| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 669,589 | T→A | intergenic (+50/‑116) | unknown → / → unknown | Undecaprenyl‑phosphate alpha‑N‑acetylglucosaminyl 1‑phosphate transferase (EC 2.7.8.33)/tRNA‑Arg‑CCG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 669,589 | 0 | T | A | 100.0% | 30.5 / NA | 13 | intergenic (+50/‑116) | unknown/unknown | Undecaprenyl‑phosphate alpha‑N‑acetylglucosaminyl 1‑phosphate transferase (EC 2.7.8.33)/tRNA‑Arg‑CCG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base A (4/9); total (4/9) | |||||||||||
ATATTAATGAATGGGTGATGTTTATTGCTTTCATTATTCTGTTCTTCTTATATTCTTACTCTATTACACGGGCGTGGAAAATTACCCGCTGGATACGTCGCATGAAGCGCCGTGCTGCAAGACGTTCTAAAATTAAATAGAAATTAATATTTTCATTAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAAATAATCAGATAATTTATAAATTATATTCACTTTGAAT‑AAAAAATAGCTGCTAATAAAAATTTATAAAAAAAGACTAGACAAGCACTTTTGAAACTTTTAATATACGCCCCGCAACGACGCTTCCAGCGCTCGTAGCTCAGTTGGATAGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAGGTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGAGCGCGCCAAAGGTCATGCAAATTCAGCTAATTCAATATGGTGGCTATAGCTCAGTTG > 1/669400‑669830 | atatTAATGAATGGGTGATGTTTATTGCTTTCATTATTCTGTTCTTCTTATATTCTTACTCTATTACACGGGCGTGGAAAATTACCCGCTGGATACGTCGCATGAAGCGCCGTGCTGCAAGACGTTCTAAAATTAAATAGAAATTAATATTTTCATTAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAAATAATCAGAAAATTTATAAATTATATTc < 1:417170/208‑1 (MQ=255)atatTAATGAATGGGTGATGTTTATTGCTTTCATTATTCTGTTCTTCTTATATTCTTACTCTATTACACGGGCGTGGAAAATTACCCGCTGGATACGTCGCATGAAGCGCCGTGCTGCAAGACGTTCTAAAATTAAATAGAAATTAATATTTTCATTAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAAATAATCAGAAAATTTATAAATTATATTCACTTTGAAT‑aaaaa < 1:14629/222‑1 (MQ=255)atatTAATGAATGGGCGATGTTTATTGCTTTCATTATTCTGTTCTTCTTATATTCTTACTCTATTACACGGGCGTGGAAAATTACCCGCTGGATACGTCGCATGAAGCGCCGTGCTGCAAGACGTTCTAAAATTAAATAGAAATTAATATTTTCATTAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAAATAATCAGAAAATTTATAAATTATATTCAc > 1:625478/1‑210 (MQ=255) ctctATTACACGGGCGTGGAAAATTACCCGCTGGATACGTCGCATGAAGCGCCGTGCTGCAAGACGTTCTAAAATTAAATAGAAATTAATATTTTCATTAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAAATAATCAGAAAATTTATAAATTATATTc < 1:364153/150‑1 (MQ=255) ctATTACACGGGCGTGGAAAATTACCCGCTGGATACGTCGCATGAAGCGCCGTGCTGCAAGACGTTCTAAAATTAAATAGAAATTAATATTTTCATTAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAAATAATCAGAAAATTTATAAATTATATTCACTTTGAATAAAAAAATAGCTGCTAATAAAAATTTATAAAAAAAGACTAGACAAGCACTTTTGAAACTTTTAATATACGCCCCGCAacgac < 1:463586/239‑1 (MQ=255) ctATTACACGGGCGTGGAAAATTACCCGCTGGATACGTCGCATGAAGCGCCGTGCTGCAAGACGTTCTAAAATTAAATAGAAATTAATATTTTCATTAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAAATAATCAGAAAATTTATAAATTATATTCACTTTGAATAAAAAAATAGCTGCTAATAAAAATTTATAAAAAAAGACTAGACAAGCACTTTTGAAACTTTTAATATACGCCCCGCAACGACGCTTCCAgcg > 1:483895/1‑249 (MQ=255) ctATTACACGGGCGTGGAAAATTACCCGCTGGATACGTCGCATGAAGCGCCGTGCTGCAAGACGTTCTAAAATTAAATAGAAATTAATATTTTCATTAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAAATAATCAGAAAATTTATAAATTATATTCACTTTGAATAAAAAAATAGCTGCTAATAAAAATTTATAAAAAAAGACTAGACAAGCACTTTTGAAACTTTTAATATACGCCCCGCAACGACGCTTCCAgcg > 1:700944/1‑249 (MQ=255) cacGGGCGTGGAAAATTACCCGCTGGATACGTCGCATGAAGCGCCGTGCTGCAAGACGTTCTAAAATTAAATAGAAATTAATATTTTCATTAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAAATAATCAGAAAATTTATAAATTATATTCACTTTGAATAAAAAAATAGCTGCTAATAAAAATTTATAAAAAAAGACTAGACAAGCACTTTTGAAACTTTTAATATACGCCCCGCAACGACGCTTCCAGCGCTCGTAGc < 1:818525/251‑1 (MQ=255) tGGAAAATTACCCGCTGGATACGTCGCATGAAGCGCCGTGCTGCAAGACGTTCTAAAATTAAATAGAAATTAATATTTTCATTAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAAATAATCAGAAAATTTATAAATTATATTCACTTTGAATAAAAAAATAGCTGCTAATAAAAATTTATAAAAAAAGACTAGACAAGCACTTTTGAAACTTTTAATATACGCCCCGCAACGACGCTTCCAGCGCTCGTAGCTCAGTTg < 1:520762/250‑1 (MQ=255) ctgcAAGACGTTCTAAAATTAAATAGAAATTAATATTTTCATTAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAAATAATCAGAAAATTTATAAATTATATTCACTTTGAATAAAAAAATAGCTGCTAATAAAAATTTATAAAAAAAGACTAGACAAGCACTTTTGAAACTTTTAATATACGCCCCGCAACGACGCTTCCAGCGCTCGTAGCTCAGTTGGATAGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAGGTCGCAGGTTCaa > 1:417979/1‑251 (MQ=255) cAAGACGTTCTAAAATTAAATAGAAATTAATATTTTCATTAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAAATAATCAGAAAATTTATAAATTATATTCACTTTGAATAAAAAAATAGCTGCTAATAAAAATTTATAAAAAAAGACTAGACAAGCACTTTTGAAACTTTTAATATACGCCCCGCAACGACGCTTCCAGCGCTCGTAGCTCAGTTGGATAGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAGGTCGCAGGTTCAAATc < 1:390917/251‑1 (MQ=255) ttAAAATTAAATAAAAAATAATCAGAAAATTTATAAATTATATTCACTTTGAATAAAAAAATAGCTGCTAATAAAAATTTATAAAAAAAGACTAGACAAGCACTTTTGAAACTTTTAATATACGCCCCGCAACGACGCTTCCAGCGCTCGTAGCTCAGTTGGATAGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAGGTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGAGCGCGCCAAAGGTCATGCAAATTCAGCTAATTCAatat < 1:757450/250‑1 (MQ=255) taatCAGAAAATTTATAAATTATATTCACTTTGAATAAAAAAATAGCTGCTAATAAAAATTTATAAAAAAAGACTAGACAAGCACTTTTGAAACTTTTAATATACGCCCCGCAACGACGCTTCCAGCGCTCGTAGCTCAGTTGGATAGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAGGTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGAGCGCGCCAAAGGTCATGCAAATTCAGCTAATTCAATATGGTGGCTATAGCTCAGTTg < 1:542419/251‑1 (MQ=255) | ATATTAATGAATGGGTGATGTTTATTGCTTTCATTATTCTGTTCTTCTTATATTCTTACTCTATTACACGGGCGTGGAAAATTACCCGCTGGATACGTCGCATGAAGCGCCGTGCTGCAAGACGTTCTAAAATTAAATAGAAATTAATATTTTCATTAAAAAGTTAAAATTAAATAAAAAATAATCAGATAATTTATAAATTATATTCACTTTGAAT‑AAAAAATAGCTGCTAATAAAAATTTATAAAAAAAGACTAGACAAGCACTTTTGAAACTTTTAATATACGCCCCGCAACGACGCTTCCAGCGCTCGTAGCTCAGTTGGATAGAGCGTTGGCCTCCGGAGCCAAAGGTCGCAGGTTCAAATCCTGTCGAGCGCGCCAAAGGTCATGCAAATTCAGCTAATTCAATATGGTGGCTATAGCTCAGTTG > 1/669400‑669830 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |