| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 754,216 | T→C | S34S (TCT→TCC) | unknown → | Aspartate‑semialdehyde dehydrogenase (EC 1.2.1.11) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 754,216 | 0 | T | C | 100.0% | 273.7 / NA | 98 | S34S (TCT→TCC) | unknown | Aspartate‑semialdehyde dehydrogenase (EC 1.2.1.11) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (56/42); total (56/42) | |||||||||||
ATGGGTGTTGTCCGGGTCGTGATCGTAATGATGTAAGGTGAAAGGGACTTTTTGCTTTTTCAATAAGTCAATCGCCGGTGTCATTGTATTTCCTCATGATAATTCAGTAAAATGGAGCCCGTTTATTTTACTGCGGAGAGAAAAATGAGTACAAGATTAAATATCGCCCTGGTCGCCGAATTCGATTTATGCGAGAAATTGGCGGAGGCGTTGGAGCAGAGCAGTTTAGCCATTGAGACCCTGTCTGTGGTCGAACTTTTCCCTTTTAGCGAAGAACAGGGCATTCGATTCAACAACAAAAGCGTGGCGCAAATTCCGTTAGAGGAAACGGAATGGTCAGAATTTAATTATGTGTTATTTGCCGGTGAATTTGCTCATGCGACACATATTGCCAATACGGCGCAAGCGGGTTGTGTGGTGATTGATTTGAAAGGCGTGTGCGCTTCGCTAAATGATGTGCCGCTTATCGTCCCGAGCATTAACGATGAAC > 1/753971‑754460 | aTGGGTGTTGTCCGGGTCGTGATCGTAATGATGTAAGGTGAAAGGGACTTTTTGCTTTTTCAATAAGTCAATCGCCGGTGTCATTGTATTTCCTCGTGATAATTCAGTAAAATGGAGCCCGTTTATTTTACTGCGGAGAGAAAAATGAGTACAAGATTAAATATCGCCCTGGTCGCCGAATTCGATTTATGCGAGAAATTGGCGGAGGCGTTGGAGCAGAGCAGTTTAGCCATTGAGACCCTGTCCGTGGt < 1:88007/251‑1 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> 1:172463/1‑251 (MQ=255) ctcgtGATAATTCAGTAAAATGGAGCCCGTTTATTTTACTGCGGAGAGAAAAATGAGTACAAGATTAAATATCGCCCTGGTCGCCGAATTCGATTTATGCGAGAAATTGGCGGAGGCGTTGGAGCAGAGCAGTTTAGCCATTGAGACCCTGTCCGTGGTCGAACTTTTCCCTTTTAGCGAAGAACAGGGCATTCGATTCAACAACAAAAGCGTGGCGCAAATTCCGTTAGAGGAAACGGAATGGTCAGAAt < 1:550109/247‑1 (MQ=255) cgtGATAATTCAGTAAAATGGAGCCCGTTTATTTTACTGCGGAGAGAAAAATGAGTACAAGATTAAATATCGCCCTGGTCGCCGAATTCGATTTATGCGAGAAATTGGCGGAGGCGTTGGAGCAGAGCAGTTTAGCCATTGAGACCCTGTCCGTGGTCGAACTTTTCCCTTTTAGCGAAGAACAGGGCATTCGATTCAACAACAAAAGCGTGGCGCAAATTCCGTTAGAGGAAACGGaa > 1:486222/3‑239 (MQ=255) cgtGATAATTCAGTAAAATGGAGCCCGTTTATTTTACTGCGGAGAGAAAAATGAGTACAAGATTAAATATCGCCCTGGTCGCCGAATTCGATTTATGCGAGAAATTGGCGGAGGCGTTGGAGCAGAGCAGTTTAGCCATTGAGACCCTGTCCGTGGTCGAACTTTTCCCTTTTAGCGAAGAACAGGGCATTCGATTCAACAACAAAAGCGTGGCGCAAATTCCGTTAGAGGAAACGGAATGGTCAGAAttt > 1:133552/3‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |