| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 698,289 | C→T | R83H (CGC→CAC) | unknown ← | 3'‑to‑5' oligoribonuclease (orn) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 698,289 | 0 | C | T | 100.0% | 144.6 / NA | 54 | R83H (CGC→CAC) | unknown | 3'‑to‑5' oligoribonuclease (orn) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (28/26); total (28/26) | |||||||||||
TCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGCTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCATGTATTTAAACAGGAAGCGTTTGTCCTGCGCAACGCTGTTGCCACAAATCGGGGAGGCGCCTTTCGGAACGTATTTTTTTAAGAAATCAAGTGTTTGTAGCTCTGCCGCGCGTTTGGTGAGTTTGCTGGCTTTAACACGTTCGATCAAGCCGTTTGCCGTGTGGGTTTTTACACACCATTCACTCATTTTATTCAGTAACGCATCGGGCTGGCGAATAGCAAGGACAGGGCCCTCGGCAAGGATGTTTAAATTTTTATCGGTCACGATGGTGGCGATTTCAATAATACGTTCTTTTTCCGGATCAAGTCCGGTCATTTCTAAATCAATCCAAATCAGATTTTGTT > 1/698049‑698523 | tCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCATGTATTTAAACAGGAAGCGTTTGTCCTGCGCAACGCTGTTGCCACAAATCGGGGAGGCGCCTTTCGGAACGTATTTTTTTAAGAAATCAAGTGTTTGTAGCTCTGCCGCGTGTTTGGTGAg < 1:142912/251‑1 (MQ=255) 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tattaAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCATGTATTTAAACAGGAAGCGTTTGTCCTGCGCAACGCTGTTGCCACAAATCGGGGAGGCGCCTTTCGGAACGTATTTTTTTAAGAAATCAAGTGTTTGTAGCTCTGCCGCGTGTTTGGTGAGTTTGCTGGCTTTAACACGTTCTATCAAg > 1:642510/1‑251 (MQ=255) tattaAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCATGTATTTAAACAGGAAGCGTTTGTCCTGCGCAACGCTGTTGCCACAAATCGGGGAGGCGCCTTTCGGAACGTATTTTTTTAAGAAATCAAGTGTTTGTAGCTCTGCCGCGTGTTTGGTGAGTTTGCTGGCTTTAACACGTTCTATCAAg > 1:508818/1‑251 (MQ=255) attaAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGTTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCATGTATTTAAACAGGAAGCGTTTGTCCTGCGCAACGCTGTTGCCACAAATCGGGGAGGCGCCTTTCGGAACGTATTTTTTTAAGAAATCAAGTGTTTGTAGCTCTGCCGCGTGTTTGGTGAGTTTGCTGGCTTTAACACGTTCTATCAAGc < 1:152943/251‑1 (MQ=255) 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gCCGCGTGTTTGGTGAGTTTGCTGGCTTTAACACGTTCTATCAAGCCGTTTGCCGTGTAGGTTTTTACACACCATTCACTCATTTTATTc > 1:573845/1‑90 (MQ=255) | TCGTCCAGCGCCAAATGCGTATTTTGCTTATTAAAGCCGTTTAAAATGTCCGGTCTCCAGCGGGCGGCAAGCTCTTTTAAGGTGCTGACGTCAAGGTGGCGATAATGAAAATAGTCGGCAAGTTCAGGCATGTATTTAAACAGGAAGCGTTTGTCCTGCGCAACGCTGTTGCCACAAATCGGGGAGGCGCCTTTCGGAACGTATTTTTTTAAGAAATCAAGTGTTTGTAGCTCTGCCGCGCGTTTGGTGAGTTTGCTGGCTTTAACACGTTCGATCAAGCCGTTTGCCGTGTGGGTTTTTACACACCATTCACTCATTTTATTCAGTAACGCATCGGGCTGGCGAATAGCAAGGACAGGGCCCTCGGCAAGGATGTTTAAATTTTTATCGGTCACGATGGTGGCGATTTCAATAATACGTTCTTTTTCCGGATCAAGTCCGGTCATTTCTAAATCAATCCAAATCAGATTTTGTT > 1/698049‑698523 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |