| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 898,437 | C→T | L175L (TTG→TTA) | unknown ← | UDP‑glucose 4‑epimerase (EC 5.1.3.2) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 898,437 | 0 | C | T | 100.0% | 235.4 / NA | 88 | L175L (TTG→TTA) | unknown | UDP‑glucose 4‑epimerase (EC 5.1.3.2) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (43/45); total (43/45) | |||||||||||
ATCCGGCATCATCTTGATGGCGTGCCAAGGCTTTAACGTGACCGATAGCCAAATCCACCACGTGGATATAATCGCGCACCCCGGTGCCGTCGTGCGTATCATAGTCGCTACCGAACACGGAAAGCTGCGGTAGCTTGCCGATGGCGACTTGGCTGATGTAAGGTAACAAATTGTTCGGGATCCCGTTCGGATCTTCCCCCATTAAACTGCTGGCGTGCGCACCTACCGGGTTGAAGTAGCGCAAAATCGTCATGCTGAATTTCGGTTCTGCCTTGGCAATATCGTGCAGGATTTGTTCCACCATGTATTTGGAAGTGCCGTATGGATTGGTGGTGCCGCCTACTTCGCAATCTTCGGTAATCGGGATTACTTTTGGATCGCCGTAAACCGTAGCAGAGGAGCTGAATACGAAATTCCACACACCGGCTTTTTTCATTTCCTGTACCAATACCAAGGAACCGGTGATGTTATTCAAATAATATTCCGC > 1/898196‑898682 | aTCCGGCATCATCTTGATGGCGTGCCAAGGCTTTAACGTGACCGATAGCCAAATCCACCACGTGGATATAATCGCGCACCCCGGTGCCGTCGTGCGTATCATAGTCGCTACCGAACACGGAAAGCTGCGGTAGCTTGCCGATGGCGACTTGGCTGATGTAAGGTAACAAATTGTTCGGGATCCCGTTCGGATCTTCCCCCATTAAACTGCTGGCGTGCGCACCTACCGGGTTGAAGTAGCGTAAAATCGt > 1:838112/1‑250 (MQ=255) tcTTGATGGCGTGCCAAGGCTTTAACGTGACCGATAGCCAAATCCACCACGTGGATATAATCGCGCACCCCGGTGCCGTCGTGCGTATCATAGTCGCTACCGAACACGGAAAGCTGCGGTAGCTTGCCGATGGCGACTTGGCTGATGTAAGGTAACAAATTGTTCGGGATCCCGTTCGGATCTTCCCCCATTAAACTGCTGGCGTGCGCACCTACCGGGTTGAAGTAGCGTAAAATCGTCATGCTGAAttt > 1:787249/1‑251 (MQ=255) tcTTGATGGCGTGCCAAGGCTTTAACGTGACCGATAGCCAAATCCACCACGTGGATATAATCGCGCACCCCGGTGCCGTCGTGCGTATCATAGTCGCTACCGAACACGGAAAGCTGCGGTAGCTTGCCGATGGCGACTTGGCTGATGTAAGGTAACAAATTGTTCGGGATCCCGTTCGGATCTTCCCCCATTAAACTGCTGGCGTGCGCACCTACCGGGTTGAAGTAGCGTAAAATCGTCATGCTGAAttt > 1:560709/1‑251 (MQ=255) tGCCAAGGCTTTAACGTGACCGATAGCCAAATCCACCACGTGGATATAATCGCGCACCCCGGTGCCGTCGTGCGTATCATAGTCGCTACCGAACACGGAAAGCTGCGGTAGCTTGCCGATGGCGACTTGGCTGATGTAAGGTAACAAATTGTTCGGGATCCCGTTCGGATCTTCCCCCATTAAACTGCTGGCGTGCGCACCTACCGGGTTGAAGTAGCGTAAAATCGTCATGCTGAATTTCGGTTCTGCCt < 1:559336/251‑1 (MQ=255) ggCTTTAACGTGACCGATAGCCAAATCCACCACGTGGATATAATCGCGCACCCCGGTGCCGTCGTGCGTATCATAGTCGCTACCGAACACGGAAAGCTGCGGTAGCTTGCCGATGGCGACTTGGCTGATGTAAGGTAACAAATTGTTCGGGATCCCGTTCGGATCTTCCCCCATTAAACTGCTGGCGTGCGCACCTACCGGGTTGAAGTAGCGTAAAATCGTCATGCTGAATTTCGGTTCTGCCTTGGCaa > 1:599143/1‑251 (MQ=255) ggCTTTAACGTGACCGATAGCCAAATCCACCACGTGGATATAATCGCGCACCCCGGTGCCGTCGTGCGTATCATAGTCGCTACCGAACACGGAAAGCTGCGGTAGCTTGCCGATGGCGACTTGGCTGATGTAAGGTAACAAATTGTTCGGGATCCCGTTCGGATCTTCCCCCATTAAACTGCTGGCGTGCGCACCTACCGGGTTGAAGTAGCGTAAAATCGTCATGCTGAATTTCGGTTCTGCCTTGGCaa > 1:383961/1‑251 (MQ=255) gCTTTAACGTGACCGATAGCCAAATCCACCACGTGGATATAATCGCGCACCCCGGTGCCGTCGTGCGTATCATAGTCGCTACCGAACACGGAAAGCTGCGGTAGCTTGCCGATGGCGACTTGGCTGATGTAAGGTAACAAATTGTTCGGGATCCCGTTCGGATCTTCCCCCATTAAACTGCTGGCGTGCGCACCTACCGGGTTGAAGTAGCGTAAAATCGTCATGCTGAATTTCGGTTCTGCCTTGGCAat > 1:124531/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |