| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 854,211 | A→G | P96P (CCA→CCG) | unknown → | Phage FAD/FMN‑containing dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 854,211 | 0 | A | G | 100.0% | 253.8 / NA | 88 | P96P (CCA→CCG) | unknown | Phage FAD/FMN‑containing dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (42/46); total (42/46) | |||||||||||
CCGTAAATCTGCCGGCAAACCTGCCGCAAGGCTGGTTTAATGCGGGTTTTATCGAGTGGCAGGATGACGGCGTGCGCGAGGTGCGCGCGGTCACCGTGCATCAAAATAACAAGCTGACATTAATGGGTGGCACGCAAAAGCTTTCAATCGGCACGGTCATTAAAGTCTATCCCGGTTGTGACGGACGGGCACAAACCTGTCTTAAAAAATTTAACAATATGCTTAATTTCGGCGGTATTCCACATATGCCGACCAAATCGCCGTATGACGGTTCACGCGTGTTTTAGAGGGATTTGATTATGTTTGCATCAATTGCCTGGGCAATCGTTAAAATCGTCGCCTATGCCGTTGCCAGTTATTACATCAATCGGGCGTTCGGTAAGCGCGGCAGTAACGGACCGGAGGCAGCCAGCGCCAAGGATTTTAATTTTCCGCAAATCGACGAGGGTACGCCGCAGTGTGTGTTTTTCGGCGATTGCTGGACCGAG > 1/853970‑854457 | ccGTAAATCTGCCGGCAAACCTGCCGCAAGGTTGGTTTAATGCAGGTTTTATTGAGTGGCAGGATGACGGCGTGCGCGAGGTGCGGGCAGTCACCGTGCATCAAAATAACAAGCTGACATTAATGGGTGGCACACAAAAGCTTGCAATCGGCACCGTAATTAAAGTCTATCCGGGCTGTGACGGACGGGCGCAAACCTGTCTTAAAAAATTTAACAATATGCTTAATTTCGGCGGTATTCCGCACATGcca > 1:874022/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |