| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,473,316 | 2 bp→TT | coding (170‑171/3459 nt) | unknown ← | Transcription‑repair coupling factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,473,316 | 0 | C | T | 100.0% | 285.4 / NA | 103 | A57E (GCG→GAA) | unknown | Transcription‑repair coupling factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (58/45); total (58/45) | |||||||||||
| * | 1 | 1,473,317 | 0 | G | T | 100.0% | 283.5 / NA | 103 | A57E (GCG→GAA) | unknown | Transcription‑repair coupling factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (58/45); total (58/45) | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CCTTTATTAATCAACAATACGTTATGCTGCAAATAAGACGGCGGGCAAACCCGTTGCATTAAGGTGGCGACAGGTAAAATGAAAATGCCTTGTTTGCGCTGTTGCAAATGAAACAAAGCGCTCAAGCGCGCGGAAATAATATCTTGATGAGGCGAAAAACTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGTCAGTTGCGTTAATTCTTTCGCCAAACGCACCGCACTTCGGGTGTCATTGGTCACCACCACGGTTAGACCGTCAAACTGCGCGGCAATTTCGCTAATGGCGAGGCTATCCGCACCGGGCAGGATATTGGCTAAAATTTTATGATCATTCGCTTGGGTAGGAATTTCGAGATGAAAAAATTGAGTTTGCATAAAACGACAAAAGAGTAAGAAAAAAATTGCCGTTAGTTTAGCGCAAACGAGGGGGATTTCCAATAAAGATC > 1/1473074‑1473557 || ccTTTATTAATCAACAATACGTTATGCTGCAAATAAGACGGCGGGCAAACCCGTTGCATTAAAGTGGCGACAGGTAAAATGAAAATGCCTTGTTTGCGCTGTTGCAAATGAAACAAAGCGCTCAAGCGCGCGGAAATAATATCTTGATGAGGCGAAAAACTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAAcg > 1:207399/1‑251 (MQ=255) ttattaATCAACAATACGTTATGCTGCAAATAAGACGGCGGGCAAACCCGTTGCATTAAAGTGGCGACAGGTAAAATGAAAATGCCTTGTTTGCGCTGTTGCAAATGAAACAAAGCGCTCAAGCGCGCGGAAATAATATCTTGATGAGGCGAAAAACTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAAcgca > 1:650386/1‑250 (MQ=255) attaATCAACAATACGTTATGCTGCAAATAAGACGGCGGGCAAACCCGTTGCATTAAAGTGGCGACAGGTAAAATGAAAATGCCTTGTTTGCGCTGTTGCAAATGAAACAAAGCGCTCAAGCGCGCGGAAATAATATCTTGATGAGGCGAAAAACTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAAcgcaccg > 1:473061/1‑251 (MQ=255) aaTCAACAATACGTTATGCTGCAAATAAGACGGCGGGCAAACCCGTTGCATTAAAGTGGCGACAGGTAAAATGAAAATGCCTTGTTTGCGCTGTTGCAAATGAAACAAAGCGCTCAAGCGCGCGGAAATAATATCTTGATGAGGCGAAAAACTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAAcgcaccgcac < 1:378112/251‑1 (MQ=255) aaTCAACAATACGTTATGCTGCAAATAAGACGGCGGGCAAACCCGTTGCATTAAAGTGGCGACAGGTAAAATGAAAATGCCTTGTTTGCGCTGTTGCAAATGAAACAAAGCGCTCAAGCGCGCGGAAATAATATCTTGATGAGGCGAAAAACTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAAcgcaccgcac < 1:85694/251‑1 (MQ=255) caacaaTACGTTATGCTGCAAATAAGACGGCGGGCAAACCCGTTGCATTAAAGTGGCGACAGGTAAAATGAAAATGCCTTGTTTGCGCTGTTGCAAATGAAACAAAGCGCTCAAGCGCGCGGAAATAATATCTTGATGAGGCGAAAAACTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGCCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAACGCACCGCACtt > 1:541702/1‑250 (MQ=255) acaaTACGTTATGCTGCAAATAAGACGGCGGGCAAACCCGTTGCATTAAAGTGGCGACAGGTAAAATGAAAATGCCTTGTTTGCGCTGTTGCAAATGAAACAAAGCGCTCAAGCGCGCGGAAATAATATCTTGATGAGGCGAAAAACTATCATAAGGCAGGGTTTCCCAATCGGGGAAAAAAGTCACGTTTTGCAATAATTCGGAAGGCGCCAGTTGCTTTAATTCTTTTTCCAAACGCACCGCACTTCgg > 1:348723/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |