| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 653,674 | C→T | V355M (GTG→ATG) | unknown ← | Fe2+ ABC transporter, permease protein 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 653,674 | 0 | C | T | 98.2% | 124.5 / NA | 54 | V355M (GTG→ATG) | unknown | Fe2+ ABC transporter, permease protein 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (21/32); total (22/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTCCAAGCCGGTGAGAATGTTCATTAAGGTGGTTTTCCCCGAGCCGGAAGCGCCCATGATGGCAACAAATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCACTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCGCGCCGATTTGTTTGATGATGTCCCGGCTTTTCGCGCCGAGGGCTTTTTGCAACGCGAATTCTTTTGCCCGTTCGCCCACGATGGCGATGAGAGT > 1/653431‑653917 | gtCCAAGCCGGTGAGAATGTTCATTAAGGTGGTTTTCCCCGAGCCGGAAGCGCCCATGATGGCAACAAATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAATGCGCTGCGGGGCGGGACGCAAACAGCGATAAACGCCACttataaa > 1:509357/1‑250 (MQ=255)gtCCAAGCCGGTGAGAATGTTCATTAAGGTGGTTTTCCCCGAGCCGGAAGCGCCCATGATGGCAACAAATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGGCGGGACGATAACTGCGGTAAAAGCCCTtaataaa > 1:544800/1‑250 (MQ=255) cGGTGAGAATGTTCATTAAGGTGGTTTTCCCCGAGCCGGAAGCGCCCATGATGGCAACAAATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATcc < 1:463408/251‑1 (MQ=255) aaTGTTCATTAAGGTGGTTTTCCCCGAGCCGGAAGCGCCCATGATGGCAACAAATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATgg < 1:494001/249‑1 (MQ=255) aaTGTTCATTAAGGTGGTTTTCCCCGAGCCGGAAGCGCCCATGATGGCAACAAATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATgg < 1:298874/249‑1 (MQ=255) cATTAAGGTGGTTTTCCCCGAGCCGGAAGCGCCCATGATGGCAACAAATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGc < 1:56528/251‑1 (MQ=255) cATTAAGGTGGTTTTCCCCGAGCCGGAAGCGCCCATGATGGCAACAAATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGc < 1:216370/251‑1 (MQ=255) ttttCCCCGAGCCGGAAGCGCCCATGATGGCAACAAATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCa < 1:128602/250‑1 (MQ=255) tCCCCGAGCCGGAAGCGCCCATGATGGCAACAAATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGgcg < 1:856280/251‑1 (MQ=255) aGCCGGAAGCGCCCATGATGGCAACAAATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGGACGATAAATGCGATAAAAGCCATTAATAAAGATAAACCGATgg > 1:599477/1‑223 (MQ=255) gatgGCAACAAATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTTTATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGGCGGTACGATCAATGCGATAAACGCCATTAATAAAGATAAACCGATGGGGATCGGGAACACCGGGAGGGGCAAGTCGATGTAGGCTTTGaaa > 1:423796/1‑250 (MQ=255) aacaaATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGGAAGATAAACGCGGTAAAAGCCATTTAAAAAGATAATCCGATGGGGATAGGCAAAAAAGGCAGGGGCATggccttgctctttttcacatttcc > 1:835973/1‑227 (MQ=255) ccccTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGGACGATAACTGCGATAAAAGCCCTTAATAAGGATAAACCGATGGGGATCGGCAACACCCGCAGGGGCAAGTCGATGTAGGGTTTGAAAAC‑GGGTAAACCggg > 1:166866/1‑249 (MQ=255) gAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGAt < 1:787930/168‑1 (MQ=255) cTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGa < 1:12131/155‑1 (MQ=255) tGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGc < 1:717890/249‑1 (MQ=255) cTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTgatgat < 1:712312/251‑1 (MQ=255) gCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGGCGGGACGATAACTGCGATAAAAGCCCTTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAacttcagcaacaatatcc > 1:38620/1‑159 (MQ=255) cccGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTa < 1:389064/234‑1 (MQ=255) cccGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGGCGGTACGATAAATGCGATAAAAGCCATTAATAAAGATAATCCGATGGGGATCGGCAACACCCGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTTAAGAA‑GGGTAAACCGAGTACTTGCGCCCGTAAAAAACCGATAAATAAACCGCTGGTGATcgcg > 1:684768/1‑251 (MQ=255) cccGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGGCGGGACGATAACTGCGATAAAAGCCCTTAATAAGGATAATCCGATGGGGGTCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGGAGGCCTTGAAGAC‑GGGTAAGCCGGGGACTTGCGCCAGGAAATAACCCATAAATAAACCGCTGATGAAcgcg > 1:584518/1‑251 (MQ=255) gttttATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACGCATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGAt < 1:18140/129‑1 (MQ=255) tataAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGAt < 1:185992/124‑1 (MQ=255) taAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAAtt < 1:206108/251‑1 (MQ=255) gtgtTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAg < 1:441652/168‑1 (MQ=255) cGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGGCGGGACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAAACCGATGGGGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGGTAAACCGAGGACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACgg > 1:761608/1‑223 (MQ=255) gTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAAAGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGGGATCGGCAACAACGGCAGGGGCATGTCGATGTAGGCTTTTAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCCGGAAATAACCGATAATTAAACCGCTGATGAACGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGAtttgtt > 1:159033/1‑251 (MQ=255) gTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGGACGATAACTGCGATAAAAGCCCTTAATAAGGATAAACCGATGGGGGTCGGCAACACCCGCAGGCGCATGTCGGTGTAGGGTTTGGAGACGGGTTAA‑CCCAGGACCTGCGCCCGTAAATAAACGATAATTAAACCGCTGGTGATCGCGCATACGGCGGTAAATTAGGGTTCCTCGCCGAtttgtt > 1:11922/1‑251 (MQ=255) gTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGGCGGGACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGGGATCGGCAACACCGGCAGGCGCCTGTCGATGTAGGCTTTGAAGa > 1:291218/1‑155 (MQ=255) tttAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGAtttgtttg < 1:588043/251‑1 (MQ=255) ccATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGATTTGTTtgatga < 1:482525/250‑1 (MQ=255) ccATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGATTTGTTtgatga < 1:472284/250‑1 (MQ=255) aTGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGtt < 1:58298/226‑1 (MQ=255) aTGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGGCGGTACGATAAATGCGATAAAAGCCATTAATAAGGATAATCCGGTGGGGGTCGGCAACACCGGCAGGCGCCTGTCGAAGTAGGCTTTTAAGAC‑GGTTTAACCGAGTACTTGCGCCCGGAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCCTACGGCGATAATTAAGGGTTCCTCGCCGATTTGTTTGATGATGt > 1:689238/1‑251 (MQ=255) gTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGGCGGGACGATAACTTCGGTAAACGCCCTTTATAAGGATAAACCGGTGGGGATCGGCAACACCGGCAGGCGCCTGTCGGTGGAGGCTTTGAAGAC‑GGGTAAGCCCAGGACTTGCGCCCGGAAATAAACGATAATTAAGCCGCCGATGATCGCGCATACGGCGATAAt > 1:776482/1‑217 (MQ=255) ttATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGa < 1:463792/87‑1 (MQ=255) ccTTTTAACACATTGGCGGTTCGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTgatgat < 1:425267/191‑1 (MQ=255) cacaTTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAAAGCCCTTAATAAGGATAATCCGATGGGGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGGAAATAAACGATAATTAAACCGCTGATGATCGCGCCTACGGCGATAATTAAGGGTTCCTCGCCGATTTGTTTGATGATGTCCCGGGTTTTTGCGCCgg > 1:596508/1‑250 (MQ=255) gTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGGACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGATTTGTTTGATGATGTCCCGGCTTTTCGCGCCGAGGGCTTTTTg > 1:456566/1‑251 (MQ=255) gTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATgg > 1:403555/1‑65 (MQ=255) gTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACgg < 1:560225/176‑1 (MQ=255) gTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACgg < 1:629364/176‑1 (MQ=255) cgcgGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGATTTGTTTGATGATGTCCCGGCTTTTCGCGCCGAGGGCTTTTTGCAACGCGAATTCtttt < 1:25242/251‑1 (MQ=255) gcggGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGATTTGTTTGATGATGTCCCGGCTTTTCGCGCCGAGGGCTTTTTGCAACGCGAATTCTTTTGcc < 1:296809/250‑1 (MQ=255) cggGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGATTTGTTTGATGATGTCCCGGCTTTTCGCGCCGAGGGCTTTTTGCAACGCGAATTCTTTTGCCCg < 1:392131/251‑1 (MQ=255) ggTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGATTTGTTTGATGATGTCCCGGCTTTTCGCGCCGAGGGCTTTTTGCAACGCGAATTCTTTTGCCCGtt > 1:577338/1‑251 (MQ=255) cGGTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGc > 1:449869/1‑101 (MQ=255) gTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGATTTGTTTGATGATGTCCCGGCTTTTCGCGCCGAGGGCTTTTTGCAACGCGAATTCTTTTGCCCGTTCGcc > 1:524989/1‑250 (MQ=255) gTACGATAACTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTAAAGAC‑GGTTAAGCCg < 1:607358/101‑1 (MQ=255) cTGCGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAgg > 1:850144/1‑159 (MQ=255) cGATAAACGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGATTTGTTTGATGATGTCCCGGCTTTTCGCGCCGAGGGCTTTTTGCAACGCGAATTCTTTTGCCCGTTCGCCCACGATGGCGATg < 1:899857/251‑1 (MQ=255) aaaCGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGATTTGTTTGATGATGTCCCGGCTTTTCGCGCCGAGGGCTTTTTGCAACGCGAATTCTTTTGCCCGTTCGCCCACGATGGCGATGagag < 1:815354/251‑1 (MQ=255) aaCGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGATTTGTTTGATGATGTCCCGGCTTTTCGCGCCGAGGGCTTTTTGCAACGCGAATTCTTTTGCCCGTTCGCCCACGATGGCGATGAGAgt < 1:664460/251‑1 (MQ=255) aaCGCCATTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCTCGCCGATTTGTTTGATGATGTCCCGGCTTTTCGCGCCGAGGGCTTTTTGCAACGCGAATTCTTTTGCCCGTTCGCCCACGATGGCGATGAGAgt < 1:391954/251‑1 (MQ=255) | GTCCAAGCCGGTGAGAATGTTCATTAAGGTGGTTTTCCCCGAGCCGGAAGCGCCCATGATGGCAACAAATTCCCCTTCGGCAATTTGAATATTAATGTCTTCAAGTGCGGTCACTTGCCCGAATCTTTTATATAAATGCTGTGTTTCAATCACGGTTTTAGCCATGTTATTCCCCTTTTAACACATTGGCGGTTTGAATGTCTAAGGCGCGGCGGGTCGGTACGATAACTGCGATAAACGCCACTAATAAGGATAATCCGATGGTGATCGGCAACACCGGCAGGCGCATGTCGATGTAGGCTTTGAAGAC‑GGTTAAGCCGAGTACTTGCGCCAGTAAATAACCGATAATTAAGCCGCTGATGATCGCGCATACGGCGATAATTAAGGTTTCCGCGCCGATTTGTTTGATGATGTCCCGGCTTTTCGCGCCGAGGGCTTTTTGCAACGCGAATTCTTTTGCCCGTTCGCCCACGATGGCGATGAGAGT > 1/653431‑653917 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |