| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 894,837 | T→G | intergenic (+49/‑188) | unknown → / → unknown | N‑acetylglucosamine‑6P‑responsive transcriptional repressor NagC, ROK family/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 894,837 | 0 | T | G | 100.0% | 231.1 / NA | 81 | intergenic (+49/‑188) | unknown/unknown | N‑acetylglucosamine‑6P‑responsive transcriptional repressor NagC, ROK family/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (41/40); total (41/40) | |||||||||||
AAATTACGCAAGCGAAGAATGTATTATTCGCGGCAATTCGTCGTACATTGGAAAGCCATGCATTGCCTGCATTTGTACAAAATACGCCATTGGTTACATCGGAATTAAGCAATGAAGATGTAATAGGCGCCTTTGCGTTAATTAAAAGGGCGTTATTTGACGGCAGTTTATTGCGTCGTTTAATTGAAGAATAAGCGTTTACAGCCTTAAAGTGCGGTGATAAAAAATAGTGTTTTTTAAATTTTGGTTTGCCAAT‑‑‑GGCGCCAAGGGAATGAGCAAGTTTGTAGGGACTTGTGAATAAAATTAAGGCGATTTGTTTAATCTATATCCGAATATCTTAATTTTATTTGTTTTCCGAAAAAAATGGTTGACGAGTAAAGGCAATATCCGCATAATACGCCCCGCAAAGTCAATGAGATGGTTGCAAAGAAATGGCTATGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACAACACTCATAATGTTGGGGTC > 1/894595‑895073 | aaaTTACGCAAGCGAAGAATGTATTATTCGCGGCAATTCGTCGTACATTGGAAAGCCATGCATTGCCTGCATTTGTACAAAATACGCCATTGGTTACATCGGAATTAAGCAATGAAGATGTAATAGGCGCCTTTGCGTTAATTAAAAGGGCGTTATTTGACGGCAGTTTATTGCGTCGTTTAATTGAAGAATAAGCGTTTACAGCCTTAAAGTGCGGTGATAAAAAATAGTGTTTTTTAAATGTTGGTTTg > 1:527914/1‑251 (MQ=255) 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1:431579/1‑142 (MQ=255) cGTTTACAGCCTTAAAGTGCGGTGATAAAAAATAGTGTTTTTTAAATGTTGGTTTGCCAATGGCGGCGCCAAGGGAATGAGCAAGTTTGTAGGGACTTGTGAATAAAATTAAGGCGATTTGTTTAATCTATATCCGAATATCTTAATTTTATTTGTTTTCCGAAAAAAATGGTTGACGAGTAAAGGCAATATc < 1:291367/193‑1 (MQ=255) cGTTTACAGCCTTAAAGTGCGGTGATAAAAAATAGTGTTTTTTAAATGTTGGTTTGCCAAT‑‑‑GGCGCCAAGGGAATGAGCAAGTTTGTAGGGACTTGTGAATAAAATTAAGGCGATTTGTTTAATCTATATCCGAATATCTTAATTTTATTTGTTTTCCGAAAAAAATGGTTGACGAGTAAAGGCAATATCCGCATAATAc > 1:688622/1‑200 (MQ=255) tttACAGCCTTAAAGTGCGGTGATAAAAAATAGTGTTTTTTAAATGTTGGTTTGCCAAT‑‑‑GGCGCCAAGGGAATGAGCAAGTTTGTAGGGACTTGTGAATAAAATTAAGGCGATTTGTTTAATCt < 1:416470/124‑1 (MQ=255) cAGCCTTAAAGTGCGGTGATAAAAAATAGTGTTTTTTAAATGTTGGTTTGCCAAT‑‑‑GGCGCCAAGGGAATGAGCAAGTTTGTAGGGACTTGTGAATAAAATTAAGGCGATTTGTTTAATCTATATCCGATTATCTTAATTTTATTTGTTTTCCGAAAAAAATGGTTGACGAGTAAAGGCAATATCCGCATAATACGCCCCGCAAAGTCAATGAGATGGTTGCAAAGAAATGGCTATGTAGCTCAGTTGGTTa > 1:681570/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |