| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,070,112 | 2 bp→GA | intergenic (+8/‑812) | unknown → / → unknown | Type II secretory pathway, component PulD/Bacterial non‑heme ferritin (EC 1.16.3.2) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,070,112 | 0 | C | G | 100.0% | 147.4 / NA | 54 | intergenic (+8/‑813) | unknown/unknown | Type II secretory pathway, component PulD/Bacterial non‑heme ferritin (EC 1.16.3.2) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (25/29); total (25/29) | |||||||||||
| * | 1 | 1,070,113 | 0 | C | A | 100.0% | 151.0 / NA | 54 | intergenic (+9/‑812) | unknown/unknown | Type II secretory pathway, component PulD/Bacterial non‑heme ferritin (EC 1.16.3.2) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (25/29); total (25/29) | |||||||||||
ACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTCCGCTTGC‑GG‑AAAATGCAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAATAATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTGTTGCGCG‑CTGATGATTTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGGCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACACTTCTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTA > 1/1069907‑1070336 || acacTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTaaac < 1:828510/251‑2 (MQ=255)acacTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTCTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTaaac < 1:639394/251‑2 (MQ=255) cacTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTaaacc < 1:119271/251‑3 (MQ=255) acTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTaaacca < 1:283417/251‑4 (MQ=255) taAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTc < 1:21991/251‑1 (MQ=255) 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gTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTgcgcgtacctaaatttaatcgag > 1:322230/1‑233 (MQ=255) gTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTgcgcgtacctaaat < 1:275550/242‑10 (MQ=255) tCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTATTTTTGAGCAAGCTCA‑AAAATGTAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAACCATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTTTTgcgcgtacctaaatttaatcgagaa > 1:203027/1‑231 (MQ=255) 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ACACTTATAAAACGCGACATTGTCACAGATGTAAGTGTAAAAAATGGCGATGTGATTGTTCTTGGTGGTCTGGCTGAAAATAAAATAACGGAAGGTGAAACAGGTTTTTCATTTCTTCCTAAAGGTTTTTTAACGGGAAAATCCAAAAATGATACTAAGACAGATATAGTGATTTTACTCCAAGTGAAACTTGTCTAACTA‑TTTTCCGCTTGC‑GG‑AAAATGCAGGGCGAAGGCTTGCAGCCCGGTAAATAATGCTCGATGTTATTCGGGCATTTTTATTTGTTGCGCG‑CTGATGATTTTAATCGAGAAATGAAAATTTCCCGCCCCTGCAAATACCCCTAAAGGCACGTAATAACTGCTGATTAGATAATGCGATACGTGCTTGAATTTATGCTTACACTTCTAAATAAGTCTTGATAAATCAATATTTA > 1/1069907‑1070336 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |