| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 700,679 | C→T | V147V (GTC→GTT) | unknown → | Phosphoenolpyruvate‑protein phosphotransferase of PTS system (EC 2.7.3.9) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 700,679 | 0 | C | T | 100.0% | 115.0 / NA | 44 | V147V (GTC→GTT) | unknown | Phosphoenolpyruvate‑protein phosphotransferase of PTS system (EC 2.7.3.9) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (18/26); total (18/26) | |||||||||||
AGAGAAGGCGGCTATCTTTGAAGGTCATTTAATGATTTTGGAAGATGAGGAACTGGAAGAAGAAATCATTGATTACCTTCGTTCAAATCATGTCAATGCTGCAGTTGCCGCGAATGTGATTATCGATCAGCAAGTGGCGATGTTATCGGAAATTGATGATGAATATTTGAAAGAACGTGCCGGCGATATTCGCGATATTGGTAATCGTTTAATTAAAAATATTTTAGGTATGCATATCGTCGATTTAGGTGAAATTAACGAAGAAGCGATTTTGGTTGCCTATGATTTAACCCCTTCCGAAACCGCACAGTTAAATTTGGATAAAGTGTTAGGCTTTGTTACCGACATTGGTGGTCGCACCTCCCATACTTCAATTATGGCGCGCTCTTTGGAATTGCCGGCAATCGTGGGAACCAATAACGTTACCCATAAAGTGAATACCGGGGATTACCTGATCCTGGATGCGCTAAATAACGTAGTTTATGT > 1/700439‑700924 | agagAAGGCGGCTATCTTTGAAGGTCATTTAATGATTTTGGAAGATGAGGAACTGGAAGAAGAAATCATTGATTACCTTCGTTCAAATCATGTCAATGCTGCAGTTGCCGCGAATGTGATTATCGATCAGCAAGTGGCGATGTTATCGGAAATTGATGATGAATATTTGAAAGAACGTGCCGGCGATATTCGCGATATTGGTAATCGTTTAATTAAAAATATTTTAGGTATGCATATCGTTGATTTAGGTg > 1:809341/1‑251 (MQ=255) 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1:461918/1‑206 (MQ=255) cGATATTCGCGATATTGGTAATCGTTTAATTAAAAATATTTTAGGTATGCATATCGTTGATTTAGGTGAAATTAACGAAGAAGCGATTTTGGTTGCCTATGATTTAACCCCTTCCGAAACCGCACAGTTAAATTTGGATAAAGTGTTAGGCTTTGTTACCGACATTGGTGGTCGCACCTCCCATACTTCAATTATGGCGCGCTCTTTGGAATTGCCGGCAATCGTGGGAACCAATAACGTTACCCATAAAg < 1:50153/251‑1 (MQ=255) atatTGGTAATCGTTTAATTAAAAATATTTTAGGTATGCATATCGTTGATTTAGGTGAAATTAACGAAGAAGCGATTTTGGTTGCCTATGATTTAACCCCTTCCGAAACCGCACAGTTAAATTTGGATAAAGTGTTAGGCTTTGTTACCGACATTGGTGGTCGCACCTCCCATACTTCAATTATGGCGCGCTCTTTGGAATTGCCGGCAATCGTGGGAACCAATAACGTTACCCATAAAGTGAATAc > 1:540854/1‑247 (MQ=255) atTGGTAATCGTTTAATTAAAAATATTTTAGGTATGCATATCGTTGATTTAGGTGAAATTAACGAAGAAGCGATTTTGGTTGCCTATGATTTAACCCCTTCCGAAACCGCACAGTTAAAttt > 1:63408/1‑122 (MQ=255) tAATCGTTTAATTAAAAATATTTTAGGTATGCATATCGTTGATTTAGGTGAAATTAACGAAGAAGCGATTTTGGTTGCCTATGATTTAACCCCTTCCGAAACCGCACAGTTAAATTTGGATAAAGTGTTAGGCTTTGTTACCGACATTGGTGGTCGCACCTCCCATACTTCAATTATGGCGCGCTCTTTGGAATTGCCGGCAATCGTGGGAACCAATAACGTTACCCATAAAGTGAATACCGGGGATTAcc < 1:270702/251‑1 (MQ=255) 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atCGTTGATTTAGGTGAAATTAACGAAGAAGCGATTTTGGTTGCCTATGATTTAACCCCTTCCGAAACCGCACAGTTAAATTTGGATAAAGTGTTAGGCTTTGTTACCGACATTGGTGGTCGCACCTCCCATACTTCAATTATGGCGCGCTCTTTGGAATTGCCGGCAATCGTGGGAACCAATAACGTTACCCATAAAGTGAATACCGGGGATTACCTGATCCTGGATGCGCTAAATAACGTAGTTTATGt > 1:256720/1‑251 (MQ=255) tcgttgATTTAGGTGAAATTAACGAAGAAGCGATTTTGGTTGCCTATGATTTAACCCCTTCCGAAACCGCACAGTTAAATTTGGATAAAGTGTTAGGCTTTGTTACCGACATTGGTGGTCGCACCTCCCATACTTCAATTATGGCGCGCTCTTTGGAAt < 1:600465/159‑1 (MQ=255) tcgttgATTTAGGTGAAATTAACGAAGAAGCGATTTTGGTTGCCTATGATTTAACCCCTTCCGAAACCGCACAGTTAAATTTGGATAAAGTGTTAGGCTTTGTTACCGACATTGGTGGTCGCACCTCCCATACTTCAATTATGGCGCGCTCTTTGGAATTGCCGGCAATCGTGGGAACCAATAACGTTACCCATAAAGTGAATACCGGGGATTACCTGATCCTGGATGCGCTAAATAACGt > 1:157804/1‑241 (MQ=255) | AGAGAAGGCGGCTATCTTTGAAGGTCATTTAATGATTTTGGAAGATGAGGAACTGGAAGAAGAAATCATTGATTACCTTCGTTCAAATCATGTCAATGCTGCAGTTGCCGCGAATGTGATTATCGATCAGCAAGTGGCGATGTTATCGGAAATTGATGATGAATATTTGAAAGAACGTGCCGGCGATATTCGCGATATTGGTAATCGTTTAATTAAAAATATTTTAGGTATGCATATCGTCGATTTAGGTGAAATTAACGAAGAAGCGATTTTGGTTGCCTATGATTTAACCCCTTCCGAAACCGCACAGTTAAATTTGGATAAAGTGTTAGGCTTTGTTACCGACATTGGTGGTCGCACCTCCCATACTTCAATTATGGCGCGCTCTTTGGAATTGCCGGCAATCGTGGGAACCAATAACGTTACCCATAAAGTGAATACCGGGGATTACCTGATCCTGGATGCGCTAAATAACGTAGTTTATGT > 1/700439‑700924 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |