| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 772,240 | T→G | intergenic (‑269/‑79) | unknown ← / → unknown | PTS system, ascorbate‑specific IIC component / PTS system, ascorbate‑specific IIB component (EC 2.7.1.194)/L‑ascorbate‑6‑phosphate lactonase UlaG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 772,240 | 0 | T | G | 100.0% | 22.7 / NA | 10 | intergenic (‑269/‑79) | unknown/unknown | PTS system, ascorbate‑specific IIC component / PTS system, ascorbate‑specific IIB component (EC 2.7.1.194)/L‑ascorbate‑6‑phosphate lactonase UlaG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (5/5); total (5/5) | |||||||||||
GAGTTAATATAAATATTCATGCGTAAATTTCGTTTGTTGGCGGCGGATAATAAATATTTATAATGATTTTTCAAAGATGTTTTTTGATAAAATGTGAGCAATGTCACGATTTATTTTATTGAAATACTTATGTGTGATTAGAAATTTCGAATCAAGAGTTGGCGTTGTTATCTAAGGTTAAAATGTTAGCTAAGTCTGGAATTTAATAAATTTTTAACATATTTTAATAGAAAAATTT‑AAAAAAAAATATTCCATTAATGAAAATGATTGTTTATGATTATAAATGATTAAATTATTCTACTAAACCTAAAAAAAGGAGTTATTGTATGGCTAAAGTTAATGAAATCACCCGTGAAAGTTGGATCCTTTCTACTTTTCCTGAATGGGGCACTTGGTTAAATGAAGAAATTGAGAACGAAGTTGTTCCCGAGGGCAATTTTGCCATGTGGTGGTTAGGT > 1/771993‑772450 | gagTTAATATAAATATTCATGCGTAAATTTCGTTTGTTGGCGGCGGATAATAAATATTTATAATGATTTTTCAAAGATGTTTTTTGATAAAATGTGAGCAATGTCACGATTTATTTTATTGAAATACTTATGTGTGATTAGAAATTTCGAATCAAGAGTTGGAGTTGTTATCTAAGGTTAAAATGTTAGCTAAGTCTGGAATTTAATAAATTTTTAACATATTTTAATAGAAAAATTT‑AAAAAAAAAGAtt > 1:297921/1‑251 (MQ=255) atatTCATGCGTAAATTTCGTTTGTTGGCGGCGGATAATAAATATTTATAATGATTTTTCAAAGATGTTTTTTGATAAAATGTGAGCAATGTCACGATTTATTTTATTGAAATACTTATGTGTGATTAGAAATTTCGAATCAAGAGTTGGAGTTGTTATCTAAGGTTAAAATGTTAGCTAAGTCTGGAATTTAATAAATTTTTAACATATTTTAATAGAAAAATTT‑AAAAAAAAAGATTCCATTAATGaaa > 1:795975/1‑251 (MQ=255) aTGTTTTTTGATAAAATGTGAGCAATGTCACGATTTATTTTATTGAAATACTTATGTGTGATTAGAAATTTCGAATCAAGAGTTGGAGTTGTTATCTAAGGTTAAAATGTTAGCTAAGTCTGGAATTTAATAAATTTTTAACATATTTTAATAGAAAAATTT‑AAAAAAAAAGATTCCATTAATGAAAATGATTGTTTATGATTATAAATGATTAAATTATTCTACTAAACCTAAAAAAAGGAGTTATTg < 1:413019/249‑1 (MQ=255) ttGAAATACTTATGTGTGATTAGAAATTTCGAATCAAGAGTTGGAGTTGTTATCTAAGGTTAAAATGTTAGCTAAGTCTGGAATTTAATAAATTTTTAACATATTTTAATAGAAAAATTTAAAAAAAAAAGATTCCATTAATGAAAATGATTGTTTATGATTATAAATGATTAAATTATTCTACTAAACCTAAAAAAAGGAGTTATTGTa > 1:480584/1‑210 (MQ=255) aaTACTTATGTGTGATTAGAAATTTCGAATCAAGAGTTGGAGTTGTTATCTAAGGTTAAAATGTTAGCTAAGTCTGGAATTTAATAAATTTTTAACATATTTTAATAGAAAAATTT‑AAAAAAAAAGATTCCATTAATGAAAATGATTGTTTATGATTATAAATGATTAAATTATTCTACTAAACCTAAAAAAAGGAGTTATTGTATGGCTAAAGTTAATGAAATCACCCGTGAAAGTTGGATCCTTTCTAc < 1:557669/251‑1 (MQ=255) aTCAAGAGTTGGAGTTGTTATCTAAGGTTAAAATGTTAGCTAAGTCTGGAATTTAATAAATTTTTAACATATTTTAATAGAAAAATTT‑AAAAAAAAAGATTCCATTAATGAAAATGATTGTTTATGATTATAAATGATTAAATTATTCTACTAAACCTAAAAAAAGGAGTTATTGTATGGCTAAAGTTAATGAAATCACCCGTGAAAGTTGGATCCTTTCTACTTTTCCTGAATGGGGCACTTGGTTAAAt < 1:39274/251‑1 (MQ=255) gttgttATCTAAGGTTAAAATGTTAGCTAAGTCTGGAATTTAATAAATTTTTAACATATTTTAATAGAAAAATTT‑AAAAAAAAAGATTCCATTAATGAAAATGATTGTTTATGATTATAAATGATTAAATTATTCTACTAAACCTAAAAAAAGGAGTTATTGTATGGCTAAAGTTAATGAAATCACCCGTGAAAGTTGGATCCTTTCTACTTTTCCTGAATGGGGCACTTGGTTAAATGAAGAAATTgaga > 1:394707/1‑251 (MQ=255) tAGCTAAGTCTGGAATTTAATAAATTTTTAACATATTTTAATAGAAAAATTT‑AAAAAAAAAGATTCCATTAATGAAAATGATTGTTTATGATTATAAATGATTAAATTATTCTACTAAACCTAAAAAAAGGAGTTATTGTATGGCTAAAGTTAATGAAATCACCCGTGAAAGTTGGATCCTTTCTACTTTTCCTGAATGGGGCACTTGGTTAAATGAAGAAATTGAGAACGAAGTTGTTCCCGAGGGCAAt > 1:189807/1‑251 (MQ=255) aaTTTAATAAATTTTTAACATATTTTAATAGAAAAATTT‑AAAAAAAAAGATTCCATTAATGAAAATGATTGTTTATGATTATAAATGATTAAATTATTCTACTAAACCTAAAAAAAGGAGTTATTGTATGGCTAAAGTTAATGAAATCACCCGTGAAAGTTGGATCCTTTCTACTTTTCCTGAATGGGGCACTTGGTTAAATGAAGAAATTGAGAACGAAGTTGTTCCCGAGGGCAATTTTGCCATgtgg < 1:414676/250‑1 (MQ=255) aaaTTTTTAACATATTTTAATAGAAAAATTT‑AAAAAAAAAGATTCCATTAATGAAAATGATTGTTTATGATTATAAATGATTAAATTATTCTACTAAACCTAAAAAAAGGAGTTATTGTATGGCTAAAGTTAATGAAATCACCCGTGAAAGTTGGATCCTTTCTACTTTTCCTGAATGGGGCACTTGGTTAAATGAAGAAATTGAGAACGAAGTTGTTCCCGAGGGCAATTTTGCCATGTGGTGGTTAGGt < 1:713694/251‑1 (MQ=255) | GAGTTAATATAAATATTCATGCGTAAATTTCGTTTGTTGGCGGCGGATAATAAATATTTATAATGATTTTTCAAAGATGTTTTTTGATAAAATGTGAGCAATGTCACGATTTATTTTATTGAAATACTTATGTGTGATTAGAAATTTCGAATCAAGAGTTGGCGTTGTTATCTAAGGTTAAAATGTTAGCTAAGTCTGGAATTTAATAAATTTTTAACATATTTTAATAGAAAAATTT‑AAAAAAAAATATTCCATTAATGAAAATGATTGTTTATGATTATAAATGATTAAATTATTCTACTAAACCTAAAAAAAGGAGTTATTGTATGGCTAAAGTTAATGAAATCACCCGTGAAAGTTGGATCCTTTCTACTTTTCCTGAATGGGGCACTTGGTTAAATGAAGAAATTGAGAACGAAGTTGTTCCCGAGGGCAATTTTGCCATGTGGTGGTTAGGT > 1/771993‑772450 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |