| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 838,171 | A→G | L148L (TTA→TTG) | unknown → | Electron transport complex protein RnfD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 838,171 | 0 | A | G | 98.9% | 250.8 / NA | 91 | L148L (TTA→TTG) | unknown | Electron transport complex protein RnfD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (50/40); minor base T (1/0); total (51/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTACATTTCCGATTTTAGCGTGATTTTGACCGCACTTATTCTCGCCGTTGCCATCCCACCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTAGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACTCCGCTCGACAGCGCACGAACTTTCTATTCAGCCCTTTGTTCCGATTGCAGCGCCGATGTGGCATTTTACGATTTGGTGAAATTACCAATTTTTACGCAAAATGGCTGGGACCTTGCGCAAGGGTGGTGGC > 1/837937‑838415 | ttACATTTCCGATTTTAGCGTGATTTTGACCGCACTTATTCTCGCCGTTGCCATCCCACCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTTCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGAc > 1:183099/1‑249 (MQ=255) ttCCGATTTTAGCGTGATTTTGACCGCACTTATTCTCGCCGTTGCCATCCCACCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCatg < 1:97895/251‑1 (MQ=255) cGATTTTAGCGTGATTTTGACCGCACTTATTCTCGCCGTTGCCATCCCACCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCatgatg < 1:527608/251‑1 (MQ=255) aTTTTAGCGTGATTTTGACCGCACTTATTCTCGCCGTTGCCATCCCACCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTTGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCg > 1:16195/1‑251 (MQ=255) gATTTTGACCGCACTTATTCTCGCCGTTGCCATCCCACCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGa > 1:744209/1‑251 (MQ=255) cACTTATTCTCGCCGTTGCCATCCCACCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAggg > 1:467472/1‑251 (MQ=255) cACTTATTCTCGCCGTTGCCATCCCACCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAggg > 1:54646/1‑251 (MQ=255) ccTTATTCTCGCCGTTGCCATCCCACCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCTAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGc < 1:486459/250‑1 (MQ=255) aTCCCACCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAg > 1:38095/1‑251 (MQ=255) cccACCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTc < 1:387146/251‑1 (MQ=255) cccACCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTc < 1:721774/251‑1 (MQ=255) aCCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGAttt > 1:761343/1‑218 (MQ=255) ccTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGc > 1:727026/1‑250 (MQ=255) ccTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCa > 1:26664/1‑251 (MQ=255) cACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAAtt < 1:581366/250‑1 (MQ=255) ccTTACTGGGTTATTCTGATTGGTGCGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGc < 1:844999/217‑1 (MQ=255) ccTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTTCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGTTGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCTGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTaa > 1:869597/1‑250 (MQ=255) ccTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCAttgttg > 1:682887/1‑204 (MQ=255) ttACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACgg > 1:68721/1‑251 (MQ=255) ttACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACgg < 1:310399/251‑1 (MQ=255) ttACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGGTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGCGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGa > 1:832436/1‑171 (MQ=255) tACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACgg > 1:758079/1‑250 (MQ=255) gggTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCAttgttg < 1:17383/197‑1 (MQ=255) gggTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAAtt < 1:358461/241‑1 (MQ=255) gggTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATc > 1:792123/1‑250 (MQ=255) ttCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGAc < 1:44254/251‑1 (MQ=255) tCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACg < 1:470453/251‑1 (MQ=255) cTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACgg < 1:417357/251‑1 (MQ=255) tGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGc < 1:896046/251‑1 (MQ=255) gATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACgg > 1:697395/1‑213 (MQ=255) ttGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGc < 1:172310/198‑1 (MQ=255) ggTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTa > 1:59621/1‑250 (MQ=255) gTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCCGCCATGGGGGGGTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGACTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTaca > 1:367188/1‑251 (MQ=255) gTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGAt > 1:125931/1‑180 (MQ=255) gTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAAc > 1:862184/1‑225 (MQ=255) gTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTac < 1:500179/246‑1 (MQ=255) tttGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTTTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCa < 1:652445/251‑1 (MQ=255) tttGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCa < 1:417407/251‑1 (MQ=255) gtgCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAAc > 1:75404/1‑250 (MQ=255) gCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACTc > 1:686425/1‑250 (MQ=255) cAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAgg < 1:283304/243‑1 (MQ=255) gTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGGTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACTCCGc > 1:678430/1‑250 (MQ=255) 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gCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGCTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTTCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTCTCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGCTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTTCACCAATTAACGGCATTCATTGACGGCATTACACAGGCAACTCCGCCCGACAGCGCACGaa > 1:38356/1‑251 (MQ=255) cGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAAtt < 1:79499/195‑1 (MQ=255) cGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACg > 1:94616/1‑212 (MQ=255) cGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACTCCGCTCGACAGCGCACGAACtt > 1:143227/1‑251 (MQ=255) ttGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACTCCGCTCGACAGCGCACGAACTTTCTAt < 1:690401/250‑1 (MQ=255) gcggcTTGGGGCAAAATCCTTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACTCCGCTCGACAGCGCACGAACTTTCTATTc < 1:589415/250‑1 (MQ=255) gcggcTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACTCCGCTCGACAGCGCACGAACTTTCTATTc < 1:5280/250‑1 (MQ=255) 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cTATCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACTCCGCTCGACAGCGCACGAACTTTCTATTCAGCCCTTTGTACCGATTGCAGCGCCGATGTGGCATTTTACGATTTGGTGAAATTACCAATTTTTACGCAAAATGGCTGGGACCTTGCGCAAggg < 1:154216/251‑1 (MQ=255) aTCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACTCCGCTCGACAGCGCACGAACTTTCTATTCAGCCCTTTGTTCCGATTGCAg > 1:532522/1‑176 (MQ=255) tCGCATTATTGGCGGAACCGCCGGCCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACCCCGCTCGACAGCGCACGAACTTTCTATTCAGCCCTTTGTTCCGATTGCAGCGCCGATGTGGCATTTTACGATTTGGTGAAATTACCAATTTTTACGCAAAATGGCTGGGACCTTGCGCAAGggtgg < 1:504204/251‑1 (MQ=255) tCGCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACTCCGCTCGACAGCGCACGAACTTTCTATTCAGCCCTTTGTTCCGATTGCAGCGCCGATGTGGCATTTTACGATTTGGTGAAATTACCAATTTTTACGCAAAATGGCTGGGACCTTGCGCAAGggtgg > 1:823784/1‑251 (MQ=255) gCATTATTGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACTCCGCTCGACAGCGCACGAACTTTCTATTCAGCCCTTTGTTCCGATTGCAGCGCCGATGTGGCATTTTACGATTTGGTGAAATTACCAATTTTTACGCAAAATGGCTGGGAc < 1:712260/234‑1 (MQ=255) attattGGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACTCCGCTCGACAGCGCACGAACTTTCTATTCAGCCCTTTGTTCCGATTGCAGCGCCGATGTGGCATTTTACGATTTGGTGAAATTACCAATTTTTACGCAAAATGGCTGGGACCTTGCGCAAGGGTGGTGGc < 1:477840/251‑1 (MQ=255) | TTACATTTCCGATTTTAGCGTGATTTTGACCGCACTTATTCTCGCCGTTGCCATCCCACCTTACGCACCTTACTGGGTTATTCTGATTGGTACGTTTTGTGCAGTGATTCTCGGCAAGCACGTTTATGGCGGCTTGGGGCAAAATCCGTTTAATCCTGCCATGGTGGGTTATGTGGTGCTGCTCGTGTCGTTCCCGTTACAAATGACTACTTGGATGCCACCTATCGCATTATTAGCGGAACCGCCGACCTTTCATGATGCGGCATTGTTGATTTTTTCAGGGCTGACCTCCGACGGTTTTAGTCTGCACCAATTAACGGCATCCATTGACGGCATTACACAGGCAACTCCGCTCGACAGCGCACGAACTTTCTATTCAGCCCTTTGTTCCGATTGCAGCGCCGATGTGGCATTTTACGATTTGGTGAAATTACCAATTTTTACGCAAAATGGCTGGGACCTTGCGCAAGGGTGGTGGC > 1/837937‑838415 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |