| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 766,354 | G→T | intergenic (+9/‑111) | unknown → / → unknown | UPF0324 inner membrane protein YeiH/Multimodular transpeptidase‑transglycosylase (EC 2.4.1.129) (EC 3.4.‑.‑) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 766,354 | 0 | G | T | 100.0% | 127.5 / NA | 48 | intergenic (+9/‑111) | unknown/unknown | UPF0324 inner membrane protein YeiH/Multimodular transpeptidase‑transglycosylase (EC 2.4.1.129) (EC 3.4.‑.‑) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (23/25); total (23/25) | |||||||||||
TGCGGTTGCGGTATTCAATTCTTTCAATTTATTGCCGGATTTTTTAGTGAAACTTTTAGTCGAACTGGATTCTTTGTTACTCGTTACTGCGATGGCGGCATTAGGATTAACTACACACCTCGGCGCAATTAAACAGGCAGGATTAAAACCGTTAATTCTCGGCACATTGATTTATATTTGGTTAATCGTCGGCGGATTCTTTTTGAACTATGAAGCAGCTCTCTTTTTCTCGTTGTAGAAAAGTGAGTTGGTTGTGGGTTGTTTAATTCAAAAGTAAATTATTATTTTTAATATCTTATTAAAATACATCAGGAACATACCGCACTTTTCTGAGTGCTTTTATCCATAATTGATTTTATGTCACAGATATCCCGTAAAAGTCTTTATTTTGTTCTATGCGGCTTATTGCTTACCTGCATAGGGGGGCGTTTTTTACCTCACATTCCGTTAAAACAGCG > 1/766108‑766565 | tgcggttgcggtATTCAATTCTTTCAATTTATTGCCGGATTTTTTAGTGAAACTTTTAGTCGAACTGGATTCTTTGTTACTCGTTACTGCGATGGCGGCATTAGGATTAACTACACACCTCGGCGCAATTAAACAGGCAGGATTAAAACCGTTAATTCTCGGCACATTGATTTATATTTGGTTAATCGTCGGCGGATTCTTTTTGAACTATGAAGCAGCTCTCTTTTTCTCGTTGTAGAAAAGTGAtttgg < 1:801775/251‑1 (MQ=255) 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tcGGCACATTGATTTATATTTGGTTAATCGTCGGCGGATTCTTTTTGAACTATGAAGCAGCTCTCTTTTTCTCGTTGTAGAAAAGTGATTTGGTTGTGGGTTGTTTAATTCAAAAGTAAATTATTATTTTTAATATCTTATTAAAATACATCAGGAACATACCGCACTTTTCTGAGTGCTTTTATCCATAATTGATTTTATGTCACAGATATCCCGTAAAAGTCTTTATTTTGTTCTATGCGGCTTATTGc < 1:545892/251‑1 (MQ=255) atatTTGGTTAATCGTCGGCGGATTCTTTTTGAACTATGAAGCAGCTCTCTTTTTCTCGTTGTAGAAAAGTGATTTGGTTGTGGGTTGTTTAATTc < 1:218324/96‑1 (MQ=255) atatTTGGTTAATCGTCGGCGGATTCTTTTTGAACTATGAAGCAGCTCTCTTTTTCTCGTTGTAGAAAAGTGATTTGGTTGTGGGTTGTTTAATTCAAAAGTAAATTATTATTTTTAATATCTTATTAAAATACATCAGGAACATACCGCACTTTTCTGAGTGCTTTTATCCATAATTGATTTTATGTCACAGATATCCCGTAAAAg > 1:706799/1‑207 (MQ=255) tatTTGGTTAATCGTCGGCGGATTCTTTTTGAACTATGAAGCAGCTCTCTTTTTCTCGTTGTAGAAAAGTGATTTGGTTGTGGGTTGTTTAATTCAAAAGTAAATTATTATTTTTAATATCTTATTAAAATACATCAGGAACATACCGCACTTTTCTGAGTGCTTTTATCCATAATTGATTTTATGTCACAGATATCCCGTAAAAGTCTTTATTTTGTTCTATg < 1:730281/224‑1 (MQ=255) ggTTAATCGTCGGCGGATTCTTTTTGAACTATGAAGCAGCTCTCTTTTTCTCGTTGTAGAAAAGTGATTTGGTTGTGGGTTGTTTAATTCAAAAGTAAattattatt < 1:492347/107‑1 (MQ=255) ggTTAATCGTCGGCGGATTCTTTTTGAACTATGAAGCAGCTCTCTTTTTCTCGTTGTAGAAAAGTGATTTGGTTGTGGGTTGTTTAATTCAAAAGTAAATTATTATTTTTAATATCTTATTAAAATACATCAGGAACATACCGCACTTTTCTGAGTGCTTTTATCCATAATTGATTTTATGTcac < 1:175894/185‑1 (MQ=255) ggTTAATCGTCGGCGGATTCTTTTTGAACTATGAAGCAGCTCTCTTTTTCTCGTTGTAGAAAAGTGATTTGGTTGTGGGTTGTTTAATTCAAAAGTAAATTATTATTTTTAATATCTTATTAAAATACATCAGGAACATACCGCACTTTTCTGAGTGCTTTTATCCATAATTGATTTTATGTCACAGATATCCCGTAAAAGTCTTTATTTTGTTCTATGCGGCTTATTGCTTACCTGCATAGGGGGGCGtt > 1:391287/1‑251 (MQ=255) aTCGTCGGCGGATTCTTTTTGAACTATGAAGCAGCTCTCTTTTTCTCGTTGTAGAAAAGTGATTTGGTTGTGGGTTGTTTAATTCAAAAGTAAATTATTATTTTTAATATCTTATTAAAATACATCAGGAACATACCGCACTTTTCTGAGTGCTTTTATCCATAATTGATTTTATGTCACAGATATCCCGTAAAAGTCTTTATTTTGTTCTATGCGGCTTATTGCTTACCTGCATAGGGGGGCGTTTTTTa > 1:613258/1‑251 (MQ=255) 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1:12729/60‑1 (MQ=255) gcTCTCTTTTTCTCGTTGTAGAAAAGTGATTTGGTTGTGGGTTGTTTAATTCAAAAGTAAattatt > 1:603114/1‑66 (MQ=255) ctctTTTTCTCGTTGTAGAAAAGTGATTTGGTTGTGGGTTGTTTAATTCAAAAGTAAATTATTATTTTTAATATCTTATTAAAATACATCAGGAACATACCGCACTTTTCTGAGTGCTTTTATCCATAATTGATTTTATGt < 1:2587/141‑1 (MQ=255) gTAGAAAAGTGATTTGGTTGTGGGTTGTTTAATTCAAAAGTAAATTATTATTTTTAATATCTTATTAAAATACATCAGGAACATACCGCACTTTTCTGAGTGCTTTTATCCATAATTGATTTTATGTCACAGATATCCCGTAAAAGTCTTTATTTTGTTCTATGCGGCTTATTGCTTACCTGCATAgggg > 1:362173/1‑190 (MQ=255) | TGCGGTTGCGGTATTCAATTCTTTCAATTTATTGCCGGATTTTTTAGTGAAACTTTTAGTCGAACTGGATTCTTTGTTACTCGTTACTGCGATGGCGGCATTAGGATTAACTACACACCTCGGCGCAATTAAACAGGCAGGATTAAAACCGTTAATTCTCGGCACATTGATTTATATTTGGTTAATCGTCGGCGGATTCTTTTTGAACTATGAAGCAGCTCTCTTTTTCTCGTTGTAGAAAAGTGAGTTGGTTGTGGGTTGTTTAATTCAAAAGTAAATTATTATTTTTAATATCTTATTAAAATACATCAGGAACATACCGCACTTTTCTGAGTGCTTTTATCCATAATTGATTTTATGTCACAGATATCCCGTAAAAGTCTTTATTTTGTTCTATGCGGCTTATTGCTTACCTGCATAGGGGGGCGTTTTTTACCTCACATTCCGTTAAAACAGCG > 1/766108‑766565 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |