| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 92,720 | C→T | intergenic (‑48/+441) | unknown ← / ← unknown | Catalase KatE (EC 1.11.1.6)/NADP‑specific glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.4) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 92,720 | 0 | C | T | 100.0% | 92.0 / NA | 36 | intergenic (‑48/+441) | unknown/unknown | Catalase KatE (EC 1.11.1.6)/NADP‑specific glutamate dehydrogenase (EC 1.4.1.4) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (16/20); total (16/20) | |||||||||||
CGGAACCCTTGGCGTGCACCACACGCTCAGGAATGCGCTCGCGGGCAAAGTGGGCTAGTTTTTCTTGATACCAAACATCTTGTAACAGTAACGGGCCGCGGGGGCCGGCACTCATGGTGTTGTCATTATCCACCACCGGCGCGCCGGCAGCGGTAGTCAATGTGGCAGAGTTATGATCGAAAGGGCATTTTGCTGACATAATCGTTTCCTTAATTTTTGAGTAGTAGAGTAAAAAATATCCATTTTCATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGACGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCGGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCTGCACTGCACAGGGCTCAAATTGTTTA > 1/92474‑92952 | cggAACCCTTGGCGTGCACCACACGCTCAGGAATGCGCTCGCGGGCAAAGTGGGCTAGTTTTTCTTGATACCAAACATCTTGTAACAGTAACGGGCCGCGGGGGCCGGCACTCATGGTGTTGTCATTATCCACCACCGGCGCGCCGGCAGCGGTAGTCAATGTGGCAGAGTTATGATCGAAAGGGCATTTTGCTGACATAATCGTTTCCTTAATTTTTGAGTAGTAGAGTAAAAAATATCCATTTTTATgg < 1:202122/251‑1 (MQ=255) 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aaTTTTTGAGTAGTAGAGTAAAAAATATCCATTTTTATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGACGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCtgcactgcac < 1:287428/251‑1 (MQ=255) ttGAGTAGTAGAGTAAAAAATATCCATTTTTATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGACGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCTGCACTGCACAGGGc < 1:110976/251‑1 (MQ=255) gAGTAGTAGAGTAAAAAATATCCATTTTTATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGACGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTctgcac < 1:111448/239‑1 (MQ=255) gTAAAAAATATCCATTTTTATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGACGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCTGCACTGCACAGGGCTCAAATTGTTTa > 1:575162/1‑251 (MQ=255) aaaaTATCCATTTTTATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGACGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCAGATAGCTAAACCTAAGTTAAat > 1:342551/1‑211 (MQ=255) | CGGAACCCTTGGCGTGCACCACACGCTCAGGAATGCGCTCGCGGGCAAAGTGGGCTAGTTTTTCTTGATACCAAACATCTTGTAACAGTAACGGGCCGCGGGGGCCGGCACTCATGGTGTTGTCATTATCCACCACCGGCGCGCCGGCAGCGGTAGTCAATGTGGCAGAGTTATGATCGAAAGGGCATTTTGCTGACATAATCGTTTCCTTAATTTTTGAGTAGTAGAGTAAAAAATATCCATTTTCATGGATGATCGATTGACAGAAATTATAAATACCAGCAAAAAGTTCTCAATCTATTAAATTAATAATATTTGACGATTAAAAAATAACTATTAATAGTTAGAATTGATTTAATCAAGAAAAAAGAAATGAGAAAAGAAAATGATCGCACTTTGATCTGCACCCTAAAACCGGGCGGATAGCTAAACCTAAGTTAAATATTGAGCTCTGCACTGCACAGGGCTCAAATTGTTTA > 1/92474‑92952 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |