| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 10,676 | G→T | A227D (GCT→GAT) | unknown ← | LSU ribosomal protein L1p (L10Ae) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 10,676 | 0 | G | T | 100.0% | 263.1 / NA | 97 | A227D (GCT→GAT) | unknown | LSU ribosomal protein L1p (L10Ae) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (51/46); total (51/46) | |||||||||||
TGCTCCCCTACGGTCTTGGACGGGGCTTGAATGAGGTCAAGCACCAACCAGAAATGCTAAACCGCAAGTAAACTGCGGTCTAAAAGGGACATGGATTATAACGACCGAAACGGCATTTGTAAAGCCTGGTGATAAAAAATCATCAATTCGCCCGTGATAAACGTCGCAAAAAATAACCGCACTTTTACTTTTAAAAGTGCGGTTATTTTTCATTGTATTTCTACAGATTAAAGTGAAGCTTGATCAATCGCTACACCGGCACCCATCGTGGTAGAAAGGCTCACTTTCTTAATGAAGATACCTTTGGATGTTGTGGGTTTCGCTTTGGTTAAAGCGGCTAACAGCGCTTGAAGGTTTTCTTTTAATTGATCTTCGGAGAAGTTTGCTTTACCGATAGTGGTGTGGATGATACCGTTTTTATCGTTACGATAACGGATTTGACCGGATTTCGCGTTTTTAACCGCTTCGGCAACGTTTGGTG > 1/10439‑10919 | tGCTCCCCTACGGTCTTGGACGGGGCTTGAATGAGGTCAAGCACCAACCAGAAATGCTAAACCGCAAGTAAACTGCGGTCTAAAAGGGACATGGATTATAACGACCGAAACGGCATTTGTAAAGCCTGGTGATAAAAAATCATCAATTCGCCCGTGATAAACGTCGCAAAAAATAACCGCACTTTTACTTTTAAAAGTGCGGTTATTTTTCATTGTATTTCTACAGATTAAAGTGAATCTTGATCAATCGc < 1:708838/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |