| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 829,113 | C→T | intergenic (‑25/‑437) | unknown ← / → unknown | Glycine cleavage system transcriptional activator GcvA/Branched‑chain amino acid aminotransferase (EC 2.6.1.42) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 829,113 | 0 | C | T | 100.0% | 58.2 / NA | 23 | intergenic (‑25/‑437) | unknown/unknown | Glycine cleavage system transcriptional activator GcvA/Branched‑chain amino acid aminotransferase (EC 2.6.1.42) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (13/10); total (13/10) | |||||||||||
TAATATCGGCATAATAGGCTTTGCCGAAATCCGTGAGTTCCAGGGCGCGGTTTTTTCGTTTAAAGAGTTCCACGCCTAAAAAATCTTCCAGCAGTTTAATTTGGTGGCTAATCGCCGCTTGGGTAACAAAAAGCTCATCCGCCGCTTTGGTGAAACTTAAAAATCTGGCAGCGGCCTCAAAGGCTTTAAGCGAGTTTAACGGTGGCAAACGCTTATACATGATAATTCCTAAATGGTTTATTTACAAATGCGGTTAATCAGATTATTTTTTTTTATAAATCCAATAAAAAAATCTCTTTTGCCCAATATTTCCATTTTGCATACAATACAACAATACTTAGTGTTTGGTACTTTCTTACTGGTTAAAGAGTTTCCAATTAAGTATGATGTTGTGTTTGCATATTGTTTGGTTGTTCCAAACGAAGTAACAAAAGTTACTATTTTATTTCCTGTATATTAGGCTTATTCGCCGGACACCGCTCCCTA > 1/828869‑829354 | tAATATCGGCATAATAGGCTTTGCCGAAATCCGTGAGTTCCAGGGCGCGGTTTTTTCGTTTAAAGAGTTCCACGCCTAAAAAATCTTCCAGCAGTTTAATTTGGTGGCTAATCGCCGCTTGGGTAACAAAAAGCTCATCCGCCGCTTTGGTGAAACTTAAAAATCTGGCAGCGGCCTCAAAGGCTTTAAGCGAGTTTAACGGTGGCAAACGCTTATACATGATAATTCCTAAATGGTTTATTTATAAATg < 1:251853/250‑1 (MQ=255) 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TAATATCGGCATAATAGGCTTTGCCGAAATCCGTGAGTTCCAGGGCGCGGTTTTTTCGTTTAAAGAGTTCCACGCCTAAAAAATCTTCCAGCAGTTTAATTTGGTGGCTAATCGCCGCTTGGGTAACAAAAAGCTCATCCGCCGCTTTGGTGAAACTTAAAAATCTGGCAGCGGCCTCAAAGGCTTTAAGCGAGTTTAACGGTGGCAAACGCTTATACATGATAATTCCTAAATGGTTTATTTACAAATGCGGTTAATCAGATTATTTTTTTTTATAAATCCAATAAAAAAATCTCTTTTGCCCAATATTTCCATTTTGCATACAATACAACAATACTTAGTGTTTGGTACTTTCTTACTGGTTAAAGAGTTTCCAATTAAGTATGATGTTGTGTTTGCATATTGTTTGGTTGTTCCAAACGAAGTAACAAAAGTTACTATTTTATTTCCTGTATATTAGGCTTATTCGCCGGACACCGCTCCCTA > 1/828869‑829354 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |