| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 662,958 | A→G | I29I (ATT→ATC) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 662,958 | 0 | A | G | 100.0% | 279.2 / NA | 100 | I29I (ATT→ATC) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (50/50); total (50/50) | |||||||||||
TCCAAGATCTTTTCGGCTTTGTCGGTTGCTGTTCGGTGGAGGAGTTGTGATCTTGTGTCTTTGCCATGTGCGTTACCGTTCGGGCTGAGTTGTAATTAAGGGCGGATGAAAGCTAAGTAAGGGTGCAGAAAACGGGCGAAATTTTCAATGCTGCAAAAGGCAATGATTGTGGCGTTACAATAAAACCTATCTCTTCTAATTCCGTTTGTGATCGATTTAACTGTGGATCCGACCGCACTTCAATGTTAAACCGATTAGCGAAAACGCTATATTCCATGGAACGCTTGGTGATGATATTGCCTTGATAGGCGGTGAATTGAAAATCCATGTCAGATACTGAAGGAAGAACCGCAACCGCAAGTGGAGGTGGCGTTTGGGTTGTTTACGACAAAACGTGAACCTTCCAAACCTTCGGTGTAATCAACGGTGCCGCCGATTAAATATTGTAAGCTCATTGGATCAATGACTAATTGTACGCCCGAATTTT > 1/662717‑663203 | tCCAAGATCTTTTCGGCTTTGTCGGTTGCTGTTCGGTGGAGGAGTTGTGATCTTGTGTCTTTGCCATGTGCGTTACCGTTCGGGCTGAGTTGTAATTAAGGGCGGATGAAAGCTAAGTAAGGGTGCAGAAAACGGGCGAAATTTTCAATGCTGCAAAAGGCAATGATTGTGGCGTTACAATAAAACCTATCTCTTCTAATTCCGTTTGTGATCGATTTAACTGTGGATCCGACCGCACTTCGATGTTAAAc < 1:218480/251‑1 (MQ=255) tCTTTTCGGCTTTGTCGGTTGCTGTTCGGTGGAGGAGTTGTGATCTTGTGTCTTTGCCATGTGCGTTACCGTTCGGGCTGAGTTGTAATTAAGGGCGGATGAAAGCTAAGTAAGGGTGCAGAAAACGGGCGAAATTTTCAATGCTGCAAAAGGCAATGATTGTGGCGTTACAATAAAACCTATCTCTTCTAATTCCGTTTGTGATCGATTTAACTGTGGATCCGACCGCACTTCGATGTTAAACCGATTAg > 1:744424/1‑251 (MQ=255) cTTTTCGGCTTTGTCGGTTGCTGTTCGGTGGAGGAGTTGTGATCTTGTGTCTTTGCCATGTGCGTTACCGTTCGGGCTGAGTTGTAATTAAGGGCGGATGAAAGCTAAGTAAGGGTGCAGAAAACGGGCGAAATTTTCAATGCTGCAAAAGGCAATGATTGTGGCGTTACAATAAAACCTATCTCTTCTAATTCCGTTTGTGATCGATTTAACTGTGGATCCGACCGCACTTCGATGTTAAACCGATTAg > 1:542768/1‑250 (MQ=255) gCTTTGTCGGTTGCTGTTCGGTGGAGGAGTTGTGATCTTGTGTCTTTGCCATGTGCGTTACCGTTCGGGCTGAGTTGTAATTAAGGGCGGATGAAAGCTAAGTAAGGGTGCAGAAAACGGGCGAAATTTTCAATGCTGCAAAAGGCAATGATTGTGGCGTTACAATAAAACCTATCTCTTCTAATTCCGTTTGTGATCGATTTAACTGTGGATCCGACCGCACTTCGATGTTAAACCGATTAGCGAAAACg > 1:579002/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |