| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 92,894 | G→A | intergenic (‑222/+267) | unknown ← / ← unknown | Catalase KatE (EC 1.11.1.6)/NADP‑specific glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.4) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 92,894 | 0 | G | A | 100.0% | 127.7 / NA | 46 | intergenic (‑222/+267) | unknown/unknown | Catalase KatE (EC 1.11.1.6)/NADP‑specific glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.4) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (18/28); total (18/28) | |||||||||||
ACATAATCGTTTCCTTAATTTTTGAGTAGTAGAGTAAAAAATATCCATTTTCATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGACGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCGGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCTGCACTGCACAGGGCTCAAATTGTTTAACTTAAGCTTAATTACGCTCCTCAATAATAACGAATATATTCATCGTCCGCCCGGGTTCATCATGTAGTTAAACCGGCGGGAATAAAAATATTCCGATTAAATAATGTTTTCCTATAAAAACCTGCATTTTAATTGATTGGCGGCGGCGTCCTCTTTGGGAGGGCAGATCAAAGTGCG > 1/92669‑93130 | aCATAATCGTTTCCTTAATTTTTGAGTAGTAGAGTAAAAAATATCCATTTTTATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGTCGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAatat < 1:194101/250‑1 (MQ=255) ccTTAATTTTTGAGTAGTAGAGTAAAAAATATCCATTTTTATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGACGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGt < 1:529649/231‑1 (MQ=255) aaTTTTTGAGTAGTAGAGTAAAAAATATCCATTTTTATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGACGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCtgcactgcac < 1:287428/251‑1 (MQ=255) ttGAGTAGTAGAGTAAAAAATATCCATTTTTATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGACGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCTGCACTGCACAGGGc < 1:110976/251‑1 (MQ=255) gAGTAGTAGAGTAAAAAATATCCATTTTTATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGACGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTctgcac < 1:111448/239‑1 (MQ=255) 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1:629756/111‑1 (MQ=255) aGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCtgcactgcac < 1:58773/121‑1 (MQ=255) aGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCTGCACTGCACAGGGCTCAAATTGTTTAACTTAAGCTTAATTACGCTCCTCAATAATAACGAATATATTCATCGTCCGCCCGGGTTCATCATGTAGTTAAACCGGCGGGAATAAAAATATTCCGATTAAATAATGt < 1:315226/246‑1 (MQ=255) gTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCTGCACTGCACAGGGCTCAAATTGTTTAACTTAAGCTTAATTACGc < 1:784817/155‑1 (MQ=255) gAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCTGCACTGCACAGGGCTCAAATTGTTTAACtt < 1:214429/137‑1 (MQ=255) gATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCtgcactgcac < 1:42245/111‑1 (MQ=255) 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cccTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCTGCACTGCACAGGGCTCAAATTGTTTAACTTAAGCTTAATTACGCTCCTCAATAATAACGAATATATTCATCGTCCGCCCGGGTTCATCATGTAGTTAAACCGGCGGGAATAAAAATATTCCGATTAAATAATGTTTTCCTATAAAAACCTGCATTTTAATTGATTggcggc < 1:346619/218‑1 (MQ=255) cccTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCTGCACTGCACAGGGCTCAAATTGTTTAACTTAAGCTTAATTACGCTCCTCAATAATAACGAATATATTCATCGTCCGCCCGGGTTCATCATGTAGTTAAACCGGCGGGAATAAAAATATTCCGATTAAATAATGTTTTCCTATAAAAACCTGCATTTTAATTGATTGGCGGCGGCGTCCTCTTTGGGAGGGCAGATCAAAGTGCg > 1:320887/1‑251 (MQ=255) | ACATAATCGTTTCCTTAATTTTTGAGTAGTAGAGTAAAAAATATCCATTTTCATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGACGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCGGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCTGCACTGCACAGGGCTCAAATTGTTTAACTTAAGCTTAATTACGCTCCTCAATAATAACGAATATATTCATCGTCCGCCCGGGTTCATCATGTAGTTAAACCGGCGGGAATAAAAATATTCCGATTAAATAATGTTTTCCTATAAAAACCTGCATTTTAATTGATTGGCGGCGGCGTCCTCTTTGGGAGGGCAGATCAAAGTGCG > 1/92669‑93130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |