| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 824,964 | C→G | G146A (GGG→GCG) | unknown ← | Outer membrane stress sensor protease DegS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 824,964 | 0 | C | G | 100.0% | 209.8 / NA | 75 | G146A (GGG→GCG) | unknown | Outer membrane stress sensor protease DegS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (31/44); total (31/44) | |||||||||||
ATGGCAAAATTAAGACCTTCGGCAATTTCATTGGAGGTTTTACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCCCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCGTCTTTTGACATGATCACGCCCGAACCGAGGTTATTCACCTGCAAT > 1/824721‑825206 | aTGGCAAAATTAAGACCTTCGGCAATTTCATTGGAGGTTTTACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACAtc < 1:381068/251‑1 (MQ=255) aaaTTAAGACCTTCGGCAATTTCATTGGAGGTTTTACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCcac < 1:340109/251‑1 (MQ=255) aaTTAAGACCTTCGGCAATTTCATTGGAGGTTTTACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCcaca > 1:271822/1‑251 (MQ=255) aTTAAGACCTTCGGCAATTTCATTGGAGGTTTTACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACAt > 1:470662/1‑251 (MQ=255) ttAAGACCTTCGGCAATTTCATTGGAGGTTTTACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATg < 1:290945/251‑1 (MQ=255) ccTTCGGCAATTTCATTGGAGGTTTTACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCgg > 1:227878/1‑251 (MQ=255) cTTCGGCAATTTCATTGGAGGTTTTACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTCTTGTCGCCCGAGCGCCCCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCCCTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGATATACGGCTTGCCGACTGCCAGCGCCACATCTCCACCATGCACCGGa > 1:449242/1‑251 (MQ=255) tCATTGGAGGTTTTACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGAtt > 1:101100/1‑251 (MQ=255) cATTGGAGGTTTTACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGAttt > 1:315824/1‑251 (MQ=255) gAGGTTTTACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCg < 1:531594/250‑1 (MQ=255) tACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGCGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCgg > 1:433069/1‑226 (MQ=255) tACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTg > 1:126183/1‑251 (MQ=255) tCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGTCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTa < 1:481540/251‑1 (MQ=255) gTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACAt < 1:584447/196‑1 (MQ=255) gTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGAt < 1:273819/240‑1 (MQ=255) cTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCttt > 1:638581/1‑251 (MQ=255) ttCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATAc < 1:713114/249‑1 (MQ=255) ttCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATAc < 1:466021/249‑1 (MQ=255) cGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGc > 1:464488/1‑250 (MQ=255) gAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATAc < 1:736348/239‑1 (MQ=255) aTTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAAt > 1:697699/1‑204 (MQ=255) aaTCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAg < 1:290492/251‑1 (MQ=255) aaTCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAg > 1:694224/1‑251 (MQ=255) aCGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCGACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCg < 1:439324/251‑1 (MQ=255) ccGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAAt > 1:369204/1‑251 (MQ=255) cGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCAt > 1:846780/1‑250 (MQ=255) ggTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAAttttt < 1:219578/203‑1 (MQ=255) ggTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGaa < 1:802888/233‑1 (MQ=255) ggTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCa > 1:481022/1‑251 (MQ=255) gTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTgaga > 1:379283/1‑163 (MQ=255) gTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCaa > 1:616345/1‑251 (MQ=255) tAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAAt < 1:869452/172‑1 (MQ=255) tAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATc < 1:305353/214‑1 (MQ=255) aaTAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCaaaaa < 1:17742/251‑1 (MQ=255) agagGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAatat > 1:766879/1‑251 (MQ=255) agagGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAatat > 1:595953/1‑251 (MQ=255) atgaaGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGc < 1:845327/251‑1 (MQ=255) ttttGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCtactac < 1:569169/251‑1 (MQ=255) tttGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACa > 1:21149/1‑251 (MQ=255) ttGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACaa < 1:232673/251‑1 (MQ=255) tCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAAtt < 1:393915/250‑1 (MQ=255) tCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAAtt < 1:228941/250‑1 (MQ=255) ccTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATGCTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACaa < 1:419071/237‑1 (MQ=255) ccTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCaa < 1:113565/226‑1 (MQ=255) ccGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGATACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGcc < 1:442458/207‑1 (MQ=255) cgcTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAAcc < 1:834058/178‑1 (MQ=255) cTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTACCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCtactac > 1:513879/1‑221 (MQ=255) aCGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGAt > 1:385603/1‑104 (MQ=255) cGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGtgtttgtt < 1:100639/251‑1 (MQ=255) gCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATg > 1:287767/1‑168 (MQ=255) cACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAat < 1:286996/250‑1 (MQ=255) cTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACaa > 1:812345/1‑208 (MQ=255) tGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATaa > 1:153000/1‑251 (MQ=255) gATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATcc > 1:409109/1‑142 (MQ=255) gATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGtgtttgtt < 1:163263/237‑1 (MQ=255) aTAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAAc < 1:547469/250‑1 (MQ=255) tAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCg < 1:576138/251‑1 (MQ=255) ccTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCGTCtttt < 1:644304/251‑1 (MQ=255) gtgACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATa > 1:320270/1‑120 (MQ=255) cGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAAc < 1:422440/234‑1 (MQ=255) tGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCGTCTTTTGACATGATCACGcc < 1:1238/251‑1 (MQ=255) tGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCGTCTTTTGACATGATCACGcc < 1:829121/251‑1 (MQ=255) aGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAgc > 1:205095/1‑138 (MQ=255) aGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCGTCTTTTGACATGATCACGCCCGAAc > 1:284413/1‑250 (MQ=255) ggTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGtgtttgtt > 1:190932/1‑208 (MQ=255) ggTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCGTCTTTTGACATGATCACGCCCGAACCg > 1:884545/1‑251 (MQ=255) gTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATg < 1:148155/133‑1 (MQ=255) gTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAAt < 1:106012/195‑1 (MQ=255) gTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCGTCTTTTGACATGATCACGCCCGAAc < 1:197034/248‑1 (MQ=255) gTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATAATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAAt < 1:797117/195‑1 (MQ=255) aaaCGGATTGCCGATTGCCAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCGTCTTTTGACATGATCACGCCCGAACCGAgg < 1:482880/248‑1 (MQ=255) attgccgattgccAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCGTCTTTTGACATGATCACGCCCGAACCGAGGTTATTc < 1:379672/250‑1 (MQ=255) ttgccgattgccAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCGTCTTTTGACATGATCACGCCCGAACCGAGGTTATTCa < 1:415347/250‑1 (MQ=255) ttgccgattgccAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCGTCTTTTGACATGATCACGCCCGAACCGAGGTTATTCAc < 1:309200/251‑1 (MQ=255) ttgccAGCGCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCGTCTTTTGACATGATCACGCCCGAACCGAGGTTATTCACCTGCAAt < 1:366068/251‑1 (MQ=255) | ATGGCAAAATTAAGACCTTCGGCAATTTCATTGGAGGTTTTACCGATACTCAACGTGCTGATGCCCACCAGTTCGCCGGCGGAATTAATCAACGCGCCACCGGAATTCCCACGGTTAATAGAGGCGTCTGTTTGAATGAAGTTTTGTCGCCCGAGCGCCTCACCCACCGCGCTACGTCCCACCGCACTGATAATCCCCTGTGACACGCTTTGCCCCAGGTTATACGGATTGCCGATTGCCAGCCCCACATCTCCCACATGCACCGGACGGCTGAGATTTTGCGGAATCGTGGATAAATTATCCGCTTTAATTTTTAATACTGCCAAATCCGTTAAAGAATCGGAACCAATGAGCGCCGCATCAAAAATATGCCCGTTTTGCAACGCTACTACAATTTGATCGGCATTTTGAATAACGTGTTTGTTCGTCAGAATATAACCGTCTTTTGACATGATCACGCCCGAACCGAGGTTATTCACCTGCAAT > 1/824721‑825206 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |