| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 831,824 | G→A | intergenic (+147/+9) | unknown → / ← unknown | hypothetical protein/Malate dehydrogenase (EC 1.1.1.37) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 831,824 | 0 | G | A | 100.0% | 242.2 / NA | 89 | intergenic (+147/+9) | unknown/unknown | hypothetical protein/Malate dehydrogenase (EC 1.1.1.37) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (42/47); total (42/47) | |||||||||||
ACTAATGACAGTTTTTATCTTTATAAAATGAATATTAATTTTTTATGTCGTGTCAGAGTGGTTAATACACATAATGCTTTAATACAACCTGACTAAAATAGTAGCTTGTGCATTTTAGCCATTTCTCATATTCTACGTATTCCCAGATAGAGAAAATCCCCGTTCAAGCGGGGATTTTCTCGATAGGGAACGAAAGCAATAAAAACGCAGAAAATATTCACCGCACTTTTTATGCTATGCCCGAGGTCAGCCTATGGATTAATAAACTTCTCACCTAATTCAATATCTGCACGCAATGTCGGTAACATGGTTTCTAAAGCCTGTTGTTCCAAGGCGCTGAGTTTACCGATTGGTAGAATTTCTTCCACACCTTCCTTGCCGAAGCGAACCGGTTGTGCGAAGAAGCGGGCGTATTTGCCGTCGCCTTCCACATAGCTGCATTCTACGACGGTTTCACCTTGTAAACCGCGGACTACAGCATTAGCAAAA > 1/831582‑832070 | actaATGACAGTTTTTATCTTTATAAAATGAATATTAATTTTTTATGTCGTGTCAGAGTGGTTAATACACATAATGCTTTAATACAACCTGACTAAAATAGTAGCTTGTGCATTTTAGCCATTTCTCATATTCTACGTATTCCCAGATAGAGAAAATCCCCGTTCAAGCGGGGATTTTCTCGATAGGGAACGAAAGCAATAAAAACGCAGAAAATATTCACCGCACTTTTTATGCTATGCCCAAGGTCAg > 1:232479/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |