadV/CpaA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (50/34); total (50/34) | |||||||||||
| * | 1 | 1,478,759 | 0 | C | T | 100.0% | 229.5 / NA | 84 | T17V (ACT→GTT) | unknown | Type IV prepilin peptidase TadV/CpaA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (50/34); total (50/34) | |||||||||||
GTTTTACAGAAATCGACAAGGGATTACTTCTGTTGAGTATGGGCTAATTGCTGTGGCTATTGCTGTTTTTGTAGTCGCCGTTTTAGTCGAGGATAACAGCTTTATTAAGGCGTTGTCAGGTAAGTTCTCGGATTTAACGACCACTGTCTCTGACGCCATAGTTAGCAAAAGTAGCTAAGAAAAATGATAAAAAAATGAACTGGCTTATTAATACTTTAGTAGTCATAACGATCTTACTGCTGACTACTTTATCTGTAACTGACATTCGTTCTCGGATTATTAGTAACCGAGTCGTTTTGTTTCTGTTATTCGTCATTATTCCGTTCAGTTTATTAAAATATCAGACTATCTTTGTTATTCCCGCCTTATGTACACTTATTATCGGATTTTTACTGTTTTCTTTGCACTTCATAGGTGCAGGAGATATTAAGCTTGCTTCGGTGCTAATGCTAGCCGTTCCAAGTGACGAAATT > 1/1478516‑1478988 || gTTTTACAGAAATCGACAAGGGATTACTTCTGTTGAGTATGGGTTAATTGCTGTGGCTATTGCTGTTTTTGTAGTCGCCGTTTTAGTCGGGGATAACAGCTTTATTAAGGCAGTGTCAGGTAAGTTCTCGGATTTAACGACCACTGTCACTGACGCCATAGTTAGCAAAAGTAGCTAAGAAAAATGAT‑AAAAAATGAACTGGCTTATTAACGCTTTAGTAATCATAACGCTCTCGCTGCTGGTTACTTTAt > 1:366220/1‑251 (MQ=255) 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GTTTTACAGAAATCGACAAGGGATTACTTCTGTTGAGTATGGGCTAATTGCTGTGGCTATTGCTGTTTTTGTAGTCGCCGTTTTAGTCGAGGATAACAGCTTTATTAAGGCGTTGTCAGGTAAGTTCTCGGATTTAACGACCACTGTCTCTGACGCCATAGTTAGCAAAAGTAGCTAAGAAAAATGATAAAAAAATGAACTGGCTTATTAATACTTTAGTAGTCATAACGATCTTACTGCTGACTACTTTATCTGTAACTGACATTCGTTCTCGGATTATTAGTAACCGAGTCGTTTTGTTTCTGTTATTCGTCATTATTCCGTTCAGTTTATTAAAATATCAGACTATCTTTGTTATTCCCGCCTTATGTACACTTATTATCGGATTTTTACTGTTTTCTTTGCACTTCATAGGTGCAGGAGATATTAAGCTTGCTTCGGTGCTAATGCTAGCCGTTCCAAGTGACGAAATT > 1/1478516‑1478988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |