| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 629,609 | A→G | R155R (CGT→CGC) | unknown ← | TRAP‑type transport system, periplasmic component, predicted N‑acetylneuraminate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 629,609 | 0 | A | G | 100.0% | 257.6 / NA | 95 | R155R (CGT→CGC) | unknown | TRAP‑type transport system, periplasmic component, predicted N‑acetylneuraminate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (45/50); total (45/50) | |||||||||||
AAGTTGGTCGTTCAGAATGTGGTTGGTTATCGCCAAGTATTTTTGCACCTCATAGAATTTTTGCGCCTGCACGGTTGCCAACGGGTTTTCCTGACCGTCCACGGAATTGGTTTGTAGTGCTAAATACACTTCGGAGAATGCCATCGGTGTTGGAGACGCGCCCACATATTTGGCGTAAGCCAGATTGGTTGCGGCATTCGGTACGCGCAGTTTCAAGCCTTTCATATCGGCAATGCCGTTGATGGCACGGTTTGAAGTGGTTTGGCGAGTGCCGTTATAGGCTTGGGATAACAAGGTTAAGCCCAATTCTTTGTTCATTTTTTGGATTAAATCTTTACCGAATGCGGTGTCATGTAACGCCTTTTGTGCCACTTCATAATTGGTGATCACATAAGGCAGGGCAAATACCGCCGCTTCAGGATAGAACAATTGGAAACGGGCGGATTCCGCAAAGGTGAAGTCCAATGCGCCGTCTTTTAATTGCTTTAACA > 1/629363‑629853 | aaGTTGGTCGTTCAGAATGTGGTTGGTTATCGCCAAGTATTTTTGCACCTCATAGAATTTTTGCGCCTGCACGGTTGCCAACGGGTTTTCCTGACCGTCCACGGAATTGGTTTGTAGTGCTAAATACACTTCGGAGAATGCCATCGGTGTTGGAGACGCGCCCACATATTTGGCGTAAGCCAGATTGGTTGCGGCACTCGGTACGCGCAGTTTCAAGCCTTTCATATCGGCAATGCCGTTGATGGCGCGGt < 1:843851/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |