| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,478,060 | 2 bp→GG | intergenic (‑644/‑104) | unknown ← / → unknown | Metal‑dependent hydrolase YbeY, involved in rRNA and/or ribosome maturation and assembly/Flp pilus assembly protein, pilin Flp |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,478,060 | 0 | A | G | 100.0% | 35.3 / NA | 15 | intergenic (‑644/‑105) | unknown/unknown | Metal‑dependent hydrolase YbeY, involved in rRNA and/or ribosome maturation and assembly/Flp pilus assembly protein, pilin Flp |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (7/8); total (7/8) | |||||||||||
| * | 1 | 1,478,061 | 0 | C | G | 100.0% | 35.7 / NA | 15 | intergenic (‑645/‑104) | unknown/unknown | Metal‑dependent hydrolase YbeY, involved in rRNA and/or ribosome maturation and assembly/Flp pilus assembly protein, pilin Flp |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (7/8); total (7/8) | |||||||||||
CGCGACATCTCTAAATCCACACATATTTAAGTATTTTTTGTAATTAAAGTTAAAAGTTGTAAATTTACTGTAAAATCAATAGGGAAAGTAGAAATAGCTCATTTACAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAA‑TTTTCGCAATCACAATACATACATATACGTAGTGAATTTATTATTCT‑AAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTATAATGCCACTCGTTTATTTAATTCCACAAGATTATTAAATAAATGACATTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACAATGTTAAATACCTTAATTACGAAAGCATACATCAAAGCAACCGAAGCAATCCGTTCTTTCAAAAAAAATCAAGCAGGTGTGACTGCAATTGAATACGGTTTGATCGCCATTGCTGTTGCCGTGTTAATC > 1/1477839‑1478293 || cgcgATATCTCTAAATCCACACATATTTAAGT‑GTTTTTGTAATTAAAGTTAAAAGTTGTAAATTTACTGTAAAATCAATAGAGAAAGTAGAAATAGCTCATTTACAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCttatta < 1:354355/251‑1 (MQ=255) tCAATAGAGAAAGTAGAAATAGCTCATTTACAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGAc < 1:225005/251‑1 (MQ=255) tACAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACAATGTTAAATACTTTAACTACTAAAGCa > 1:484344/1‑251 (MQ=255) cAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAg < 1:151415/140‑1 (MQ=255) cccTTAACATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAg < 1:497732/213‑1 (MQ=255) aaCATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGAc > 1:199993/1‑210 (MQ=255) tacatatacataGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACAATGTTAAATAc > 1:382401/1‑182 (MQ=255) cataTACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCcaca > 1:744965/1‑85 (MQ=255) cataTACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACac < 1:693226/106‑2 (MQ=255) cataTACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGAc > 1:566836/1‑168 (MQ=255) cataTACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACAATGTTAAATACTTTAACTACTAAAGCATACATCAAAGCAGCTGAAGCAATCCGTTCTTTCAGAGAAAATCAAGCAGGTGTGa > 1:110562/1‑251 (MQ=255) tataCATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACac > 1:666090/1‑103 (MQ=255) attCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACaa < 1:568183/149‑1 (MQ=255) tttCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACAATGTTAAATACTTTAACTACTAAAGCATACATCAAAGCAGCTGAAGc < 1:424453/169‑1 (MQ=255) tttCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACAATGTTAAATACTTTAACTACTAAAGCATACATCAAAGCAGCTGAAGCAATCCGTTCTTTCAGAGAAAATCAAGCAGGTGTGACTGCAATTGAATATGGTTTGATCGCTATTGCTGTTGCCGTGTTAATc < 1:625438/251‑1 (MQ=255) || CGCGACATCTCTAAATCCACACATATTTAAGTATTTTTTGTAATTAAAGTTAAAAGTTGTAAATTTACTGTAAAATCAATAGGGAAAGTAGAAATAGCTCATTTACAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAA‑TTTTCGCAATCACAATACATACATATACGTAGTGAATTTATTATTCT‑AAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTATAATGCCACTCGTTTATTTAATTCCACAAGATTATTAAATAAATGACATTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACAATGTTAAATACCTTAATTACGAAAGCATACATCAAAGCAACCGAAGCAATCCGTTCTTTCAAAAAAAATCAAGCAGGTGTGACTGCAATTGAATACGGTTTGATCGCCATTGCTGTTGCCGTGTTAATC > 1/1477839‑1478293 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |