| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 694,699 | C→T | M208I (ATG→ATA) | unknown ← | Spermidine synthase long (EC 2.5.1.16) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 694,699 | 0 | C | T | 100.0% | 84.3 / NA | 33 | M208I (ATG→ATA) | unknown | Spermidine synthase long (EC 2.5.1.16) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (15/18); total (15/18) | |||||||||||
TAAACCGATAACAAGAATGTTTTTCGCATGAGGTGCAATAACCGGTAATAAATAAGCTCTTTCAATGCCATTATGACTGTGATTCAAATTTGTATTTAGCATACCATCATAAGCATTACCGCCGAATACGAGTTTGTCATTGTTTTCGCTTAAATATACTTGAATAAAACCGTGTTTATTTTCAATCAGTTTCTCTAATTTTAAATATTTCCCGTTTTCATCTTTTTTCTTGGCTAATGAATGAATCATATTTTCAGGTAAAACGAAGGTTATCGCTATAATAATAGTAGCTATAAGAGCGGTTGTGCTTTTTAGCCATTTTTCTTGTATACAGAATGCAGCTGTAACCAGGGTAATAAAAGTGATGATAAAATATGTTTGTTGTGTAGTAAAAATGTCAAGGAGGTAAAATCCAATTAATATCGGAGAAATTGTACATCCCAGAACATTAGCAAAATAGACATTAGAAATTGCTGCACCTGTTTTTTT > 1/694453‑694941 | tAAACCGATAACAAGAATGTTTTTCGCATGAGGTGCAATAACCGGTAATAAATAAGCTCTTTCAATGCCATTATGACTGTGATTCAAATTTGTATTTAGCATACCATCATAAGCATTACCGCCGAATACGAGTTTGTCATTGTTTTCGCTTAAATATACTTGAATAAAACCGTGTTTATTTTCAATCAGTTTCTCTAATTTTAAATATTTCCCGTTTTCATCTTTTTTCTTGGCTAATGAATGAATTatat < 1:599071/251‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |